Liver progenitor-like cells (LPLCs) are essential for liver regeneration during some injury process, yet their epigenetic characters remain poorly understood. Using single-nucleus assay for transposase-accessible chromatin sequencing (snATAC-seq), we profiled chromatin accessibility in a mouse model of 3,5-diethoxycarbonyl-1,4-dihydrocollidin (DDC) diet-induced cholestasis at six time points: homeostasis (D0), injury (D8, D17), and repair (R2, R7, R21). We analyzed 75,452 high-quality nuclei, identifying 15 liver cell types, including LPLCs. Among 221,845 accessible chromatin regions, 192,079
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Редактирование генома гематополиетических стволовых клеток (HSC) представляет собой терапевтический вариант для ряда гематологических генетических заболеваний, поскольку ГПСЦ обладают потенциалом для самовосстановления и дифференциации по всем линиям кровеносных клеток. В настоящем обзоре представлены достижения в области редактирования генома в HSC с использованием аденовирусных векторов в качестве средств доставки. Мы сосредоточимся на модифицированных аденовирусных векторах, находящихся в зависимости от капсида, которые лишены всех вирусных генов и поэтому демонстрируют улучшенный профиль б
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxiella burnetii, an obligate intracellular Gram-negative bacterium, is the etiological agent of Q fever. This work takes advantage of a hypersensitive Escherichia coli genetic system to identify genes involved in resistance to nitrosative stress imposed by reactive nitrogen intermediates. Among the ten candidate genes identified, the transposase, UvrB and DNA topoisomerase IV are involved in DNA transaction; the sigma-32 factor and the putative DNA-binding protein may be involved in transcriptional regulation; IF-2 is involved in protein translation; malate dehydrogenase and carbamoyl-phosph
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Type 2 diabetes is associated with accelerated vascular complications such as hypertension and atherosclerosis. Phenotypic switching of vascular smooth muscle cells (SMCs), a major driver of these complications, is enhanced in diabetes. Despite adequate glycemic control, SMC dysfunction can persist due to metabolic memory of prior hyperglycemia. However, the mechanisms are unclear. Here, leveraging single-cell multiomics, we examined the effect of glucose normalization on transcriptomic and epigenomic changes associated with SMC phenotypic transition in type 2 diabetes mice.
METHO
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute myeloid leukemia is a hematological malignancy characterized by acquired genomic aberrations. Mutations in the FMS-like tyrosine kinase 3 gene cause constitutive activation of downstream signaling pathways, thereby driving disease progression and conferring a poor prognosis. Gilteritinib, a tyrosine kinase inhibitor, is a promising treatment for FMS-like tyrosine kinase 3-mutated acute myeloid leukemia. However, gilteritinib resistance remains a significant concern, and its underlying mechanisms are not yet understood.
CASE PRESENTATION: A 65-year-old Japanese male patient w
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Surviving cells in the postinfarction border zone are subjected to intense fluctuations of their microenvironment. Recently, border zone cardiomyocytes have been specifically implicated in cardiac regeneration. Here, we defined their unique transcriptional and regulatory properties, and comprehensively validated new molecular markers, including Nppb, encoding B-type natriuretic peptide, after infarction.
METHODS: Transgenic reporter mice were used to identify the Nppb-positive border zone after myocardial infarction. Transcriptome analysis of remote, border, and infarct zones and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recently, production of 16S rRNA methylases by Gram-negative bacilli has emerged as a novel mechanism for high-level resistance to aminoglycosides by these organisms in a variety of geographic locations. Therefore, the spread of high-level aminoglycoside resistance determinants has become a great concern.
METHODS: Between January 2006 and July 2008, 680 distinct Escherichia coli clinical isolates were collected from a teaching hospital in Wenzhou, China. PCR and DNA sequencing were used to identify 16S rRNA methylase and extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) genes, including arm
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a complex neurodegenerative disorder where environmental factors play a predominant role in sporadic cases. While environmental toxins are implicated in PD pathogenesis via epigenetic pathways, the specific alterations in chromatin accessibility induced by these toxins remain poorly characterized. To address this gap, we established in vitro models using the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y, a well-established neuronal model, exposed to the PD-associated environmental toxins rotenone and MPP⁺. We performed RNA sequencing (RNA-seq) to profile the transcriptome a
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, the assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-Seq) has become a fundamental tool of epigenomic research. However, it is difficult to perform this technique on frozen samples because freezing cells before extracting nuclei can impair nuclear integrity and alter chromatin structure, especially in fragile cells such as neurons. Our aim was to develop a protocol for freezing neuronal cells that is compatible with ATAC-Seq; we focused on a disease-relevant cell type, namely motor neurons differentiated from induced pluripotent stem cells (iMNs) from a patien
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our increasingly aging society leads to a growing incidence of neurodegenerative diseases. So far, the pathological mechanisms are inadequately understood, thus impeding the establishment of defined treatments. Cell-based additive gene therapies for the increased expression of a protective factor are considered as a promising option to medicate neurodegenerative diseases, such as age-related macular degeneration (AMD). We have developed a method for the stable expression of the gene encoding pigment epithelium-derived factor (PEDF), which is characterized as a neuroprotective and anti-angiogen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many genes have been linked to autism. However, it remains unclear what long-term changes in neural circuitry result from disruptions in these genes, and how these circuit changes might contribute to abnormal behaviors. To address these questions, we studied behavior and physiology in mice heterozygous for Pogz, a high confidence autism gene. Pogz+/- mice exhibit reduced anxiety-related avoidance in the elevated plus maze (EPM). Theta-frequency communication between the ventral hippocampus (vHPC) and medial prefrontal cortex (mPFC) is known to be necessary for normal avoidance in the EPM. We f
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Strict adherence to GMP guidelines and regulatory compliance is crucial when transitioning from research to clinical-grade production of ATMPs like CAR T cells. The success of CAR T cell therapy in treating hematological malignancies highlights the need for closed or automated systems to ensure quality and efficacy. Recent evidence also suggests that ex vivo culture conditions can significantly impact CAR T cell functionality.
