MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.tmaid.2024.102698
Динамика вирусного рассеивания ДНК и вирусного позитива ДНК в различных клинических образцах, собранных во время вспышки мпокса 2022 года в Ломбарди, Италия.
Аннотация
В последнее время вирус Mpox (MPXV) распространился за пределами Африки к югу от Сахары. Это большое многоцентральное исследование было проведено в Ломбарди, наиболее густонаселённом итальянском регионе, на долю которого приходится более 40% итальянских дел. Цель настоящего исследования состоит в том, чтобы: i) оценить присутствие и продолжительность просачивания ДНК MPXV в различных отсеках тела, соотносящих жизнеспособность MPXV со временем начала симптомов; ii) представить доказательства стойкости MPXV в различных отсеках тела в качестве источника инфекции и iii) охарактеризовать эволюцию MPXV по всей последовательности генома (WGS) во время вспышки заболевания в Италии.В исследовании приняли участие 353 пациента с лабораторным диагнозом инфекции MPXV, который был проверен в нескольких клинических образцах в период с 24 мая по 1 сентября 2022 года. Вирусная изоляция была предпринята из различных биологических матриц, и полная последовательность генома была произведена по 61 штамму MPXV.
Результаты
обнаружение ДНК на основе MPXV было более частым в коже (94,4%) при самом длительном среднем времени обнаружения вирусов (16 дней). Активно воспроизводящийся вирус в клеточной культуре был получен для 123/377 (32,6%) образцов с значительно более высоким вирусным количеством в изолированных положительных образцах (20 против 31, p < 0,001). Филогенетический анализ выявил высокую генетическую идентичность собранных штаммов MPXV как в глобальном масштабе, так и в районе Ломбардии.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Повреждение кожи представляет собой стандартный золотой материал, и высокая вирусная нагрузка, а активно повторяющийся вирус, наблюдаемый на гениталиях, подтверждает, что сексуальный контакт играет ключевую роль в вирусной передаче.
Название и аннотация на языке оригинала
Dynamics of viral DNA shedding and culture viral DNA positivity in different clinical samples collected during the 2022 mpox outbreak in Lombardy, Italy.
BACKGROUND
Mpox virus (MPXV) has recently spread outside of sub-Saharan Africa. This large multicentre study was conducted in Lombardy, the most densely populated Italian region accounting for more than 40% of Italian cases. The present study aims to: i) evaluate the presence and the shedding duration of MPXV DNA in different body compartments correlating the MPXV viability with the time to onset of symptoms; ii) provide evidence of MPXV persistence in different body compartment as a source of infection and iii) characterize the MPXV evolution by whole genome sequencing (WGS) during the outbreak occurred in Italy.
MATERIAL AND
METHODS
The study included 353 patients with a laboratory-confirmed diagnosis of MPXV infection screened in several clinical specimens in the period May 24th - September 1st, 2022. Viral isolation was attempted from different biological matrices and complete genome sequencing was performed for 61 MPXV strains.
RESULTS
MPXV DNA detection was more frequent in the skin (94.4%) with the longest median time of viral clearance (16 days). The actively-replicating virus in cell culture was obtained for 123/377 (32.6%) samples with a significant higher viral quantity on isolation positive samples (20 vs 31, p < 0.001). The phylogenetic analysis highlighted the high genetic identity of the MPXV strains collected, both globally and within the Lombardy region.
CONCLUSION
Skin lesion is gold standard material and the high viral load and the actively-replicating virus observed in genital sites confirms that sexual contact plays a key role in the viral transmission.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.