BACKGROUND: Data on the clinical significance of viral-bacterial co-detection by molecular methods in adults is limited. We aimed to determine how often respiratory viruses and bacteria are co-detected in acutely ill adults and whether co-detection is associated with worse clinical outcomes than detection of a virus or bacterium alone.
METHOD: We prospectively enrolled 998 adult patients presenting to the emergency department with symptoms of respiratory infection, fever, chest pain, or poor general condition. Nasal swab samples were taken at entry and analysed by multiplex PCR for 16 respira
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Menstrual blood and vaginal fluid are frequently encountered in conjunction with semen in alleged sexual assault cases. There are few tests with high specificity for these two body fluids and here we report on a 4-plex MSRE-PCR system for the detection of menstrual blood and vaginal fluid. The assay uses four markers in a multiplex PCR: a positive control (PC), digestive control (DC), menstrual blood-specific (MB) marker and vaginal fluid-specific (VF) marker. Menstrual blood and vaginal fluid samples were identified by the MB and VF markers as expected. Additionally, the results using samples
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To evaluate the disease burden, risk of complications and mortality in children with viral detection during the peri-liver transplant period.
METHODS: A retrospective cohort study was conducted between January 2020 and December 2023 at a tertiary university hospital. Children who underwent multiplex polymerase chain reaction testing from 7 days before to 14 days after liver transplantation were included. The primary outcome was the association between peri-transplant viral detection and mortality. Data were obtained from the hospital's medical records and laboratory databases.
RE…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli (E. coli)-induced community-acquired meningitis in adults is exceedingly rare, with an average of only one annual case reported worldwide. The majority of E. coli meningitis cases in adults are associated with healthcare settings, typically following head injuries or neurosurgical interventions. Nonetheless, spontaneous E. coli meningitis in adults can arise in individuals with various comorbid conditions. This case report details the clinical presentation, diagnostic workup, management, and eventual outcome of a 45-year-old male with significant comorbidities who presented wi
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Antimalarial resistance, especially artemisinin resistance, in Plasmodium falciparum threatens global malaria control. Molecular surveillance of Plasmodium falciparum drug resistance is critical for monitoring the efficacy of artemisinin-based combination therapies (ACTs). Current molecular surveillance tools for Plasmodium falciparum artemisinin resistance are restricted to predefined polymorphism hotspots in limited loci (Pfk13 domain), failing to capture novel mutations in emerging resistance genes (Pfcoronin, Pfubp1, Pfap2μ) or cover complete coding regions. This study addresse
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sexually transmitted diseases (STDs) remain a major global public health challenge because their health consequences lead to severe complications, especially among sexually active populations. Trichomonas vaginalis (TV), Chlamydia trachomatis (CT), and Neisseria gonorrhoeae (NG) are three common non-viral STDs which are increasing worldwide, and co-infections are common.
METHODS: Designed and evaluated the performance of a multiplex polymerase chain reaction (PCR) in both dry and wet samples to detect three non-viral STDs, which were diagnosed based on syndromic case management (S…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amplicon sequencing is a popular method for understanding the diversity of bacterial communities in samples containing multiple organisms as exemplified by 16S rRNA sequencing. Another application of amplicon sequencing includes multiplexing both primer sets and samples, allowing sequencing of multiple targets in multiple samples in the same sequencing run. Multiple tools exist to process the amplicon sequencing data produced via the short-read Illumina platform, but there are fewer options for long-read Oxford Nanopore Technologies (ONT) sequencing, or for processing data from environmental s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Riemerella anatipestifer infection is one of the main infectious diseases that threaten the poultry industry at present. Serotypes 1 and 2 are the main serotypes causing global outbreaks of R. anatipestifer. In this study, we designed the primers specific for R. anatipestifer serotypes 1 and serotype 2 strains, and for R. anatipestifer 16S rRNA (for the species identification) to establish a multiplex PCR assay for rapid detection of the serotype 1 and serotype 2 strains. The specificity test showed that a 505 bp fragment was amplified from serotype 1 strains, and a 1125 bp fragment was amplif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The availability of syndrome-based panels for various ailments has widened the scope of diagnostics in many clinical settings. These panels can detect a multitude of pathogens responsible for a particular condition, which can lead to a timely diagnosis and better treatment outcomes. In contrast to traditional identification methods based on pathogen growth on culture, syndrome-based panels offer a quicker diagnosis, which can be especially beneficial in situations requiring urgent care, such as intensive care units. One such panel is the Biofire Filmarray Pneumonia plus Panel (BFP), which we h
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutation analysis provides confirmation of a clinical and radiological diagnosis of thanatophoric dysplasia types I and II (TD I and II). We developed a single multiplexed PCR and a single-nucleotide extension (SNE) assay to identify 14 common mutations causing 99% of TD I and TD II, including the challenging three adjacent mutations in the stop codon of exon 18 of the FGFR3 gene. The assay design also provides a solution for resolving SNE PCR product sizing using performance optimized polymer-7. The assay was validated using 37 previously characterized, de-identified patient samples represent
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glaesserella parasuis, Mycoplasma hyorhinis, and Mycoplasma hyosynoviae are important porcine pathogens responsible for polyserositis, polyarthritis, meningitis, pneumonia, and septicemia causing significant economic losses in the swine industry. A new multiplex quantitative polymerase chain reaction (qPCR) was designed on one hand for the detection of G. parasuis and the virulence marker vtaA to distinguish between highly virulent and non-virulent strains. On the other hand, fluorescent probes were established for the detection and identification of both M. hyorhinis and M. hyosynoviae target
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: A new high-resolution next-generation sequencing (NGS)-based method was established to type closely related European type II Toxoplasma gondii strains.
