Nature communications · 2014
Dynamic GATA4 enhancers shape the chromatin landscape central to heart development and disease.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
He Aibin, Gu Fei, Hu Yong, Ma Qing, Ye Lillian Yi, Akiyama Jennifer A, Visel Axel, Pennacchio Len A, Pu William T
Аннотация
How stage-specific enhancer dynamics modulate gene expression patterns essential for organ development, homeostasis and disease is not well understood. Here, we addressed this question by mapping chromatin occupancy of GATA4--a master cardiac transcription factor--in heart development and disease. We find that GATA4 binds and participates in establishing active chromatin regions by stimulating H3K27ac deposition, which facilitates GATA4-driven gene expression. GATA4 chromatin occupancy changes markedly between fetal and adult heart, with a limited binding sites overlap. Cardiac stress restored GATA4 occupancy to a subset of fetal sites, but many stress-associated GATA4 binding sites localized to loci not occupied by GATA4 during normal heart development. Collectively, our data show that dynamic, context-specific transcription factors occupancy underlies stage-specific events in development, homeostasis and disease.
Предметные рубрики MeSH
AnimalsBlotting, WesternCardiomegalyChromatinChromatin ImmunoprecipitationEnhancer Elements, GeneticGATA4 Transcription FactorGene Expression Regulation, DevelopmentalHeartHigh-Throughput Nucleotide SequencingHistonesLuciferasesMiceMice, TransgenicMorphogenesisReal-Time Polymerase Chain ReactionStatistics, Nonparametric