PURPOSE: The purpose of this study was to identify the genes, biochemical signaling pathways, and biological themes involved in the pathogenesis of retinopathy of prematurity (ROP).
METHODS: Next-generation sequencing (NGS) was performed on the RNA transcriptome of rats with the Penn et al. (Pediatr Res 36:724-731, 1994) oxygen-induced retinopathy model of ROP at the height of vascular abnormality, postnatal day (P) 19, and normalized to age-matched, room-air-reared littermate controls. Eight custom-developed pathways with potential relevance to known ROP sequelae were evaluated for significa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In medico-legal literature, the notion of the "dignity of the corpse" is frequently used as a narrative device, almost romantic in nature, aimed at highlighting the values attributed to it and thereby justifying its defense. The most common explanations tend to focus on its strictly practical effects (in relation to the living), either by pointing to a certain inviolability or by emphasizing some consequences at a symbolic level. Intentionally or not, some of these theories undertake the bold task of explaining the consequences of a phenomenon (the death/dead binomial) while disregarding the s
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Этот набор данных содержит транскриптивные и функциональные аннотационные данные, полученные из тканей спинного мозга мышей с экспериментальным аутоиммунным энцефаломиелитом (EAE), обработанным GV1001, т.е. Для выявления дифференциально выраженных генов (DEG) между группами GV1001-обработанными и обработанными транспортными средствами была проведена последовательность навалом РНК. Полученные в результате ДЭГ были подвергнуты анализу на предмет обогащения траектории Ген Онтологического процесса (GOBP) и KEGG и были дополнительно аннотированы по типам клеток с использованием справочных одноклето
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Optic nerve head (ONH) astrocytes provide structural and metabolic support to neuronal axons in developmental, physiological, and pathological progression. Mechanosensitive properties of astrocytes allow them to sense and respond to mechanical cues from the local environment. We confirmed that ONH astrocytes express the mechanosensitive ion channel Piezo1 in vivo. By manipulating Piezo1 knockdown or overexpression in vitro, we found that Piezo1 is necessary but insufficient for ONH astrocyte proliferation. Loss of Piezo1 can lead to cell cycle arrest at G0/G1 phase, a possible mechanism involv
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrium decidualization is a complex biological process, which includes the interplay of transcription factors, cytokines, cell cycle regulators, and other signaling pathways. However, the underlying molecular mechanisms of this process are not fully elucidated to date. In this study, we aimed to investigate the possible association between autophagy and recurrent implantation failure (RIF). A total of 81 genes were downregulated and 231 genes were upregulated in the RIF group compared with the control group, and the differences were statistically significant (p < 0.05). Further, Gene Onto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiomic studies are increasingly performed to gain a deeper understanding of molecular processes occurring in a biological system, such as the complex microbial communities (i.e., microbiota) that reside the distal gut. While a combination of metabolomics and proteomics is more commonly used, multiomics studies including peptidomcis characterization are less frequently undertaken. Here, we investigated three different extraction methods, chosen for their previous use in extracting metabolites, peptides, and proteins, and compared their ability to perform metabolomic, peptidomic, and proteomi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Although various strategies exist for chronic constipation therapy, the pathogenesis of chronic constipation is still not completely understood. The aim of this exploratory experimental study is to elucidate alterations of the autonomous enteric nervous system at the molecular level in patients with obstructed defecation, who represent one of the most predominant groups of constipated patients.
METHODS: Full-thickness rectal wall samples of patients with obstructed defecation were analyzed and compared with controls. Differential gene expression analyses by RNA-Seq transcriptome prof
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
miR-200b plays a role in epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) in cancer. We recently reported abnormal expression of miR-200b in the context of human pulmonary hypoplasia in congenital diaphragmatic hernia (CDH). Smaller lung size, a lower number of airway generations, and a thicker mesenchyme characterize pulmonary hypoplasia in CDH. The aim of this study was to define the role of miR-200b during lung development. Here we show that miR-200b-/- mice have abnormal lung function due to dysfunctional surfactant, increased fibroblast-like cells and thicker mesenchyme in between the alveolar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Affective disorders are often accompanied by changes in motivation and anxiety. We investigated the genome-wide gene expression patterns in an animal model of depression that separates Wistar rats belonging into clusters of persistently high anxiety/low motivation to explore and low anxiety/high motivation to explore (low explorers and high explorers, LE and HE, respectively), in three brain regions previously implicated in mood disorders (raphe, hippocampus and the frontal cortex). Several serotonin-, GABA-, and glutamatergic genes were differentially expressed in LE- and HE-rats. The analysi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Protein depletion with acetonitrile and protein equalization with dithiothreitol have been assessed with success as proteomics tools for getting insight into the peritoneal dialysate effluent proteome. The methods proposed are cost-effective, fast and easy of handling, and they match the criteria of analytical minimalism: low sample volume and low reagent consumption. Using two-dimensional gel electrophoresis and peptide mass fingerprinting, a total of 72 unique proteins were identified. Acetonitrile depletes de PDE proteome from high-abundance proteins, such as albumin, and enrich
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increased vulnerability to mental health problems in adolescence is frequently reported but poorly understood, hampered by a rigid diagnostic system which fails to capture intertwining symptoms and only loosely aligns with biological axes of variability. Here, we reconceptualised the mental health symptoms of young adolescents in the ABCD cohort (N=11862) as a latent topology of overlapping symptom dimensions, using an unsupervised machine learning algorithm to establish how transdiagnostic dimensions co-occur and overlap within individuals. Combining this with a novel classification appro
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Bioinformatic analysis of the differentially expressed genes (DEGs) of the two groups of patients is the main aim of this project.
BACKGROUND: Neoadjuvant therapy is a method to treatment disease before local surgery. This method has been administrated to treatment rectum cancer; complete and incomplete responses are observed in patients.
METHODS: The DEGs of gene expression profiles of patients with complete and incomplete response to treatment with neoadjuvant therapy were explored from recorded data in Gene Expression Omnibus (GEO) database and evaluated via protein-protein interacti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-wide association studies (GWAS) have been used to explore the connections between genotypes and phenotypes by comparing the genotype frequencies of genetic changes in individuals with similar origins but distinct traits.
OBJECTIVES: The aim is to employ the GWAS catalog to identify and investigate the various correlations between genotypes and phenotypes of the REST gene.
METHODS: In this study, we utilized a large dataset of GWAS comprising 62,218,976 individuals in 112 studies and 122 associations with 122 traits (www.ebi.ac.uk/gwas/genes/REST) from European, Asian, Hisp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: The current study explored the crucial dysregulate proteins and biochemical pathways in gastric ulcer as its main aim.
BACKGROUND: Gastric ulcer as an acid-related gastrointestinal disease is known as one of the most public gastrointestinal disorders.
METHODS: A total of 100 proteins from STRING database were analyzed by Cytoscape and its applications to find the central proteins and the related biochemical pathways. Action map analysis was applied to explore regulatory relationships between the critical proteins.
RESULTS: Network analysis and gene ontology revealed that IL6, ALB, TNF,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bmp5 mutation can lead to microtia in mice models; however, its underlying mechanism is unclear. We analyzed circular RNA (circRNA) expression changes and associated gene regulation during embryonic development of the mouse's external ear after a point mutation occurred naturally in the BMP5 gene. The outer ear tissues of BMP5 short-eared mouse model embryos at embryonic day (E) 15.5 and E17.5 were subjected to RNA sequencing. Changes in the circRNA expression profile were detected using find_circ and the CiRi2 software. Differentially expressed circRNAs were annotated by Gene Ontology and Kyo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phthalate esters such as di-butyl phthalate (DBP) and di-ethyl hexyl phthalate (DEHP) used in personal care and consumer products and medical devices have potential to affect human health. We studied the effect of DBP and DEHP on critical enzymes of glucocorticoid biosynthesis pathway in the adrenal gland and pro-inflammatory cytokines in the serum in male Wistar rats. DEHP and DBP treatment altered the mRNA expression of enzymes of glucocorticoid biosynthesis pathway accompanied by a reduction in glucocorticoid production and elevation in the level of glucocorticoid regulated pro-inflammatory
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue virus (DENV) is the most widespread arbovirus, responsible for a wide range of clinical manifestations, varying from self-limited illness to severe hemorrhagic fever. Dengue severity is associated with host intense proinflammatory response and monocytes have been considered one of the key cell types involved in the early steps of DENV infection and immunopathogenesis. To better understand cellular mechanisms involved in monocyte infection by DENV, we analyzed the expression levels of 754 human microRNAs in DENV-infected THP-1 cells, a human monocytic cell line. Eleven human microRNAs sh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study determined the effect of orexin B (OXB) on the porcine endometrial transcriptome during the embryo attachment phase. Microarray analyses of gene ontology (GO), biological pathways, networks and differentially expressed genes (DEG) were performed. Orexin B influenced the expression of 887 genes (fold change > 1.2; p < .05): 620 genes were up-regulated, and 267 were down-regulated. The analysis of the relationship between DEG revealed that OXB interacts with genes linked with processes such as cell hormone binding, regulation of hormone levels, lipid transport, steroid metabolic proce
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermiogenesis in mammals is an exclusive process during which haploid round spermatids mature into spermatozoa in the testis. Any abnormality in the process of spermiogenesis may result in male infertility. The aim of the present study was to characterize the differentially expressed proteins between round and elongated spermatids in mice using label-free quantitative mass spectrometry. Of the 2411 proteins identified in this study, 333 were differentially expressed with a ≥10-fold change, including 208 upregulated proteins and 125 downregulated proteins in round spermatids relative to elonga
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Becker Muscular Dystrophy (BMD) is a neuromuscular disorder which is incurable. In this research protein interaction network of most associated proteins with BMD to provide better clarification of disorder underlying mechanism was investigated.
MATERIALS & METHODS: The related genes to BMD were retrieved via string database and conducted by Cytoscape and the related algorithms. The network centrality analysis was performed based on degree, betweenness, closeness, and stress parameters. Gene ontology and clustering were performed via ClueGO analysis.
RESULTS: DMD as the super-hub a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования