Aromatic amines are strongly carcinogenic. They are activated in the liver to give reactive nitrenium ions that react with nucleobases within the DNA duplex. The reaction occurs predominantly at the C8 position of the dG base, thereby giving C8-acetyl-aryl- or C8-aryl-dG adducts in an electrophilic aromatic substitution reaction. Alternatively, reaction with the exocyclic 2-NH2 group is observed. Although the C8 adducts retain base-pairing properties, base pairing is strongly compromised in the case of the N2 adducts. Here we show crystal structures of two DNA lesions, N2 -acetylnaphthyl-dG an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication of molecular information in nature is based on the synthesis of the backbone of the copy strand by polymerization of monomers bound to a template. An alternative strategy is to use a preassembled polymer backbone devoid of sequence information as the copy strand and to attach side chains in a sequence determined by binding to a template, i.e., base-filling. Base-filling strategies were investigated for template-directed synthesis of recognition-encoded melamine oligomers (REMO) using H-bond base-pairing interactions between 4-nitrophenol and phosphine oxide side chains. A template
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Synthetic efforts towards nucleosides, nucleotides, oligonucleotides and nucleic acids covalently mercurated at one or more of their base moieties are summarized, followed by a discussion of the proposed, realized and abandoned applications of this unique class of compounds. Special emphasis is given to fields in which active research is ongoing, notably the use of HgII -mediated base pairing to improve the hybridization properties of oligonucleotide probes. Finally, this minireview attempts to anticipate potential future applications of organomercury nucleic acids.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Major-groove RNA triple helices are conserved tertiary structures formed when a third strand inserts into the major groove of a classic double helix either via Hoogsteen base pairing or reverse Hoogsteen base pairing. These structures are widely distributed in eukaryotic, prokaryotic, and viral RNAs. This paper systematically summarizes the structural classification, stability-influencing factors, and identification methods of RNA triple helices. A growing body of evidence indicates that RNA triple helices are extensively involved in diverse biological processes, including RNA stability regula
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scaling relations between activation barriers and thermodynamic properties in surface catalysis require that the binding centers that stabilize products can be accessed at transition states (TS). These requirements are not met, in general, in heterolytic H-X (X = H, OH) cleavage steps mediated by concerted interactions with Lewis acid-base pairs in oxides. Density functional theory shows that residual covalency precludes stabilization of Hδ+-Hδ- fragments at the TS at the optimal binding modes available in the product state (PS). The distances required by electron sharing at the TS are replace
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Chlorhexidine gluconate (CHG)-coated gel pad dressings for central venous catheter (CVC) may prevent CVC-related bloodstream infections (CRBSI). However, real-world data showing beneficial effects in patients with hematologic malignancies are scarce.
METHODS: In a matched-pair analysis with data from a multicenter CVC registry, non-tunneled jugular and subclavian vein CVC in adults with hematologic malignancies or germ cell tumors (including patients receiving autologous hematopoietic stem cell transplantation [ASCT]) with CHG were compared with non-CHG dressings. The primary endp
Многоцентровое исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 3-fluoro-6-methylaniline nucleoside was synthesized and incorporated into an oligonucleotide, and its ability to form mercury-mediated base pairs was studied. UV melting experiments revealed increased duplex stability with thymine, guanine, and cytosine opposite to the probe and a clear nucleobase-specific binding preference (T > G > C > A). Moreover, the 3-fluoro group was utilized as a spin label that showed distinct 19F NMR resonance shifts depending on the complementary nucleobase, providing more detailed information on Hg(II)-mediated base pairing.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here we report the investigation of glycol nucleic acid (GNA), an acyclic nucleic acid analogue, as a modification of siRNA duplexes. We evaluated the impact of (S)- or (R)-GNA nucleotide incorporation on RNA duplex structure by determining three individual crystal structures. These structures indicate that the (S)-nucleotide backbone adopts a conformation that has little impact on the overall duplex structure, while the (R)-nucleotide disrupts the phosphate backbone and hydrogen bonding of an adjacent base pair. In addition, the GNA-T nucleobase adopts a rotated conformation in which the 5-me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, metabolite identification of chemical constituents of traditional Chinese medicine (TCM) has been extensively studied. However, due to the intricacy of metabolic processes and the low concentration of metabolites, identifying metabolites of TCM in vivo is still a tough work. Meanwhile, credibility of metabolite identification through mass spectrum technology has been called into question by reason of the lack of metabolite standards. In this study, ultra-high-performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight tandem mass spectrometry (UPLC-Q-TOF-MS) was u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
16S rRNA gene sequencing for characterization of microbiomes has become more common in poultry research and can be used to both answer specific research questions and help inform experimental design choices. The objective of this study was to use 16S rRNA gene sequencing to examine common sampling practices in broiler chicken studies such as: the required number of birds selected from a flock to adequately capture microbiome diversity, the differences between cecal pairs within the same bird, and whether cloacal swabs are representative of other alimentary tract (AT) locations. To do this, nin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic DNAs from human Cryptosporidium isolates previously typed by analysis of the 18S ribosomal DNA locus (Cryptosporidium parvum bovine genotype, C. parvum human genotype, Cryptosporidium meleagridis, and Cryptosporidium felis) were used to amplify the diagnostic fragment described by Laxer et al. (M. A. Laxer, B. K. Timblin, and R. J. Patel, Am. J. Trop. Med. Hyg., 45:688-694, 1991). The obtained 452-bp amplified fragments were sequenced and aligned with the homologous Cryptosporidium wrairi sequence. Polymorphism was exploited to develop a restriction fragment length polymorphism method
