MedElevator
Войти в исследования Генетические характеристики коксакевируса А16, связанные с болезнью рук, ног и рта в Нанкине, Китай.
Аннотация
ВВЕДЕНИЕ
Коксакиеврирус А16 (CVA16) является основным патогеном в руке, ногах и во рту во всем мире. Цель этого исследования заключалась в уточнении генетических характеристик CVA16, связанных с HFMD в определенном районе в Нанкине, Китай. МЕТОДОЛОГИЯ: В период 2011−2013 годов через стационарные больницы в Наньцзине было получено в общей сложности 175 штаммов CVA16, изолированных от мазков горла. Множественная цепная реакция на полимеразу (PCR) использовалась для увеличения последовательности VP1 местных штаммов CVA16, и их генетическая связь с 138 штаммами CVA16, изолированными в Китае и других странах мира, была сопоставлена.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Филогеозный анализ на основе полных последовательностей VP1 показал, что субгенотипы B1a и B1b в основном циркулируют в штаммах Нанкин и B1b более широко распространены. Эволюция штаммов CVA16 является весьма консервативной, со средним расстоянием менее 9%. Кроме того, были изучены шесть консервативных регионов в протеине VP1, и три из них продемонстрировали высокую степень сохранения во всех генотипах CVA16, за исключением прототипа G-10, и могут служить для дальнейших исследований вакцин.
ВЫВОДЫ
штаммы CVA16, распространившиеся в Наньцзине, Китай, в 2011−2013 годах, принадлежали к различным генотипам и развивались консервативным образом. Для получения дополнительных данных об эпидемиологической связи и событиях эволюционной рекомбинации в КВА16 требуется постоянное наблюдение за патогенами, связанными с ГФМ.
Название и аннотация на языке оригинала
Genetic characteristics of coxsackievirus A16 associated with hand, foot, and mouth disease in Nanjing, China.
INTRODUCTION
Coxsackievirus A16 (CVA16) is a main pathogen in hand, foot, and mouth disease (HFMD) worldwide. This study intended to clarify the genetic characteristics of CVA16 associated with HFMD in a defined area in Nanjing, China.
METHODOLOGY: A total of 175 CVA16 strains isolated from throat swabs between 2011 and 2013 were obtained through sentinel hospitals in Nanjing. Multiplex polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify the VP1 sequence of local CVA16 strains, and their genetic relationship with 138 CVA16 strains isolated in China and other countries of the world was compared.
RESULTS
Phylogenetic analysis based on complete VP1 sequences revealed that subgenotype B1a and B1b were predominantly circulating in Nanjing and B1b strains were spread more widely. The evolution of CVA16 strains is very conservative, with a mean distance of less than 9%. Moreover, six reported conservative regions in VP1 protein were examined, and three of them exhibited high conservation in all CVA16 genotypes except the G-10 prototype and may serve for further vaccine research.
CONCLUSIONS
The CVA16 strains circulating in Nanjing, China, in 2011 to 2013 belonged to different genotypes and evolved in a conservative way. To provide further evidence for epidemiological linkage and evolutionary recombination events in CVA16, persistent surveillance of HFMD-associated pathogens is required.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.