Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Доступно в поиске
13733 публикаций
Поиск: 63 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 34 с найденным полным текстом
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)2027eng
RNA helicases are essential in all aspects of RNA biology where they remodel RNA secondary structures and RNA-protein (RNP) complexes. DEAD-box RNA helicases represent the largest RNA helicase family in eukaryotes. However, identification of biological targets for such helicases has been challenging. Structural probing methods involving treatment of cells with reagents such as SHAPE or dimethyl sulfate (DMS) coupled with sequencing (seq) have now enabled identification of RNA targets for these enzymes. These methods require extensive bioinformatics to derive RNA secondary structure predictions
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
R-loops are noncanonical nucleic acid structures formed by an RNA:DNA heteroduplex, presumably arising by the pairing of the nascent RNA to its own DNA template and the subsequent extrusion of a single DNA strand. Such structures, previously thought to be rare and mostly by-products of transcription, are today recognized as physiological intermediates of several molecular processes and to form at much higher rates than anticipated. R-loop levels must be meticulously controlled, as they can lead to DNA damage and genome instability. RNA remodeling, in particular, constitutes a central mechanism
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In many instances, the RNA sequences or motifs that constitute optimal or physiological substrates for a given RNA helicase are unknown or difficult to identify. In this chapter, we describe a recent methodology, Helicase-induced Selection of Ligands by Exponential enrichment (Helicase-SELEX), which allows the global identification of catalytically productive substrates for a RNA helicase from a large library of nucleic acid sequences. We explain how to use the methodology to identify Rut (Rho utilization) sequences in bacterial genomes, which likely encode the physiological RNA targets used b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA helicases play a critical role in RNA biogenesis by modulating RNA-protein interactions in an ATP-dependent manner. Although many RNA helicases function by unwinding RNA secondary structures or displacing proteins from RNA, a subset of RNA helicases facilitates the loading of their interacting proteins onto RNA. Here, I present an in vitro method for analyzing the formation of the uridine-rich small nuclear RNA (U snRNA) export complex, for which the involvement of RNA helicases was previously unknown. This method can be used to determine whether complex formation is ATP-dependent and iden
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitating the binding of oligomeric proteins to RNA is not always straightforward with standard biochemical approaches such as the Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA). Here, we detail how we use a simple, alternative approach based on sample filtering through stacked nitrocellulose and positively charged nylon membranes to measure the affinity of the hexameric transcription termination factor Rho for RNA. The method is quick and easy to implement and should be useful to study the interaction of other RNA-binding proteins using RNA substrates bearing a 32P or fluorescent label.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interaction of RNA helicases and non-canonical G-rich quadruplex (G4) structures in all aspects of RNA metabolism is a rapidly expanding field of study. Both cellular and viral RNA helicases dynamically maintain and disrupt G4 RNA structures in multiple compartments of the cell for efficient trafficking, transcription, splicing, translation, and, in the case of viral RNA genomes, replication. The conserved domains shared by diverse members of the helicase superfamilies for RNA binding and ATP-mediated duplex unwinding suggest that quadruplex disruption is a critical activity for many helic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA helicases are RNA-binding enzymes that remodel RNA structures and ribonucleoprotein complexes through regulated conformational changes. Their RecA-like catalytic cores cooperate with auxiliary domains, many of which contain flexible or partially disordered regions whose rearrangements are difficult to characterize using static structural methods. Hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) overcomes this limitation by examining protein conformation in solution, providing peptide-resolved information on local stability, dynamics, and ligand-dependent structural changes. In this c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-molecule manipulation methods are useful techniques to probe the interactions of proteins and nucleic acid structures. Here, we describe magnetic tweezers-based single-molecule investigation of the binding of helicases to G-quadruplex structures and their ATP-dependent unwinding activity, using DHX36 (also known as RHAU and G4R1) helicase and both DNA and RNA G-quadruplex structures as examples. We specifically emphasize the principle and method to probe the interactions between DHX36 and the DNA G-quadruplex in different intermediate states during an ATPase cycle of DHX36, based on det
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA helicase DHX9 is a multi-functional protein governing transcriptional modulation, RNA processing, R-loop balance, and genome stability. SUMOylation is a post-translational modification that adds a critical regulatory layer to protein function by diversifying subcellular localization, stability, enzymatic activity, and protein-protein interactions. This protocol describes a basic but detailed approach for the analysis of DHX9 SUMOylation. We demonstrate that accurate site identification, specifically at Lysine 120 (K120), is the prerequisite for defining the molecular mechanism of this modi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribonucleases can cleave RNAs internally in endoribonucleolytic mode or remove one nucleotide at a time from either the 5' or 3' end through exoribonuclease action. To show the direct implication of an RNase in a specific pathway of RNA maturation or decay requires the setting up of in vitro assays with purified enzymes and substrates. This chapter complements the previous Chap. 24 on assays of ribonuclease action in vivo by providing detailed protocols for the assay of B. subtilis RNases with prepared substrates in vitro.