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small interfering RNA (siRNA) and microRNA (miRNA) are small RNAs of 18-25 nucleotides (nt) in length that play important roles in regulating gene expression. They are incorporated into an RNA-induced silencing complex (RISC) and serve as guides for silencing their corresponding target mRNAs based on complementary base-pairing. The promise of gene silencing has led many researchers to consider siRNA as an anti-viral tool. However, in long-term settings, many viruses appear to escape from this therapeutical strategy. An example of this may be seen in the case of human immunodeficiency virus typ
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of O6-methylguanine (m6G) on replication, in a partially double-stranded defined 25-base oligonucleotide, has been studied under nonlimiting conditions of unmodified dNTPs and over an extended time period, using the Klenow fragment of Escherichia coli DNA polymerase I. The sequence surrounding m6G has flanking cytosines (C-m6G-C), and the initial steady-state kinetics have been reported. When the primer was annealed so that the first base to be replicated was m6G, replication was virtually complete in approximately 5 min, although the reaction appears biphasic. When annealed with a
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Incorporation of a piperazino-modified 2'-amino-LNA monomer (PipLNA-T) into oligonucleotides conferred very high affinity and base-pairing selectivity towards complementary DNA and RNA strands. Furthermore, one PipLNA-T modification provided a robust nuclease resistance that safeguarded three neighbouring natural nucleosides from 3'-exonucleolytic degradation. These favourable properties render PipLNA-T a promising oligonucleotide modification for various biological applications.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have identified the catalytic domain within the sequence of the negative strand of the satellite RNA of tobacco ringspot virus. Minimum energy RNA folding calculations predict a two dimensional model with four major helical regions which are supported by mutagenesis experiments. This model for the catalytic complex consists of a 50 base catalytic RNA and a 14 base substrate RNA folded together in a type of hairpin two dimensional structure. Part of the recognition region between the catalyst and substrate is two helices of 6 bases and 4 bases respectively. Catalytic activity remains when th
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dilated cardiomyopathy (DCM) is characterized by dilation and impaired contraction of the left ventricle or both ventricles. Among hereditary DCM, the genetic causes are heterogeneous, and include mutations encoding cytoskeletal, nucleoskeletal, mitochondrial, and calcium-handling proteins. We report three severely affected males, in a four-generation pedigree, with DCM phenotype who underwent cardiac transplant. Cardiomegaly with marked biventricular dilation and fibrosis were noticeable histopathological findings. The affected males had tested negative on a 46-gene pancardiomyopathy panel. W
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reaction of the dimers [(Cp*MCl)2(μ-Cl)2] (Cp* = η5-C5Me5) with Ph2PCH2CH2NC(NH(p-Tolyl))2 (H2L) in the presence of NaSbF6 affords the chlorido complexes [Cp*MCl(κ2N,P-H2L)][SbF6] (M = Rh, 1; Ir, 2). Upon treatment with aqueous NaOH, solutions of 1 and 2 yield the corresponding complexes [Cp*M(κ3N,N',P-HL)][SbF6] (M = Rh, 3; Ir, 4) in which the ligand HL presents a fac κ3N,N',P coordination mode. Treatment of THF solutions of complexes 3 and 4 with hydrogen gas, at room temperature, results in the formation of the metal hydrido-complexes [Cp*MH(κ2N,P-H2L)][SbF6] (M = Rh, 5; Ir, 6) in which the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of lipid nanoparticle (LNP) based therapeutics for delivery of RNA has triggered the advance of new strategies for formulation, such as high throughput microfluidics for precise mixing of components into well-defined particles. In this study, we have characterised the structure of LNPs throughout the formulation process using in situ small angle x-ray scattering in the microfluidic chip, then by sampling in the subsequent dialysis process. The final formulation was investigated with small angle x-ray (SAXS) and neutron (SANS) scattering, dynamic light scattering (DLS) and cryo-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recognition-encoded melamine oligomers (REMO) are composed of an alternating piperazine-triazine backbone and side-chains equipped with either a H-bond donor (phenol, D) or a H-bond acceptor (phosphine oxide, A). Complementary homo-oligomers form stable duplexes in organic solvents, due to intermolecular base-pairing interactions between the phenol and phosphine oxide side-chains. For mixed-sequence oligomers, the major pathway that competes with duplex formation is folding due to intramolecular base-pairing interactions. Automated solid phase synthesis was used to prepare the self-complementa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The formation of higher-order structures in natural biopolymers, such as polypeptides and nucleic acids, is governed by sequence specificity and monomer chemistry. Although nucleic acids can assemble into programmable nanostructures through base-pairing interactions, their chemical diversity is limited to four nucleobases. DNA amphiphiles overcome this limitation by introducing orthogonal interactions through non-nucleosidic modifications. These amphiphiles self-assemble into diverse morphologies, such as spheres, fibers, or sheets, with closely packed, parallel DNA strands on their exterior.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования