Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) remains a highly aggressive malignancy with a poor prognosis and limited effective treatment options. Our study comprehensively explores the complex role of programed cell death (PCD) mechanisms in PDAC development, examining 18 distinct PCD pathways and their genetic underpinnings. Using an advanced machine learning framework incorporating 429 algorithmic variations, we have developed an innovative PCD-based molecular signature that demonstrates robust prognostic capabilities. This signature exhibits superior performance across diverse patient cohorts,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: High-throughput sequencing uncovers how B-cells adapt in response to antigens by generating B-cell-receptor (BCR) sequences at an unprecedented scale. As BCR datasets grow to millions of sequences, using efficient computational methods becomes crucial. One important aspect of antibody sequence analysis is detecting clonal families or clusters of related sequences, whether they come from immunization, synthetic-libraries or even ML-generated datasets.
RESULTS: We introduce deepNGS Navigator, a computational tool that leverages language models and contrastive learning to transform a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Depression during pregnancy and postpartum poses significant risks to both maternal and child well-being. The underlying biological mechanisms are unclear, but epigenetic variation could be exploited as a plausible candidate for early detection. We investigated whether DNA methylation signatures are associated with antenatal depressive symptoms (ADS) and whether early alterations in methylation patterns could be used to predict postpartum depressive symptoms (PDS). 201 pregnant women in early pregnancy, without a prior history of depressive disorders, from the STratification of Risk of Diabete
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psychoactive substances used for recreational purposes have mind-altering effects, but systematic evaluation of these effects is largely limited to self-reports. Automated analysis of expressed language (speech and written text) using natural language processing (NLP) tools can provide objective readouts of mental states. In this pre-registered systematic review, we investigate findings from applying the emerging field of computational linguistics to substance use with specific focus on identifying short-term effects of psychoactive drugs. From the literature identified to date, we note that a
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Renal resistance (RR) measured during hypothermic machine perfusion (HMP) is used to assess donor kidney quality and guide transplantation decisions. However, its clinical reliability and relationship with donor factors remain unclear.
METHODS: This scoping review and meta-analysis evaluate the variability, determinants, and predictive value of RR during HMP. A systematic search of PubMed, Embase, Web of Science, and Cochrane Library (July 2024) identified 49 primary studies reporting RR in perfused human kidneys. The risk of bias was assessed using the ROBINS-I tool. Meta-analyse
СтатьяScoping ReviewМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The emergence of connectomics in neurosurgery has allowed for construction of detailed maps of white matter connections, incorporating both structural and functional connectivity patterns. The advantage of mapping cerebral vascular lesions to guide surgical approach shows great potential. We aim to identify the clinical utility of connectomics for the surgical treatment of pediatric arteriovenous malformations (AVMs).
CASE PRESENTATION: We present two illustrative cases of the application of connectomics to the management of cerebral AVM in a 9-year-old and 8-year-old female. Us
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To characterize white matter geometric pathology in cerebellar subtype of multiple system atrophy (MSA-C) using director field analysis (DFA) and identify stage-specific biomarkers.
METHODS: We analyzed single-shell diffusion MRI (b = 1000) in 31 MSA-C patients (15 early-, 16 late-stage) and 33 controls. DFA quantified axonal geometry (splay/bend/twist), complemented by fixel-based analysis (FBA) and brainstem volumetry. Group comparisons used threshold free cluster enhancement (TFCE) (p < 0.05 FWE-corrected). DFA-altered regions were correlated with clinical scores. AutoGluon evaluated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Oral anticoagulation (OAC) is key in atrial fibrillation (AF) thromboprophylaxis, but Spain lacks substantial real-world evidence. We aimed to analyze the prevalence, clinical characteristics, and treatment patterns among patients with AF undertaking OAC, using natural language processing (NLP) and machine learning (ML).
MATERIALS AND METHODS: This retrospective study included AF patients on OAC from 15 Spanish hospitals (2014-2020). Using EHRead® (including NLP and ML), and SNOMED_CT, we extracted and analyzed patient demographics, comorbidities, and OAC treatment from electron
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Most people experience low back pain (LBP), and it is often ongoing or recurrent. Contemporary research knowledge indicates individual's pain beliefs have a strong effect on their pain experience and management. This study's primary aim was to determine the discourses (patterns of thinking) underlying people's beliefs about what causes their LBP to persist. The secondary aim was to investigate what they believed was the source of this thinking.
METHODS: We used a primarily qualitative survey design: 130 participants answered questions about what caused their LBP to persist, and wh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Millions of women are suffering from breast cancer, which can be treated effectively if it is detected early. Mammography is broadly recognized as an effective imaging modality for the early detection of breast cancer. Computer-aided diagnosis (CAD) systems are very helpful for radiologists in detecting and diagnosing abnormalities earlier and faster than traditional screening programs. An important step of a CAD system is feature extraction. This research gives a comprehensive study of the effects of different features to be used in a CAD system for the classification of masses. The features
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug resistance significantly impairs the efficacy of AIDS therapy. Therefore, precise prediction of resistant viral mutants is particularly useful for developing effective drugs and designing therapeutic regimen. In this study, we applied a structure-based computational approach to predict mutants of the HIV-1 protease resistant to the seven FDA approved drugs. We analyzed the energetic pattern of the protease-drug interaction by calculating the molecular interaction energy components (MIECs) between the drug and the protease residues. Support vector machines (SVMs) were trained on MIECs to c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis involves dysregulated host responses with mitochondrial dysfunction as a key mechanism, yet its immune cell landscape and clinical utility are unclear.
METHODS: We integrated five GEO datasets (GSE65682, GSE95233, GSE54514, GSE26440, GSE26378) comprising 1,256 samples. Mitochondrial dysfunction-related genes were identified through differential expression analysis and WGCNA. Ten machine learning algorithms were compared to construct an optimal diagnostic model. NMF clustering defined sepsis subtypes, and a mitochondrial dysfunction score (MAS) was developed. Single-cell RNA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Ankylosing Spondylitis (AS) and inflammatory bowel disease (IBD) exhibit substantial pathophysiological overlap, including dysregulated innate immunity, barrier dysfunction, and Th17-mediated inflammation. However, whether Na+ overload-related genes (NRGs) exhibit shared transcriptional alterations in IBD and AS remains unclear. This study aimed to characterize the expression patterns of NRGs across IBD and AS and to identify candidate genes associated with both diseases. Methods: Differential expression analysis was performed to identify differentially expressed NRGs (DE-NRGs) in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-speed flow visualization provides imaging data containing quantitative information about cavitating-flow dynamics. Accurate determination of attached-cavity length is essential for characterizing cavitation regimes and validating mathematical models. In this study, an advanced image-processing algorithm for semi-automated analysis of cavitation patterns near hydrofoils is proposed. High-speed visualization data obtained for cavitating flow around a NACA0012 hydrofoil in a slit channel were used as input to the algorithm. The developed approach includes hydrofoil suppression, Otsu-based im
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer (BRCA) is a heterogeneous disease. Accurate prognosis and molecular subtypes are critical for personalized treatment in BRCA. This study aimed to identify prognostic subtypes of BRCA based on features derived from pathological images and to explore their potential molecular and cellular mechanisms using spatial transcriptomics (ST) and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq).
METHODS: Hematoxylin and eosin (H&E)-stained images were obtained from the TCGA-BRCA dataset using the OTSU algorithm. Pathological features were extracted using PyRadiomics. Feature selection wa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Africa has the highest global sepsis burden. Yet, sepsis treatment guidelines, including those for vasopressor use, incorporate data from high-income settings. We aimed to determine patterns of vasopressor use among adults admitted to hospital with sepsis in East Africa.
DESIGN: Retrospective cohort study.
SETTING: One hospital in Uganda and two hospitals in Rwanda.
PATIENTS: Adults admitted to hospital with sepsis, defined as suspected infection and greater than or equal to 2 quick Sequential Organ Failure Assessment criteria.
INTERVENTIONS: None.
MEASUREMENTS AND MAIN RESULT
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic plasticity, the ability of cells to dynamically adapt their metabolic pathways in response to changing environments, is a hallmark of rheumatoid arthritis (RA) pathogenesis and plays a critical role in immune dysfunction. However, scalable methods to quantify inter-pathway crosstalk in RA remain lacking. To address this gap, we present MMP3C v2, an updated network-based framework that integrates gene expression with protein-protein interaction network topology to compute directed pairwise metabolic plasticity (PMP) scores. We applied MMP3C v2 to ~3400 bulk transcriptomes (RA, osteoar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation was critically involved in the occurrence and development of diabetic retinopathy (DR), but the clinical diagnostic value and mechanism remains unclear. This study aimed to identify and validate the biomarkers associated with DNA methylation in DR.
METHODS: Public databases provided the data used in this study. The biomarkers associated with DNA methylation in proliferative diabetic retinopathy (PDR) and non-proliferative diabetic retinopathy (NPDR) were identified by differential expression analysis, protein-protein interaction network construction, mendelian rand
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic architecture of primary open-angle glaucoma (POAG), a leading cause of irreversible blindness, remains largely unexplained due to the reliance of previous genome-wide association studies (GWAS) on imprecise phenotypes from electronic health records. Here, we overcome this with a disease-trained, task-transfer machine learning (ML) framework that learns glaucoma-related damage patterns from a large clinical repository of 8,323 glaucoma patients. We showed that ML optical coherence tomography (OCT)-derived endophenotypes trained on 18,985 OCT scans from these patients identified nove
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure to air pollution significantly elevates the risk of disease among urban populations. Improving city air quality requires not only traditional emission reduction strategies but also a focus on the intricate impacts of the urban built environment and meteorological elements. The complexity and diversity of factors within the urban built environment pose significant challenges to pollution control. This study employs machine learning to predict the spatial distribution of inhalable particulate matter (PM10) and fine particulate matter (PM2.5), integrating the clustering of pollutant-emit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования