Alpha-gal syndrome (AGS) is an IgE-mediated allergy to galactose-α-1,3-galactose (α-Gal), typically triggered by tick bites. Genetic factors, including human leucocyte antigen (HLA) class II polymorphisms and selected single nucleotide polymorphisms (SNPs) in immune and glycan-related genes, are hypothesized to modulate susceptibility and clinical expression. Here we provide a step-by-step protocol to genotype risk markers from ethylenediaminetetetraacetic acid (EDTA) whole blood sample, combining (i) manual DNA extraction (Qiagen), (ii) SNP genotyping by a real-time/quantitative PCR (qPCR) me
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Humanized mouse models are indispensable in vivo experimental platforms for investigating human-specific biological processes in a controlled and reproducible environment, serving as a preclinical link between basic research and application in translational research. Alpha-Gal syndrome (AGS) is one of the emerging pathologies that highlight the need for a murine system capable of mimicking the reproduction of key aspects of human immune and allergic responses. Humanized α1,3GalT-knockout (KO) mice have expanded research on immunological basis of the syndrome and advanced in preclinical researc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The alpha-Gal syndrome (AGS) is an allergic disease with IgE-mediated delayed hypersensitivity to the oligosaccharide galactose-α-1,3-galactose (α-Gal) present in tick saliva and mammalian-derived foods and drugs. The incidence of AGS is increasing worldwide and thus requires the identification of serum biomarkers and tick biomolecules for the development of preventive, treatment, and control interventions. In this chapter, we describe step-by-step methods for proteomics analysis of human serum samples for AGS-related biomarker identification and characterization, characterization of molecular
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Indirect basophil activation test (iBAT) is a flow cytometry-based assay in which basophils are first passively sensitized with patient-derived IgE and subsequently stimulated with the allergen of interest to assess activation markers on the cell surface. This method was implemented by using the human KU812 cell line to investigate basophil activation mechanisms triggered by tick-derived biomolecules. Unlike the traditional BAT, the iBAT approach avoids variability from non-responder patients and donor-dependent differences, providing a stable and reproducible in vitro model. KU812 cells w
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes the experimental methodology used to establish a rat model of oral food allergy. The final protocol has been optimized for the Wistar strain. The model mimics chronic oral allergen re-exposure and allows the study of effector-phase allergic responses. It encompasses all experimental stages, including preliminary procedures, intramuscular sensitization, the use of pro-type 2 immune response adjuvants, allergen re-sensitization, and the final oral challenge, using ovalbumin (OVA). Key outcomes include clinical parameters such as sign scoring, diarrhea classification, and b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allergenicity is a multifactorial and context-dependent property that emerges from the interaction between intrinsic protein features and host immune mechanisms. Although regulatory frameworks rely primarily on sequence homology to known allergens, increasing numbers of novel and engineered proteins require more comprehensive computational strategies for preclinical assessment. This chapter describes a modular bioinformatic pipeline for the prediction and characterization of potential protein allergens. The workflow integrates FAO/WHO sequence-based criteria for regulatory compliance, structur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-gal syndrome (AGS) is an ectoparasite-associated IgE-mediated hypersensitivity in which reactions occur after exposure to galactose-alpha-1,3-galactose (alpha-Gal) in mammalian foods, biologics, medications, and other mammalian-derived products. The delayed onset after oral exposure and the imperfect correlation between sensitization and clinical allergy complicate diagnosis. This chapter provides a practical clinical protocol for evaluating suspected ectoparasite-induced allergy with emphasis on AGS. The protocol integrates structured history taking, tick and other ectoparasite exposure
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diagnosis of Ewing sarcoma requires integrating information from numerous techniques, some of which are very sophisticated. However, the first steps of the diagnostic process are crucial to achieve the maximum possible diagnostic performance. In this chapter, we will review how to handle the diagnostic specimen from its collection, how to prepare it for diagnosis, how to make a complete pathology report, and provide guidance for the reasonable use of immunohistochemical techniques in this malignancy.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Facial appearance offers a non-invasive window into health. We built Foundation Artificial Intelligence for Health Recognition-Face (FAHR-Face), a foundation model trained on more than 40 million facial photographs and fine-tuned it for two distinct tasks: biological age estimation (FAHR-FaceAge) and survival prediction (FAHR-FaceSurvival).
METHODS: FAHR-FaceAge underwent two-stage, age-balanced fine-tuning on ten public image datasets; FAHR-FaceSurvival was fine-tuned on 34 363 photographs of patients with cancer. Model robustness (cosmetic surgery, make-up, pose, and lighting) a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella is an important zoonotic pathogen that is widely distributed in livestock, poultry, and other animals. Salmonella contamination not only affects the healthy development of the livestock industry but also poses a serious threat to public health. Therefore, establishing detection methods capable of simultaneously identifying different Salmonella serotypes is crucial. Among current detection methods for Salmonella, immunological detection methods using MAbs offer high throughput, shorter processing times, and enhanced specificity, making them useful for rapid Salmonella detection. The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella can form biofilms, which are structured microbial communities composed of cells that adhere irreversibly to surfaces or to other cells. The formation of Salmonella biofilms may enhance the bacterial resistance to drugs, environmental stress, and the host immune system. Crystal violet staining is one of the most classical and widely used methods for measuring biofilms in laboratories. Its principle is primarily based on the binding of crystal violet to various components within the biofilm. Here, we describe the crystal violet assay protocol to measure the formation of Salmonella bio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the main challenges in understanding Salmonella biology lies in dissecting the genetic basis of its survival, pathogenicity, and antimicrobial resistance. Here, we describe the construction of a high-density transposon mutant library in Salmonella. Using a mariner-based transposon system delivered through conjugation, we generated a library comprising more than 1 × 105 independent mutants, covering the majority of nonessential genes. This library enables a valuable resource for large-scale functional genomics studies, including the identification of essential genes, virulence determinat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AA is known to play a significant role in male fertility. AA metabolites, prostaglandins (PGs), were first discovered in the seminal fluid. It was assumed at the time of its discovery that PGs were formed by the prostate and hence were named as prostaglandins. PGs are crucial for sperm function. Lower PGE2 in the semen was found in those who are infertile. NSAIDs (nonsteroidal anti-inflammatory drugs such as ibuprofen) are known to affect male fertility, sperm function, and semen parameters. These results suggest that potential use of AA and PGE2 to enhance male fertility needs to be studied.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polychromatic flow cytometry enables the detection and characterization of markers that are helpful in defining the phenotype of various cell subsets. Here, we described a flow cytometry-based method to characterize the phenotype of naïve, memory, and effector T cells. Being able to differentiate these cells is crucial in understanding immune response and immune profiling. Naïve T cells enable the body to fight off new, unrecognized infections and diseases, and Memory T cells are enriched for response to recall antigens. Furthermore, the antigen-experienced T-cell populations can be broadly di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flow cytometry has made it possible to identify human B cell subsets based on surface and intracellular antigens, a process known as immunophenotyping. CD19 and CD20 are commonly expressed in all B cells; the presence or absence of CD27 separates memory B cells from naïve cells, while IgD and IgM are used to distinguish naïve from transitional B cells. Markers such as CD38, CD27, and CD24 are helpful to identify plasmablasts and immature B cells. CD21 points to mature B cells, CD10 is on immature B cells, CD138 marks plasma cells, and CD5 is high in regulatory B cells. Memory B cells have less
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell transcriptomics has revolutionized our understanding of cellular heterogeneity by enabling high-resolution gene expression profiling at the individual cell level. However, traditional single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) lacks direct protein quantification, limiting comprehensive immunophenotyping. Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by sequencing (CITE-seq) overcomes this limitation by integrating antibody-derived tag (ADT) quantification with scRNA-seq, allowing simultaneous measurement of surface protein and gene expression from the same cell. This multimodal appr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulatory T cells, or Tregs, are a unique type of CD4⁺ T cell that act as the immune system's brakes-they stop it from turning against the body's own tissues. For about twenty years now, researchers have been digging into what sets Tregs apart from other T cells, both in their composition and function (1). Markers like CD25 (IL-2Rα), Foxp3, and CTLA-4 usually show up when Tregs are active, but these markers aren't always reliable-they can shift depending on where the cells are and what they are doing. Foxp3 is a transcription factor that Tregs need to develop and function. Mutations on Foxp3
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-content cytometry is an important technique in clinical research, producing data that is rich and complex to analyze. The resulting clusters of cells must be profiled to determine their role and function and analyzed to identify changes in cell frequency or marker intensity. The heat map is the most suitable tool for presenting this information in a synthetic way. However, its construction must be adapted to the information and the objective. Here we describe the step-by-step construction of heat maps of marker intensity and cell frequency using Excel, Phantasus, or R, including the conve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Affinity purification-mass spectrometry (AP-MS) is a powerful proteomic approach for dissecting the interaction network between virus and host. Traditional AP-MS employs overexpression of viral proteins as baits to enrich host interactors. However, overexpressed viral proteins may mislocalize to inappropriate cellular compartments and trigger endoplasmic reticulum stress by overwhelming the protein-folding machinery, which leads to false identification of host factors. To overcome these limitations, we introduce an AP-MS strategy based on direct infection with an epitope-tagged chikungunya vir
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intracellular calcium signaling plays a crucial role in intestinal epithelial function. In this chapter, we describe a method to monitor calcium dynamics in live pig small intestinal organoids using stably expressed genetically encoded FRET-based biosensor in combination with intensity-based ratiometric and fluorescence lifetime imaging (FLIM) microscopy readouts. The calcium biosensor Twitch-2B was introduced into organoids by electroporation. Despite the modest lifetime contrast, the biosensor provides a highly reliable ratiometric signal and is compatible with both conventional fluorescence
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.