This chapter describes a standardized experimental protocol to induce and analyze galactose-α-1,3-galactose (α-Gal)-specific IgE responses in α-Gal-deficient (α1,3-galactosyltransferase knockout) mice. The absence of endogenous α-Gal in this model enables controlled sensitization to exogenous α-Gal-containing antigens from microbial, arthropod, and mammalian sources. The protocol integrates sequential oral exposure to α-Gal-expressing Escherichia coli O86:B7, capsule-based infestation with Ixodes ricinus nymphs, oral administration of porcine tissue homogenate, and subcutaneous injection of ti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-gal syndrome (AGS) is an ectoparasite-associated IgE-mediated hypersensitivity in which reactions occur after exposure to galactose-alpha-1,3-galactose (alpha-Gal) in mammalian foods, biologics, medications, and other mammalian-derived products. The delayed onset after oral exposure and the imperfect correlation between sensitization and clinical allergy complicate diagnosis. This chapter provides a practical clinical protocol for evaluating suspected ectoparasite-induced allergy with emphasis on AGS. The protocol integrates structured history taking, tick and other ectoparasite exposure
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Animal experimentation is a fundamental tool in biomedical research for the study of diseases and the development of interventions such as drugs, vaccines, and probiotics for the treatment of human pathologies. Animal models enable analysis of pathophysiological processes in complex organisms with genetic and functional similarities to humans, which is essential for evaluating the safety and efficacy of new therapeutic interventions and surgical techniques before their clinical application. Among the most commonly used models are mice, rats, and fish, employed in the study of various diseases,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida tropicalis is a nonconventional yeast with biotechnological applications based on its capacity to produce sweeteners, biofuels, enzymes, and polysaccharides from the assimilation of different carbon sources. The biotechnological advantages are dependent on its metabolism, which can be preserved avoiding genotypic or phenotypic changes through cryopreservation. Hence, the protocols needed to carry out the cryopreservation of C. tropicalis (Castellani) Berkhout 750™ obtained from the KWIK-STIK™ are described. KWIK-STIK™ provides lyophilized microorganisms useful as control strains at the
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Boari flap reconstruction is effective for unilateral ureteral strictures (1-5), but its use for bilateral disease is rarely reported. Robotic surgery offers enhanced visualization and dexterity for complex ureteral reconstruction (4, 6-9). We describe robotic totally intracorporeal bilateral Boari flap (BBF) reconstruction for bilateral mid- and distal ureteral strictures (BMDUS).
MATERIALS AND METHODS: A 42-year-old woman with BMDUS underwent BBF reconstruction. The left ureter was dissected, ligated, and transected proximal to the stricture, then trimmed to healthy tissue until a
СтатьяКлинический случайVideo-Audio MediaПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Urethral stricture is a chronic narrowing of the urethral lumen caused by inflammation and iatrogenic interventions, including previous surgery and prostate cancer treatment (1). Treatment options include urethral dilation, internal urethrotomy, urethroplasty, and perineal urethrostomy. Perineal urethrostomy creates a permanent urethral meatus and is increasingly considered a primary treatment option for complex cases or patients with significant comorbidities (2, 3). It is associated with high patient satisfaction, preserved continence, and favorable voiding outcomes (4). This video
СтатьяКлинический случайVideo-Audio MediaПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To evaluate midterm patency, recovery, and donor-site outcomes after robot-assisted vesical mucosal graft (VMG) ureteroplasty for long ureteral strictures.
MATERIALS AND METHODS: This retrospective cohort included 46 VMG procedures and 21 clinically allocated buccal mucosal graft (BMG) reference procedures. The primary outcome was intervention-free patency at last follow-up. Secondary outcomes included workflow, recovery, donor-site morbidity, 30-day complications, hydronephrosis, and renal function. Continuous outcomes were assessed using adjusted models.
