Microbial genomics · 2026
Towards accurate genomic detection of fungal antimicrobial resistance: progress in fungal resistance databases and bioinformatic tools.
СтатьяОбзорНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gador-Whyte Andrew P, Rhodes Johanna, Farrer Rhys A, Bakker Sibbe L, Wirth Wytamma, Coldbeck-Shackley Rosa C, Howden Benjamin P, Kwong Jason C, Sherry Norelle L, Seemann Torsten
Аннотация
Fungal antimicrobial resistance (fAMR) is increasing worldwide and is recognized as a global health priority by the World Health Organization. The emergence of Candidozyma (Candida) auris and other resistant fungal pathogens presents a risk to critically ill patients. Whole-genome sequencing has the potential to improve public health and clinical surveillance for fAMR and could enable more rapid detection. In this review, we discuss the mechanisms of fAMR and the strengths and limitations of the currently available databases and bioinformatic tools for the detection of fAMR from genomic data. We identify current gaps, preferred characteristics of genomic fAMR databases and tools and future directions for development to enable validated fAMR prediction in the public health context.