METHODS: T. gondii field isolates were collected from different parts of Europe and assessed by whole genome sequencing (WGS). In comparison to ME49 (a type II reference strain), highly polymorphic regions (HPRs) were identified, showing a considerable number of single nucleotide polymorphisms (SNPs). After confirmation by Sanger sequencing, 18 HPRs were used to design a primer panel for multiplex PCR to establish a multilocus Ion Amp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Culture-based microbiological investigation of hospital-acquired or ventilator-associated pneumonia (HAP or VAP) is insensitive, with aetiological agents often unidentified. This can lead to excess antimicrobial treatment of patients with susceptible pathogens, while those with resistant bacteria are treated inadequately for prolonged periods. Using PCR to seek pathogens and their resistance genes directly from clinical samples may improve therapy and stewardship.
METHODS: Surplus routine lower respiratory tract samples were collected from intensive care unit patients about to rec
Многоцентровое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malawi has an estimated cattle population of 1,884,803 heads, the indigenous Malawi zebu breed accounts for 91.2%, while the exotic and crossbred accounts for the remaining 8.8%. Although ticks and tick-borne diseases are widespread in Malawi, no molecular study has been conducted to investigate the tick-borne Anaplasmataceae and piroplasms infecting cattle. To provide an insight into the current status of tick-borne pathogens (TBPs) of cattle, a molecular survey was conducted in the central and southern regions of Malawi. A total of 191 cattle of which 132 were Malawi zebu, 44 were Holstein F
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viral respiratory infections are a common cause of acute exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and asthma. We conducted a multicenter prospective study to determine the differences in the spectrum of viruses between adults with asthma exacerbations and AECOPD and assessed the prevalence and impact of human rhinovirus (HRV)-C in adults, which is more pathogenic in children with asthma than other HRV species.
METHODS: Nasopharyngeal and serum samples and clinical information were collected from 64 outpatients with adult asthma exacerbations and 44 outpatien
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Describe the diagnostic characteristics of a conventional multiplex PCR for the diagnosis of S. stercoralis, N. americanus and Ancylostomas spp.
METHODS: Fecal samples were collected from a cross-sectional study in Orán department, Salta province, Argentina. The stool samples were analyzed using concentration-sedimentation, Harada Mori, McMaster, and Baermann techniques. DNA was extracted from 50 mg fecal sample using the FastPrep® Spin Kit for Soil. Three pairs of primers were used for the amplification of three products of 101, 330, and 577 base pairs (bp) for S. stercoralis, N.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Гантавирусная инфекция возникает в результате вдыхания аэрозольных экскрементов, включая мочу, фекалии и слюну инфицированных грызунов. Остается проанализировать наличие вируса Гантаан (HTNV) РНК или инфекционных частиц в образцах мочи пациентов с геморрагической лихорадкой с почечным синдромом (HFRS). Мы собрали четыре образца мочи и сыворотки для пациентов Армии Республики Корея (ROKA) с HFRS. Мы провели секвенирование следующего поколения на основе PCR (NGS) для получения последовательности геномов клинических HTNV в образцах мочи, содержащих ультранизкое количество вирусных геномов. Эпидем
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We retrospectively evaluated the pathogens in the cerebrospinal fluid (CSF) of pediatric meningitis/encephalitis (M/E) by FilmArray meningitis/encephalitis panel (FA-MEP), and the characteristics of children showing positive and negative FA-MEP results.
METHOD: FA-MEP along with conventional tests (bacterial/viral cultures, and polymerase chain reaction tests) was performed in children who presented symptoms of M/E. Clinical and laboratory data were reviewed to evaluate the characteristics of children with pathogens detected by FA-MEP.
RESULTS: The CSF specimens from 110 pediatri
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Community-associated acquisition of extended-spectrum beta-lactamase- (ESBL) and carbapenemase-producing Enterobacteriaceae has significantly increased in recent years, necessitating greater inquiry into potential exposure routes, including food and water sources. In high-income countries, drinking water is often neglected as a possible source of community exposure to antibiotic-resistant organisms. We screened coliform-positive tap water samples (n = 483) from public and private water systems in six states of the United States for blaCTX-M, blaSHV, blaTEM, blaKPC, blaNDM, and blaOXA-48-type g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multiplex molecular panels are relentlessly replacing conventional methods for the detection of enteric pathogens from stool samples in clinical and research laboratories. Here we evaluated four commercial multiplex real-time PCR assays for the detection of Cryptosporidium hominis/parvum, Giardia duodenalis and Entamoeba histolytica.
METHODS: The diagnostic performance of the Gastroenteritis/Parasite Panel I (Diagenode), the RIDAGENE Parasitic Stool Panel (R-Biopharm), the Allplex Gastrointestinal Parasite Panel 4 (Seegene) and the FTD Stool Parasites (Fast Track) real-time PCR me
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования