Gene amplification is a relatively rare event in hematologic malignancies. The ABL gene on chromosome band 9q34 is a proto-oncogene and is the well-known translocation partner of the BCR gene on 22q11 giving rise to t(9;22)(q34;q11), which is the hallmark of chronic myeloid leukemia and is the most common chromosomal abnormality in adult acute lymphoblastic leukemia (ALL). Amplification of ABL is an exceedingly rare event, with only less than 5 cases reported in the literature. The p16(INK4a) (or CDKN2A) gene on 9p21 is a tumor suppressor gene, and deletion thereof is recently recognized as on…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytomegalovirus (CMV) causes severe systemic and tissue-invasive disease in immunocompromised patients, particularly solid organ and hematop … veloped a dual-step next-generation sequencing (NGS)-based clinical assay that utilizes full-length gene amplification by long-range PCR followed by shotgun sequencing for mutation analysis. This laboratory-developed test (LDT) achieved satisfactory performance with 96.4% accuracy, 100% precision, and an analytical sensitivity of 300IU/mL with 20% allele frequency. …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Familial adenomatous polyposis (FAP) is an autosomal dominant hereditary cancer syndrome characterized by hundreds to thousands of colorectal adenomatous polyps. Without treatment, progression to colorectal cancer is inevitable. Most pathogenic mutations in the APC gene were nonsense or frameshift mutations; however, some previous studies reported large deletions or duplications.
METHOD: We reviewed the results of APC gene analyses from January 2010 to December 2020. We analyzed the entire coding sequence of the APC gene by Sanger sequencing to detect genetic abnormalities. Moreov
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Today, the spread of vancomycin-resistant strains isolated from Enterococcus faecalis (E. faecalis) has become a major health concern worldwide. Therefore, it is essential to provide a rapid and sensitive assay for identifying vanA gene for timely and appropriate antimicrobial control of resistant enterococcal infections. For this purpose, a cross-sectional study was performed on different clinical specimens of enterococci from Imam Reza hospital, Kermanshah, Iran. The antimicrobial susceptibility testing was determined by disk diffusion and MIC methods. Triplex-PCR and duplex-LAMP assays were
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: According to The Cancer Genome Atlas (TCGA), around 9% of bladder carcinomas usually show abnormalities of the murine double minute 2 (MDM2) gene, but a few studies have been investigated them. We profiled MDM2 gene amplification in a series of urothelial carcinomas (UC) considering the molecular subtypes and expression of programmed death ligand 1 (PD-L1).
METHODS: 117 patients with muscle-invasive UC (pT2-3) without (N0) or with (N+) lymph-node metastases were revised. Only cases with availability of in toto specimens and follow-up were studied. Tissue microarray was built. p53, ER, R…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review mainly summarizes disease, immune-pathology and the clinical usefulness, advances, potential applications and limitations of new, cutting-edge technology (MG/MP-PCR and/or ARMS-MG/MP-PCR) in the detection of female genital tuberculosis (FGTB) disease and gene polymorphism among infertile patients. The investigation was set in the Department of Zoology, Osmania University and National Institute of Nutrition, Hyderabad, India. Desired articles were critically reviewed and analysed. Keywords and NET searches were conducted in all electronic databases starting from September, 2006. Ful
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two multiplex PCR enzyme immunoassays (PCR-EIAs) were developed for Staphylococcus aureus exotoxin gene screening as an alternative to the conventional biological assays, which depend on detectable amounts of toxins produced. One set of oligonucleotide primers and probes was designed to search for enterotoxin A to E genes (entA, entB, entC, entD, and entE), and the other one was designed to detect the staphylococcal exfoliative toxin genes (eta and etb) and the toxic shock syndrome toxin 1 gene (tst). Oligonucleotide primers were used as published previously, modified or newly developed to mee
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Milk-borne outbreaks remain a significant issue in low-income countries due to unhygienic practices. Currently, there are no known easily accessible and low-cost diagnostic tests that can detect Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi, the causative agent of typhoid fever, in raw milk samples at high specificity, sensitivity, and speed without preprocessing. Early detection of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi in food matrices is critical for preventing infection prior to consumption and reducing disease burden. Using colorimetric loop-mediated isothermal amplificatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The human genome contains approximately 3,200 near full-length autonomous human endogenous retroviral (HERV) genomes distributed across the 23 chromosomes. These autonomous HERV proviral genomes include long terminal repeats (LTRs) capable of promoting RNA transcription. In quiescent cells, most HERV loci remain transcriptionally silent. However, environmental changes, such as epigenetic remodeling of chromatin, can activate these silenced loci.
METHODS: To study HERV reactivation, we previously analyzed autonomous HERV expression patterns in monocytes isolated from peripheral blo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paracoccidioidomycosis is an important deep mycosis in Latin American countries. Its causative agents have been reclassified into five distinct species based on genetic differences: Paracoccidioides brasiliensis sensu stricto, Paracoccidioides americana, Paracoccidioides restrepiensis, Paracoccidioides venezuelensis and Paracoccidioides lutzii. In this study, we propose a new method, based on a nested PCR for partial alpha-tubulin gene amplification, as a tool for diagnosis and species differentiation directly from biological samples. The method could amplify the DNA of the five cultivable Par…
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
B. melitensis is the most pathogenic zoonotic species of Brucella transmitted to animals through fetal secretions, placenta, and vaginal discharges of infected animals and humans by ingesting unpasteurized milk, dairy products, and raw meat. Early detection of B. melitensis is essential for timely intervention and control of the disease. The gold standard diagnostic methods, such as culture, are time-consuming and may take several weeks aiding to the disease spread. Loop-mediated isothermal amplification assay (LAMP) is widely used to detect infectious pathogens. LAMP can be utilized as a rapi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus strains carrying enterotoxin A gene (sea) causes food poisoning and cannot be distinguished from non-pathogenic strains by the culture method. Here, we developed a rapid, specific and sensitive visual detection of sea using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) combined with nanogold probe (AuNP) or styryl dye (STR). LAMP-AuNP and LAMP-STR can detect as low as 9.7 fg (3.2 sea copies) and 7.2 sea copies, respectively, which were lower than PCR (97 fg or 32 sea copies). The excellent performance of these new assays was demonstrated in food samples using crude DNA ly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, a label-free fluorescence biosensor for simple detection of the HIV-1 gene was proposed by using toehold-mediated strand displacement reactions (TMSDRs) combined with a non-enzymatic target recycling amplification strategy. In this system, two TMSDRs were used. In the presence of the HIV-1 gene, an autocatalytic DNA machine can be activated. This leads to the generation of numerous free G-rich sequences, which can associate with a fluorescent dye N-methylmesoporphyrin IX (NMM) to yield an amplified fluorescence signal for the target detection. This sensing platform showed a high
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clonorchiasis is prevalent in the Far East, and a major health problem in endemic areas. Infected persons may experience, if not treated, serious complications such as bile stone formation, pyogenic cholangitis, and even cholangiocarcinoma. Early diagnosis and treatment are important to prevent serious complications and, therefore, the simple and reliable diagnostic method is necessary to control clonorchiasis in endemic areas, where resources for the diagnosis are limited.
METHODOLOGY/PRINCIPLE FINDINGS: The loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay has been applied for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay with its advantages of cost effectiveness, rapidity, and simplicity, has evolved as a sensitive and specific method for the detection of African trypanosomes. Highly sensitive LAMP reactions specific for Trypanosoma brucei rhodesiense or that recognize but do not discriminate between Trypanosoma brucei brucei, T. b. rhodesiense, Trypanosoma brucei gambiense, and Trypanosoma evansi have been developed. A sensitive LAMP assay targeting the T. b. gambiense 5.8S ribosomal RNA internal transcribed spacer 2 (5.8S-ITS2) gene is also available bu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Macrolide-streptogramin type B resistance (the MSB phenotype) is a multidrug resistance phenotype in Staphylococcus aureus conferred by the resistance gene msrA. However, bacteria having the MSB phenotype are susceptible to lincosamides and 16-membered ring macrolides, which makes profiling resistance genes necessary and urgent for timely and appropriate use of antimicrobials. In this study, the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay was optimized for prompt detection of the msrA gene. msrA gene sequences were obtained from the National Center for Biotechnology Information (NCBI)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Carrion' disease, caused by Bartonella bacilliformis, remains truly neglected due to its focal geographical nature. A wide spectrum of clinical manifestations, including asymptomatic bacteremia, and lack of a sensitive diagnostic test can potentially lead to a spread of the disease into non-endemic regions where competent sand fly vectors may be present. A reliable test capable of detecting B. bacilliformis is urgently needed. Our objective is to develop a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay targeting the pap31 gene to detect B. bacilliformis.
METHODS AND FINDINGS:
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HER2/neu is an oncogene encoding a type 1 tyrosine kinase growth factor receptor. Polysomy 17, gene amplification and HER2/neu protein overexpression are associated with a poor prognosis in transitional cell carcinomas (TCC) of the bladder. Due to the application of different laboratory techniques, the exact incidence of HER/neu abnormalities remains uncertain in TCC. Standardised laboratory techniques are therefore important in the determination of the HER2/neu status if an assessment of the potential value of anti-HER2/neu treatments in the clinical management of patients with TCC is to be m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Unverricht-Lundborg type of progressive myoclonus epilepsy (EPM1) is an autosomal recessive disorder that is caused by the dysfunction of the cystatin B (CSTB) gene product. In the vast majority of affected cases, mRNA transcription is impaired by a biallelic expansion of a dodecamer repeat within the 5'-untranslated region of the respective gene. Since this minisatellite contains exclusively G and C nucleotides, direct PCR analysis of allele expansion is extremely difficult and error prone. To circumvent these problems, we have developed a PCR assay that is based on the deamination of the
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review describes a novel method for increasing the effectiveness of inactivated enveloped whole-virus vaccines by targeting them for extensive uptake by antigen-presenting cells (APCs). Several inactivated whole-virus vaccines with dense glycan shields display suboptimal effectiveness because the multiple carbohydrate chains (glycans) on the virus mask immunogenic peptides and surround the virus with a negative electrostatic charge that decreases uptake by APCs. It is postulated that engineering such vaccinating viruses to present the carbohydrate antigen "α-gal epitope" on the glycan shi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.