METHODS: We present our optimized methodology for expanding Sleeping Beauty transposon-engineered Chimeric Antigen Receptor-Cytokine-Induced Killer (CARCIK)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The success of gene transfer has been demonstrated in many of vertebrate species, whereas the efficiency of producing transgenic animals remains pretty low due to the random integration of foreign genes into a recipient genome. The Sleeping Beauty (SB) transposon is able to improve the efficiency of gene transfer in zebrafish and mouse, but its activity in tilapia (Oreochromis niloticus) has yet to be characterized. Herein, we demonstrate the potential of using the SB transposon system as an effective tool for gene transfer and insertional mutagenesis in tilapia. A transgenic construct pT2/tiH
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With mounting evidence that Vibrio campbellii can act as a causative agent, acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) represents a ser … howed that pathogenic strains tend to cluster based on shared mobile genetic elements, particularly transposases located near toxin genes, underscoring the role of horizontal gene transfer in virulence acquisition. Although all strains displayed a broad distribution of antibiotic-resistance genes, pathogenicity did not consistently correlate with their presenc …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing number of Chromobacterium haemolyticum human infection reports, especially in tropical regions and connected with environment … on and cell invasion. Secretion systems, including type III, were detected. A significant number of transposases and genomic islands were predicted in C. haemolyticum, in some cases above the average reported for Gram-negative bacterial genomes. We conclude that C. haemolyticum strains, including those of environmental origin, present a noteworthy collection o …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
erm(A) subclass erm(TR), a common macrolide resistance determinant in Streptococcus pyogenes but quite rare in Streptococcus pneumoniae, was … ere found. Downstream of erm(TR), there were ORFs homologous to a spectinomycin phosphotransferase, transposases, and a relaxase. Since the genomic sequence of S. pyogenes MGAS10750 carrying erm(TR) became available, comparison between the erm(TR)-containing genetic elements in AP200 and in MGAS10750 was performed. The region flanking erm(TR) in MGAS10750 show …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We fully annotated two large plasmids, pMOL28 (164 open reading frames [ORFs]; 171,459 bp) and pMOL30 (247 ORFs; 233,720 bp), in the genome … eins, some new heavy metal resistance proteins (czcJ, mmrQ, and pbrU), membrane proteins, truncated transposases, conjugative transfer proteins, and many unknown proteins. Five genes on each plasmid were down-regulated; for one of them, chrI localized on pMOL28, the down-regulation occurred in the presence of five cations. We observed multiple cross-responses …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The complete genome sequences available for eight species of Rickettsia and information for other near relatives in the Rickettsiales includ … aplasmataceae, supporting its placement in a unique genus. Like Rickettsia felis, Orientia has many transposases and ankyrin and tetratricopeptide repeat domains. Orientia shares the important ATP/ADP translocase and proline-betaine transporter multigene families with Rickettsia, but has more gene families that may be involved in regulatory and transporter res …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe the characterization of a new insertion sequence, IS1515, identified in the genome of Streptococcus pneumoniae I41R, an unencapsulated mutant isolated many years ago (R. Austrian, H. P. Bernheimer, E. E. B. Smith, and G. T. Mills, J. Exp. Med. 110:585-602, 1959). A copy of this element located in the cap1EI41R gene was sequenced. The 871-bp-long IS1515 element possesses 12-bp perfect inverted repeats and generates a 3-bp target duplication upon insertion. The IS encodes a protein of 271 amino acid residues similar to the putative transposases of other insertion sequences, namely IS…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Francisella halioticida is a recently recognized pathogen affecting molluscs. In Europe, its presence has been documented within mussel popu … TssK, DotU, IglE, and IglH), together with several hypothetical proteins, and flanked by IS3 family transposases. Additional virulence-associated genes were detected, including transcriptional and global regulators, oxidative stress and detoxification genes, and metallopeptidases. These findings improve understanding of the occurrence, diversity, and genomic f …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования