STAR protocols · 2025
Protocol for characterizing craniopharyngioma subtypes and their microenvironments using single-cell RNA sequencing and immunohistochemistry.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kono Takashi, Matsuda Tatsuma, Fujimoto Masanori, Taki Yuki, Sakuma Ikki, Hashimoto Naoko, Nakamura Yasuhiro, Horiguchi Kentaro, Higuchi Yoshinori, Onodera Atsushi, Miki Takashi, Tanaka Tomoaki
Аннотация
Here, we present a comprehensive protocol for analyzing craniopharyngioma subtypes and their tumor microenvironments at single-cell resolution. We describe tumor tissue dissociation, single-cell isolation, RNA sequencing library preparation, and bioinformatics analysis procedures. We also detail immunohistochemistry procedures for validating findings. This approach enables the detailed characterization of tumor cellular composition, immune cell networks, and molecular signatures that distinguish adamantinomatous from papillary craniopharyngiomas. For complete details on the use and execution of this protocol, refer to Matsuda et al.1.