RESULTS: Mean follow-up wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Different methods have been described for the preservation of biopsy or resection samples. In routine pathology, the cheapest and most used method is fixation of samples in formalin and embedding in paraffin (FFPE samples). This method preserves tissue samples for a very long time and is suitable for several specialized techniques, such as fluorescence in situ hybridization (FISH) and immunohistochemistry, the latter being the most frequent and often the only additional method used for the establishment of the final diagnosis. However, in light of the growing need for next-generation sequencin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ewing sarcoma (EwS) is an aggressive, human-exclusive tumor typically driven by the EWS::FLI1 fusion protein. The paucity of genetically modified animal models hinders in vivo functional studies of this oncogene. Here, we describe the generation of transgenic Drosophila lines expressing different levels of human EWS::FLI1 and fluorescent reporters of conversion of quiescent GGAA-repeat microsatellites (GGAAμSats) into neoenhancers. We also describe experimental setups to test EWS::FLI1 activity, and to carry out genetic and chemical screens. Altogether, the collection of transgenic Drosophila
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the rapid development of sequencing technologies, whole-genome sequencing (WGS) is now easily accessible across various domains. Bacterial WGS has started to be routinely used in research and public health laboratories for clinical diagnostics, outbreak risk prediction, and pathogen characterization. WGS of foodborne pathogens allows for rapid, accurate identification and typing of pathogens, and detailed characterization of genomic features such as antimicrobial resistance genes, virulence genes, and plasmids. Salmonella, an important foodborne pathogen, is the leading cause of deaths as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Indentation Type-AFM (IT-AFM) is very useful to analyze the local rheological properties of soft or biological materials. However, analysis of the force-indentation curves is very sensitive to the way the curves are fitted: fits with elastic models such as Hertz or Sneddon's models performed on parts of the curve that indeed correspond to nonlinear elastic regimes, or that result from significant adhesive interactions of the AFM tip with the material lead to results that can be as much as twice larger than fits performed with appropriate models (nonlinear or adhesive). Here, we propose a metho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell's elasticity is an integrative parameter summarizing the biophysical outcome of many known and unknown cellular processes. This includes intracellular signaling, cytoskeletal activity, changes of cell volume and morphology, and many others. Not only intracellular processes defines a cell's elasticity but also environmental factors like their biochemical and biophysical surroundings. Therefore, cell mechanics represents a comprehensive variable of life. A cell in its standard conditions shows variabilities of biochemical and biophysical processes resulting in a certain range of cell's elas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA helicases are essential in all aspects of RNA biology where they remodel RNA secondary structures and RNA-protein (RNP) complexes. DEAD-box RNA helicases represent the largest RNA helicase family in eukaryotes. However, identification of biological targets for such helicases has been challenging. Structural probing methods involving treatment of cells with reagents such as SHAPE or dimethyl sulfate (DMS) coupled with sequencing (seq) have now enabled identification of RNA targets for these enzymes. These methods require extensive bioinformatics to derive RNA secondary structure predictions
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
R-loops are noncanonical nucleic acid structures formed by an RNA:DNA heteroduplex, presumably arising by the pairing of the nascent RNA to its own DNA template and the subsequent extrusion of a single DNA strand. Such structures, previously thought to be rare and mostly by-products of transcription, are today recognized as physiological intermediates of several molecular processes and to form at much higher rates than anticipated. R-loop levels must be meticulously controlled, as they can lead to DNA damage and genome instability. RNA remodeling, in particular, constitutes a central mechanism
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In many instances, the RNA sequences or motifs that constitute optimal or physiological substrates for a given RNA helicase are unknown or difficult to identify. In this chapter, we describe a recent methodology, Helicase-induced Selection of Ligands by Exponential enrichment (Helicase-SELEX), which allows the global identification of catalytically productive substrates for a RNA helicase from a large library of nucleic acid sequences. We explain how to use the methodology to identify Rut (Rho utilization) sequences in bacterial genomes, which likely encode the physiological RNA targets used b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA helicases play a critical role in RNA biogenesis by modulating RNA-protein interactions in an ATP-dependent manner. Although many RNA helicases function by unwinding RNA secondary structures or displacing proteins from RNA, a subset of RNA helicases facilitates the loading of their interacting proteins onto RNA. Here, I present an in vitro method for analyzing the formation of the uridine-rich small nuclear RNA (U snRNA) export complex, for which the involvement of RNA helicases was previously unknown. This method can be used to determine whether complex formation is ATP-dependent and iden
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitating the binding of oligomeric proteins to RNA is not always straightforward with standard biochemical approaches such as the Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA). Here, we detail how we use a simple, alternative approach based on sample filtering through stacked nitrocellulose and positively charged nylon membranes to measure the affinity of the hexameric transcription termination factor Rho for RNA. The method is quick and easy to implement and should be useful to study the interaction of other RNA-binding proteins using RNA substrates bearing a 32P or fluorescent label.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interaction of RNA helicases and non-canonical G-rich quadruplex (G4) structures in all aspects of RNA metabolism is a rapidly expanding field of study. Both cellular and viral RNA helicases dynamically maintain and disrupt G4 RNA structures in multiple compartments of the cell for efficient trafficking, transcription, splicing, translation, and, in the case of viral RNA genomes, replication. The conserved domains shared by diverse members of the helicase superfamilies for RNA binding and ATP-mediated duplex unwinding suggest that quadruplex disruption is a critical activity for many helic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA helicases are RNA-binding enzymes that remodel RNA structures and ribonucleoprotein complexes through regulated conformational changes. Their RecA-like catalytic cores cooperate with auxiliary domains, many of which contain flexible or partially disordered regions whose rearrangements are difficult to characterize using static structural methods. Hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) overcomes this limitation by examining protein conformation in solution, providing peptide-resolved information on local stability, dynamics, and ligand-dependent structural changes. In this c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-molecule manipulation methods are useful techniques to probe the interactions of proteins and nucleic acid structures. Here, we describe magnetic tweezers-based single-molecule investigation of the binding of helicases to G-quadruplex structures and their ATP-dependent unwinding activity, using DHX36 (also known as RHAU and G4R1) helicase and both DNA and RNA G-quadruplex structures as examples. We specifically emphasize the principle and method to probe the interactions between DHX36 and the DNA G-quadruplex in different intermediate states during an ATPase cycle of DHX36, based on det
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования