Liquid biopsy is now an established component of precision oncology, and its clinical implementation to date has been led by cell-free DNA (cfDNA) and circulating tumor DNA (ctDNA) assays. These assays report genomic alterations, yet they may be limited by low tumor fraction, reduced shedding in early disease, and incomplete representation of dynamic tumor biology. Non-coding RNAs (ncRNAs), including microRNAs (miRNAs), long non-coding RNAs (lncRNAs), circular RNAs (circRNAs), and emerging small or poorly annotated RNA species, provide a complementary layer because they can reflect regulatory
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The reverse transcriptase (RT) region of the hepatitis B virus (HBV) is the target of antiviral treatment. However, the discrepancy in RT mutations between nucleos(t)ide analogue (NA)-treated and -untreated chronic hepatitis B (CHB) patients is un clear.
METHODS: Serum samples were collected from 119 NA-treated and 135 NA-untreated patients. The sampling time was decided by the clinician. Full-length HBV RT regions were amplified using nest polymerase chain reaction. The mutations within the RT region were analysed by direct sequencing.
RESULTS: The incidence of RT mutations in t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Initiation of RNA synthesis by bacterial RNA polymerase (RNAP) requires melting of promoter DNA, which is nucleated by the σ subunit during formation of the "open" promoter complex (RPo). The antibiotic lipiarmycin (Lpm) inhibits promoter melting by blocking access of the template DNA strand to the RNAP active-site cleft. Here we show that Escherichia coli RNAP holoenzymes containing either housekeeping σ(70), with a deletion in the region 3.2, or the stationary phase σ(S) subunits exhibited hypersensitivity to Lpm and increased cold sensitivity of RPo formation. Similar effects were produced
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5'-O-(4-fluorosulphonylbenzoyl)-esters of ribavirin (FSBR), adenosine (FSBA), guanosine (FSBG) and inosine (FSBI) were obtained by acylation of the 5'-OH of adenosine, guanosine, inosine, and ribavirin with 4-fluorosulphonylbenzoyl chloride (FSBCI) in HMPA. The above derivatives were tested as inhibitors of nucleoside triphosphatase (NTPase)/helicase activities of Flaviviridae: hepatitis C virus (HCV), West Nile virus (WNV), Japanese encephalitis virus (JEV) and dengue virus (DENV) and polymerase activity of HCV and WNV. When the unwinding activity of viral NTPase/helicases was tested under st
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Twenty-one patients with multiple sclerosis, chronic progressive type, were examined for DNA sequences homologous to a human retrovirus. Genomic DNA from peripheral blood mononuclear cells was analyzed for the presence of homologous sequences to the human T-cell leukemia/lymphoma virus type I (HTLV-I) long terminal repeat, 3' gag, pol, and env domains by the enzymatic in vitro gene amplification technique, polymerase chain reaction. Positive identification of homologous pol sequences was made in the amplified DNA from six of these patients (29%). Three of these six patients (14%) also tested p
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Orthonairovirus includes highly pathogenic tick-borne viruses such as the Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (CCHFV). A reverse genetics system is an indispensable tool for determining the viral factors related to pathogenicity. Tofla orthonairovirus (TFLV) is a recently identified virus isolated from ticks in Japan and our research has suggested that TFLV is a useful model for studying pathogenic orthonairoviruses. In this study, we successfully established a reverse genetics system for TFLV using T7 RNA polymerase. Recombinant TFLV was generated by transfecting cloned
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artificial genetic polymers (XNAs) have enormous potential as new materials for synthetic biology, biotechnology, and molecular medicine; yet, very little is known about the biochemical properties of XNA polymerases that have been developed to synthesize and reverse-transcribe XNA polymers. Here, we compare the substrate specificity, thermal stability, reverse transcriptase activity, and fidelity of laboratory-evolved polymerases that were established to synthesize RNA, 2'-fluoroarabino nucleic acid (FANA), arabino nucleic acid (ANA), hexitol nucleic acid (HNA), threose nucleic acid (TNA), and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The contributions of 23 insertion, deletion, or missense mutations within an 81-bp fragment of rpoB, the gene encoding the beta-subunit of the DNA-dependent RNA polymerase of Mycobacterium tuberculosis, to the development of resistance to rifamycins (rifampin, rifabutin, rifapentine, and KRM-1648) in 29 rifampin-resistant clinical isolates were defined. Specific mutant rpoB alleles led to the development of cross-resistance to all rifamycins tested, while a subset of mutations were associated with resistance to rifampin and rifapentine but not to KRM-1648 or rifabutin. To further study the imp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Platelets from 28 patients with the myeloproliferative diseases (MPD) polycythaemia vera (9), essential thrombocythaemia (6), myelofibrosis with myeloid metaplasia (5) and chronic myelogenous leukaemia (8) were examined for an RNA-dependent DNA polymerase activity using standardized conditions permitting highly reproducible quantitation. Low levels of activity were detected in platelets of normal individuals, but platelets of nearly all MPD patients (25/28) possessed higher levels. The polymerase activity correlated with diagnosis (P = 0.001) and did not correlate with platelet counts (P great
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anti-liver-kidney microsome-1 (LKM-1), which reacts with cytochrome P450 IID6 (CYP2D6), is an autoantibody present in autoimmune hepatitis type II, which affects primarily young patients. Recently, it has been shown some adult patients with chronic hepatitis C are also positive for anti-LKM-1. Thus, anti-LKM-1-positive patients can be classified into two subgroups: (1) those with autoimmune hepatitis type II and (2) those with chronic hepatitis C. We investigated the antigenic epitopes of CYP2D6 with which each of these two anti-LKM-1-positive subgroups reacted. Multiple deletion mutants of CY
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study describes our investigation on the prevalence and molecular identification of bartonellae from Rattus diardii and R. norvegicus in the urban areas of Malaysia. Of 95 rats investigated, Bartonella tribocorum, B. rattimassiliensis, B. coopersplainsensis, B. elizabethae, and B. queenslandensis were isolated from kidney and spleen homogenates of four rats. Bartonellae DNA was amplified from the rat organ tissues by using primers specific for the bartonellae RNA polymerase beta subunit (rpoB) gene in nine other rats. Sequence analysis of the rpoB gene fragments shows the identification o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аргентинская геморрагическая лихорадка (AHF) — эндемо-эпидемическая болезнь, вызванная вирусом Хунин. Этот отчет показывает, что анализ на основе обратного транскрипции (RT) PCR, разработанный в нашей лаборатории для обнаружения вируса Хунина в целых образцах крови, является чувствительным и конкретным. Эксперименты проводились дважды с использованием 94 клинических образцов, собранных в районе, где АХФ эндемична. Анализы на основе RT-PCR были сопоставлены с традиционными методологиями, включая анализ иммуносорбента, связанного с ферментами, тесты на нейтрализацию на табличках и иногда вирусну
Клиническое исследованиеСравнительное исследованиеКонтролируемое клиническое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The cellular innate immune system recognizing pathogen infection is essential for host defense against viruses. In parallel, viruses have developed a variety of strategies to evade the innate immunity. The hepatitis B virus (HBV), a DNA virus that causes chronic hepatitis, has been shown to inhibit RNA helicase RIG-I-mediated interferon (IFN) induction. However, it is still unknown whether HBV could affect the host DNA-sensing pathways. Here we report that in transiently HBV-transfected Huh7 cells, the stably HBV-producing cell line HepAD38, and HBV-infected HepaRG cells and primar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA polymerase mu (pol mu) is a novel error-prone DNA repair enzyme bearing significant structural homology with terminal deoxynucleotidyltransferase. Whereas other human error-prone DNA polymerases identified thus far show no preferential lymphoid tissue distribution, the highest levels of pol mu mRNA have been detected in peripheral lymphoid tissues, particularly germinal center B cells. Conceivably, up-regulation of the pol mu gene may be biologically significant in lymphomagenesis, especially in the development of B-cell non-Hodgkin's lymphomas (B-NHLs), because of enhanced error-prone DNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenoviruses cause a wide variety of human infectious diseases. Adenoviral conjunctivitis and epidemic keratoconjunctivitis are commonly associated with human species D adenoviruses. Currently, there is no sufficient or appropriate treatment to counteract these adenovirus infections. Thus, there is an urgent need for new etiology-directed therapies with selective activity against human adenoviruses. To address this problem, the adenoviral early genes E1A and E2B (viral DNA polymerase) seem to be promising targets. Here, we propose an effective approach to downregulate the replication of human
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ewing sarcoma (EwS) is a group of bone and soft-tissue cancers in children and young adults. Because EwS cells have pronounced sensitivity to radiation and chemotherapy-induced DNA damage, the oncoprotein EWS-FLI1 is likely to be involved in DNA repair. Here, we demonstrate that EWS-FLI1 causes a defect in microhomology-mediated end joining (MMEJ) repair. EWSR1 is a splicing factor that promotes the faithful splicing of the POLQ pre-mRNA, required for the expression of Polθ, a critical protein in the MMEJ pathway. Expression of EWS-FLI1 or depletion of EWSR1 causes increased POLQ exon 25 skipp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Pseudomonas aeruginosa PAO1, the expression of several virulence factors such as elastase, rhamnolipids, and hydrogen cyanide depends on quorum-sensing regulation, which involves the lasRI and rhlRI systems controlled by N-(3-oxododecanoyl)-L-homoserine lactone and N-butyryl-L-homoserine lactone, respectively, as signal molecules. In rpoN mutants lacking the transcription factor sigma(54), the expression of the lasR and lasI genes was elevated at low cell densities, whereas expression of the rhlR and rhlI genes was markedly enhanced throughout growth by comparison with the wild type and the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pretibial fibroblasts are considered to be targets of autoimmune attack in pretibial myxedema. A possibility of the pathogenesis of pretibial myxedema is that T cells, reacting with thyrotropin (TSH) receptor, will be targeting to the pretibial fibroblasts where, in the presence of antigen (TSH receptor), they will secrete various cytokines and stimulate fibroblasts to secrete glycosaminoglycans. We have demonstrated that TSH and TSH receptor antibody can bind to fibroblasts and the presence of RNA encoding the extracellular domain of the TSH receptor in fibroblasts derived from skin lesions o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study compares the identification, typing, and phylogenetic relationships of the most prevalent clinical Nocardia species in Spain, as determined via sequence analysis of their housekeeping genes gyrB and rpoB, with the results returned by the gold standard 16S rRNA method. gyrB and rpoB analyses identified Nocardia abscessus, N. cyriacigeorgica, N. farcinica, and the N. nova complex, species that together account for more than half of the human nocardiosis cases recorded in Spain. The individual discriminatory power of gyrB and rpoB with respect to intraspecies typing, calculated using t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the human immune response to newly developed or existing vaccines, or during infection/disease on a population scale, we have recently developed a dual-color Reverse Transcriptase Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (dcRT-MLPA) assay, which can rapidly profile mRNA expression of multiple host genes. dcRT-MLPA has a dynamic range and sensitivity comparable to real-time QPCR and RNA-Sequencing. Since this assay is high-throughput, it is an exceptionally suitable technique for monitoring host biomarkers in semi-large scale human cohorts, such as cross sectional studies
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.