Эпидемиологические характеристики коксакевируса А6 в Баоту, Внутренняя Монголия, Китай, 2023 - 2024 годы.

Возрождение Coxsackievirus A6 (CV-A6) в качестве преобладающего патогена в руке, ступнях и во рту (HFMD) подчеркивает необходимость постоянного молекулярного наблюдения для уточнения местной эволюционной динамики. Цель этого исследования состояла в том, чтобы охарактеризовать генетические особенности штаммов CV-A6, циркулирующих в Баоту (Иннер-Монголия) с 2023 по 2024 год. С помощью количественных ПЦР в режиме реального времени были проверены плавучие мазки, собранные у пациентов, страдающих ПХД; были расширены и секвенированы области VP1 и полные геномы репрезентативных проб CV-A6. Впоследствии были проведены анализы филогенетики и рекомбинации. Из 266 клинических образцов 169 (63,53%) тестировались на энтеровирус, из которых 146 (86,39%) были отнесены к категории CV-A6. Местная эпидемия характеризовалась сезонными колебаниями осенней зимы и в основном затронула детей в возрасте от 4 до 6 лет. Филогенетическая реконструкция 133 последовательностей VP1 показала, что все изолирующие вещества Baotou CV-A6 принадлежали субгенотипу D3c, а анализ полных геномов выявил доминирующую рекомбинантную форму. Эти выводы свидетельствуют о том, что субгенотип D3c, характеризующийся особой рекомбинационной структурой, был ответственен за вспышки ГФМ в Баоту в период исследования, что позволило получить важные молекулярные данные для региональных стратегий в области здравоохранения и разработки вакцин.