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DEAD-box RNA helicases are widespread ATP-driven enzymes that reshape RNA structures and RNA-protein complexes during many steps of RNA metabolism. In bacteria, DEAD-box RNA helicases support cellular growth and responses to stress by contributing to ribosome biogenesis, RNA degradation, and translation initiation. Growing evidence indicates that several DEAD-box RNA helicases can also form liquid-liquid phase-separated condensates that concentrate RNA and partner proteins. This behavior adds a new layer of control to RNA regulation, although the molecular factors that promote or tune liquid-l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribonucleases remodel RNAs to render them functional or to initiate their degradation. Our laboratory studies these pathways in detail using a variety of techniques, ranging from the isolation of RNAs in various RNase mutants to determine their implication in maturation or decay pathways by Northern blot, to proving their direct roles in RNA cleavage reactions using purified enzymes and in vitro-transcribed RNA. In this chapter, we provide in-depth protocols for the techniques we regularly use in the laboratory to assay RNase activity in vivo, with detailed notes on optimization of these metho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional fusions to the lacZ gene from Escherichia coli can be used to study gene expression. Here, we describe protocols for using a miniTn5 derivative to generate random insertions of the lacZY operon in the genome of Salmonella enterica serovar Typhimurium, to analyze the expression of transcriptional lac fusions under different conditions, and to identify the genomic location of some fusions.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Analyses of virulence functions of Salmonella enterica demand generation of plasmids for complementation of mutated genes, expression of tagged alleles of effector proteins of the type III secretion systems, or fusions to reporter genes for investigation of regulation of expression, or protein localization and fate after translocation into host cells. Here, a simple and versatile approach for generation of plasmids from modular DNA fragments is described. The Modular Cloning approach is based on Gibson assembly and uses standardized overlap sequences that enable various combinations and reuse
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 3'→5' RNA helicase YTHDC2 is a posttranscriptional regulator of gene expression in reproductive cells, where it is essential for the progression of meiosis. But a detailed understanding of its molecular mechanism is currently lacking. Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing is a well-established method for transcriptome-wide identification of the positions of protein-RNA interactions and has played a critical role in studies of RNA-binding proteins. In this chapter, we present an optimized protocol for performing YTHDC2 CLIP in mouse testes to id
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stress granules (SGs) are cytoplasmic, membrane-less ribonucleoprotein (RNP) granules that form in response to cellular stress following the inhibition of translation initiation. Their assembly, composition, and crosstalk with processing bodies (P-bodies) are mediated by protein-protein, RNA-protein, and RNA-RNA interactions. DEAD/DEAH-box RNA helicases are key regulators of stress granules. Here, we present standardized protocols for (i) immunofluorescence of stress granule and P-body scaffold proteins and helicases, (ii) single-molecule RNA fluorescence in situ hybridization (smRNA FISH), an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biochemical testing plays a crucial role in the detection and confirmation of Salmonella spp. Since the cultural characteristics of Salmonella often resemble those of other enteric pathogens, differentiation based solely on growth features can be challenging. Biochemical tests allow for accurate identification by exploiting the distinct metabolic traits of Salmonella. In this study, we described three key tests, including methyl red, hydrogen sulfide production, and urease production, which are particularly important for the confirmation of Salmonella.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella is an important zoonotic pathogen that is widely distributed in livestock, poultry, and other animals. Salmonella contamination not only affects the healthy development of the livestock industry but also poses a serious threat to public health. Therefore, establishing detection methods capable of simultaneously identifying different Salmonella serotypes is crucial. Among current detection methods for Salmonella, immunological detection methods using MAbs offer high throughput, shorter processing times, and enhanced specificity, making them useful for rapid Salmonella detection. The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A rapid and simple electrochemical immunosensor enables the detection of Salmonella in milk. Bacteria are captured and concentrated from samples by antibody-coated magnetic beads and simultaneously labeled with a horseradish peroxidase (HRP) conjugate. The complexes are captured onto an electrode to achieve, upon the addition of HRP substrate, an amperometric signal proportional to the bacterial load. The method detects about 104 CFU mL-1 in diluted milk within 50 min without enrichment. After an 8-h pre-enrichment step, the sensitivity improves to below 1 CFU mL-1, equivalent to ~1-3 CFU in 2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DEAD-box helicases DDX5 and DDX17 play a key role in regulating gene expression and RNA processing in mammalian cells. In particular, they are involved in alternative splicing and in the 3' end processing of nascent transcripts associated with the termination of transcription. In this chapter, we present experimental protocols and computational tools that altogether enable the prediction and validation of various types of changes in the neuroblastoma cell transcriptome upon the depletion of both helicases. This includes protocols for monitoring variations in alternative splicing, readthrough t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.