Геномические и стеноскопические особенности интеграции ВИЧ-инфекции в лечебно-наивных, ВИЧ-позитивных детей с хроническим ВИЧ-инфекцией.

Интеграция вируса В (ГБВ) представляет собой серьезное препятствие для лечения ГБВ; однако ландшафт интеграции ГБВ и местной иммунной реакции на трансформационно активную вирусную интеграцию у детей с хронической ГБВ остается неясным. В этой связи мы стремились прояснить этот ландшафт в этой популяции.

МЕТОДЫ

Геномический анализ с использованием стратегии улавливания на основе зондов был проведен в отношении 18 детей и 28 взрослых, страдающих хроническим ВИЧ-инфекцией. Пространственная транскриптомика (ST) была произведена на 12 детей из нашей группы и на 3 взрослых из публичной базы данных. Все пациенты были больны гепатитом B e антигеном (HBeAg) и наивным лечением. Геномически у детей был значительно более низкий уровень клональной экспансии интегрированных гепатоцитов ГБТС, чем у взрослых, несмотря на сопоставимые уникальные точки отсчета. После корректировки на смешанные переменные возраст был определен в качестве независимого фактора риска для общей частоты уникальных интеграционных интервалов (b = 3,22, P = 0,005). В пространственном плане " СТ " выявила, что пятна с транскриптивной активной вирусной интеграцией характеризуются ограниченным распространением и составляют незначительную долю всех пятен у детей. В частности, в этих точках у детей наблюдалось снижение адаптивных иммунных клеток (например, CD8+T-клетки), но увеличилось количество врожденных компонентов (миелиоидных клеток, клеток Купффера, активированных дендритических клеток) и АКН, в то время как у взрослых наблюдалось единообразное сокращение популяций иммунных клеток. ИНТЕРПРЕТАЦИЯ: По сравнению со взрослыми у детей меньшее клональное расширение интегрированных гепатоцитов и различных иммунных профилей в ответ на транскрипционально активную вирусную интеграцию, что дает новое представление об их различном клиническом курсе. ФИНАНСИРОВАНИЕ: Основная лаборатория молекулярной биологии инфекционных заболеваний (министерство образования).