MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1186/s12879-020-05172-7

Медицинская библиотека · BMC infectious diseases · 2020

Эпидемиологическое и генетическое разнообразие циркулирующих вирусов денге в Медельине, Колумбия: исследование по изучению лихорадки.

Lim Jacqueline Kyungah, Carabali Mabel, Camacho Erwin, Velez Diana Carolina, Trujillo Andrea, Egurrola Jorge, Lee Kang-Sung, Velez Ivan Dario, Osorio Jorge E

СтатьяМашинный перевод · не проверен

Аннотация

В Колумбии одной из серьезных проблем в области общественного здравоохранения является лихорадка Денге. Для оценки клинической, эпидемиологической и молекулярной структуры денге перед эпидемиями Чикунгуньи и Зики было проведено исследование по наблюдению за лихорадкой.

МЕТОДЫ

В ноябре 2011 года по февраль 2014 года в больнице Санта-Крус, Медельин, было проведено пассивное наблюдение на базе медицинских учреждений, и в них были зачислены имеющие на это право пациенты женского пола в возрасте от 1 до 65 лет. Острые и выздоравливающие пробы крови были собраны на 10-21 день отдельно друг от друга и исследованы на денге с использованием ИгМ/ИГ ЭЛИСА. РНК была извлечена для серотипирования с использованием RT-PCR на острых образцах, и генотифицирование осуществлялось по последовательности.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Из 537 больных желудочно-кишечных заболеваний, зачисленных в течение учебного периода, 29% (n = 155) были признаны ВИЧ-инфицированными. Лишь 7% случаев заболевания денге были госпитализированы, однако вероятность госпитализации пациентов с положительной реакцией на денге была в 2,6 раза выше по сравнению с другими случаями, обусловленными логистической регрессией. Из тех, которые были испытаны с помощью RT-PCR (n = 173), 17 были подтверждены денге на основе ПЦР и/или вирусной изоляции, в основном DENV-3 (n = 9) и DENV-4 (n = 7) с 1 DENV-1. Результаты генотипа показали, что DENV-1 изолирует генотип V или американский/африканский генотип; DENV-3 изолирует генотип III; и DENV-4 относится к генотипу II и, в частности, к субгенотипу IIb.

ВЫВОДЫ

Наше наблюдение документально зафиксировало значительное бремя денге в Санта-Крус-Комуне в неэпидемические годы, а генетическое разнообразие циркулирующих ДЕНВ изолировало их до эпидемии Чикунгунья в 2014 году и эпидемии Зика в 2015 году. Результаты нашего исследования подчеркивают необходимость постоянного наблюдения и мониторинга денге и других арбовирусов и служат в качестве базы эпидемиологических и молекулярных данных для будущих исследований в целях оценки изменений в передаче ДЕНВ в Медельине с учетом возникающих и вновь возникающих в регионе арбовирусных заболеваний.

Для цитирования: Lim Jacqueline Kyungah, Carabali Mabel, Camacho Erwin, Velez Diana Carolina, Trujillo Andrea, Egurrola Jorge, Lee Kang-Sung, Velez Ivan Dario, Osorio Jorge E. Epidemiology and genetic diversity of circulating dengue viruses in Medellin, Colombia: a fever surveillance study.. BMC infectious diseases. 2020. DOI: 10.1186/s12879-020-05172-7.
Название и аннотация на языке оригинала

Epidemiology and genetic diversity of circulating dengue viruses in Medellin, Colombia: a fever surveillance study.

BACKGROUND

Dengue fever is a major public health problem in Colombia. A fever surveillance study was conducted for evaluation of the clinical, epidemiological, and molecular patterns of dengue, prior to Chikungunya and Zika epidemics.

METHODS

In November 2011-February 2014, a passive facility-based surveillance was implemented in Santa Cruz Hospital, Medellin, and enrolled eligible febrile patients between 1 and 65 years-of-age. Acute and convalescent blood samples were collected 10-21 days apart and tested for dengue using IgM/IgG ELISA. RNA was extracted for serotyping using RT-PCR on acute samples and genotyping was performed by sequencing.

RESULTS

Among 537 febrile patients enrolled during the study period, 29% (n = 155) were identified to be dengue-positive. Only 7% of dengue cases were hospitalized, but dengue-positive patients were 2.6 times more likely to be hospitalized, compared to non-dengue cases, based on a logistic regression. From those tested with RT-PCR (n = 173), 17 were dengue-confirmed based on PCR and/or virus isolation showing mostly DENV-3 (n = 9) and DENV-4 (n = 7) with 1 DENV-1. Genotyping results showed that: DENV-1 isolate belongs to the genotype V or American/African genotype; DENV-3 isolates belong to genotype III; and DENV-4 isolates belong to the II genotype and specifically to the IIb sub-genotype or linage.

CONCLUSIONS

Our surveillance documented considerable dengue burden in Santa Cruz comuna during non-epidemic years, and genetic diversity of circulating DENV isolates, captured prior to Chikungunya epidemic in 2014 and Zika epidemic in 2015. Our study findings underscore the need for continued surveillance and monitoring of dengue and other arboviruses and serve as epidemiological and molecular evidence base for future studies to assess changes in DENV transmission in Medellin, given emerging and re-emerging arboviral diseases in the region.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.