MedElevator
Войти в исследования Молекулярная характеристика и полный геномный анализ энтеровируса человека 71 и коксакевируса А16 у детей с заболеваниями рук, ног и рота в Таиланде в 2008-2011 годах.
Аннотация
Болезни рук, ног и рта (HFMD) были вызваны главным образом энтеровирусом 71 (EV71) и коксакиевирусом A16 (CA16). CA 16 была самой распространенной причиной ВДФМ в 2010 году. ЭV71 имел высокий уровень распространенности в 2008 - 2009 годах и был определен более часто с 2011 года. Были описаны почти полные последовательности генома трех штаммов EV71 (2008-2009) и двух штаммов CA16 (2010 штамм), полученных в результате вспышек в Таиланде в 2008-2010 годах. На основе филогенетического дерева всей области VP1, три штамма EV71 сгруппированы в генотипы B5, C1 и C4 и два штамма CA16, сгруппированные в генотип C. На основе анализа последовательности были выявлены изменения в нуклеотиде, с тем чтобы сгруппировать в элементе внутренней рибосомы входной точки (IRES) 5-футовой области (5'-UTR). Различия в аминокислоте, выявленные во всех штаммах, были обнаружены в неструктурном протеине. Эти данные также дают представление о молекулярной эпидемиологии вспышек EV71 и CA16 в Таиланде.
Название и аннотация на языке оригинала
Molecular characterization and complete genome analysis of human enterovirus 71 and coxsackievirus A16 from children with hand, foot and mouth disease in Thailand during 2008-2011.
Hand, foot and mouth disease (HFMD) has mostly been caused by enterovirus 71 (EV71) and coxsackievirus A16 (CA16). CA 16 was the most common cause of HFMD in 2010. EV71 had a high prevalence in 2008-2009 and has been identified with a higher frequency since 2011. Nearly complete genome sequences of three EV71 strains (2008-2009 strains) and two CA16 strains (2010 strains) obtained from outbreaks in Thailand in 2008 to 2010 were characterized. Based on a phylogenetic tree of the complete VP1 region, three EV71 strains grouped into the B5, C1 and C4 genotypes, and two CA16 strains grouped into the C genotype. Based on sequence analysis, nucleotide changes were found to cluster in the internal ribosome entry site (IRES) element of the 5'-untranslated region (5'-UTR). Amino acid differences identified in all strains were located in the non-structural protein. These data also provide the molecular epidemiology of EV71 and CA16 outbreaks in Thailand.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.