Background and purpose. To investigate models developed using radiomic and dosiomic (multi-omics) features from planning and treatment imaging for late patient-reported dysphagia in head and neck radiotherapy.Materials and methods. Training (n = 64) and testing (n = 23) cohorts of head and neck cancer patients treated with curative intent chemo-radiotherapy with a follow-up time greater than 12 months were retrospectively examined. Patients completed the MD Anderson Dysphagia Inventory and a composite score ≤60 was interpreted as patient-reported dysphagia. A chart review collected baseline dy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lithium (Li) is one of the most effective drugs for treating bipolar disorder (BD), however, there is presently no way to predict response to guide treatment. The aim of this study is to identify functional genes and pathways that distinguish BD Li responders (LR) from BD Li non-responders (NR). An initial Pharmacogenomics of Bipolar Disorder study (PGBD) GWAS of lithium response did not provide any significant results. As a result, we then employed network-based integrative analysis of transcriptomic and genomic data. In transcriptomic study of iPSC-derived neurons, 41 significantly different
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
m5C, an important RNA modification, is closely associated with breast cancer; however, their causal relationship is unknown. We examined the relationship between m5C regulation and breast cancer. Genome-wide association study breast cancer data and expression quantitative trait loci of m5C regulatory factor genes in blood were collected. We explored the causal relationship among m5C regulatory genes, breast cancer susceptibility, and prognosis through Mendelian randomization. Single-cell RNA sequencing data from peripheral blood mononuclear cells of patients with breast cancer and healthy cont
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Radio-resistance hinders the effectiveness of radiotherapy for treating colorectal cancer (CRC) patients. Metadherin (MTDH) is proposed to exert a pivotal role in resistance to radiotherapy in various malignancies. This study aims to investigate the precise impact of MTDH on CRC radio-resistance.
METHODS: Through a fusion of 14 machine learning algorithms and SHapley Additive exPlanations (SHAP) interpretability analysis, we pinpointed MTDH as a pivotal gene implicated in radio-resistance mechanisms. Subsequently, we investigated MTDH expression in CRC tissues using single-cell RN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic syndrome (MetS) is a cluster of interconnected cardiometabolic risk factors with a substantial but incompletely characterized genetic basis. To identify novel genetic determinants, particularly rare variants, we here conducted a large-scale exome-wide association study in 367,188 individuals from the UK Biobank (78,300 cases and 288,888 controls). Single-variant analysis identified 74 independent loci, three of which correspond to rare variants in CARMIL2, ACTR6, and PLA2G12A without prior documented MetS association. Furthermore, gene-based burden testing pinpointed three key genes:
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Gymnema sylvestre (Retz.) R.Br. ex Sm. is a traditional herb widely used in Indian and Chinese ethnomedicine for diabetes and obesity management. Although its hypoglycemic and hypolipidemic effects have been extensively reported, a system-level understanding of how G. sylvestre modulates glucose-lipid metabolism has not been fully elucidated.
AIM OF THE STUDY: The study aimed to explore metabolic alterations associated with G. sylvestre intervention in type 2 diabetes mellitus using an integrated multi-omics strategy.
MATERIALS AND METHODS: A type 2 diabetic m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Uterine corpus endometrial carcinoma (UCEC) has significant inherent resistance to immunotherapy. The tumor microenvironment (TME) in UCEC is characterized by limited infiltration of T cells, which has been shown to be the cause of this resistance. Recent studies have indicated that dysregulation of splicing may be involved in tumor progression and immune evasion. However, the biological mechanisms underlying this phenomenon have not been fully understood.
METHODS: In the study, genome-wide association studies (GWAS), splicing quantitative trait loci (sQTL), and expression quantit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The global prevalence of multidrug-resistant bacteria has been rising at an alarming rate, posing a serious threat to both human and animal health. However, the mechanisms by which bacteria acquire antibiotic tolerance and subsequently develop resistance remain incompletely understood.
METHODS: In this study, Pasteurella multocida, a common pathogen in the animal husbandry industry, was exposed to enrofloxacin, and genome resequencing, transcriptomic, and metabolomic analyses were performed to elucidate the adaptive mechanisms of P. multocida under fluoroquinolone-induced stress.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Di-(2-ethylhexyl) terephthalate (DOTP), as an alternative to phthalate plasticizers, has been widely used in sensitive fields such as food packaging and medical devices. However, there remains a gap in the assessment of its systemic carcinogenic risk. This study systematically analyzed the potential carcinogenic mechanisms of DOTP by integrating network toxicology methods such as gene enrichment analysis, machine learning algorithms, molecular docking, single-cell sequencing, and spatial transcriptomics. We screened 24 core carcinogenic genes of DOTP using 11 topological algorithms, conducted
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Invasive Ductal Carcinoma (IDC), which is the most common histological subtype of breast cancer, is highly aggressive and progresses rapidly. Acyl-CoA thioesterase 7 (ACOT7) is a key regulator of cell survival, the cell cycle, and lipid and glucose metabolism. However, the mechanism of ACOT7 in IDC is still unclear. Our study aims to investigate the clinical significance of ACOT7 in IDC.
METHODS: A comparative analysis of ACOT7 expression in IDC and matched normal tissues was performed using the limma R package on datasets from GEO and TCGA. Prognostic evaluation was conducted usi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical utility of doxorubicin (DOX) is severely limited by dose-dependent cardiotoxicity, for which effective interventions remain scarce. Huangqi Guizhi Wuwu Decoction (HGWD) shows promising cardioprotective potential, but its mechanisms against DOX-induced cardiotoxicity (DIC) remain unexplored. This study explored the molecular mechanisms using an integrated metabolomics and transcriptomics approach. We identified 57 compounds in HGWD by liquid chromatography ion trap time-of-flight mass spectrometry (LC-IT-TOF/MS), and quantified five representative compounds for standardization. Mic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis is a life-threatening, heterogeneous syndrome with high mortality. This heterogeneity undermines current "one-size-fits-all" therapies and conventional biomarkers (e.g., PCT) lack prognostic power. A critical need exists to identify patient-specific endotypes and causal-driven therapeutic targets.
METHODS: We employed a synergistic multi-omics strategy to identify causal drivers of sepsis. First, we used single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) on peripheral blood mononuclear cells (GSE175453) to identify the most pathologically relevant immune cell subpopulation. Next, we us
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute liver failure due to Drug-induced liver injury (DILI-ALF) is a life-threatening syndrome with rapid progression and high mortality. Although oxidative stress and lipid peroxidation are implicated, the molecular mechanisms underlying DILI-ALF remain incompletely understood. This study aimed to explored the molecular mechanisms of DILI-ALF.
METHODS: We performed an integrated analysis combining proteomic profiling of liver tissues from patients with DILI-ALF, reanalysis of public single-cell transcriptomic data, and experimental validation in human liver tissues and an acetami
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Pediatric bone sarcomas, including osteosarcoma (OS) and Ewing sarcoma (ES), are aggressive malignancies with poor prognosis in the metastatic stage. Oxylipins, bioactive lipid mediators derived from polyunsaturated fatty acids (PUFAs), play a crucial role in inflammation, immunity, and cancer progression; however, their systemic profiles in pediatric sarcomas remain unexplored.
METHODS: We performed UPLC-MS/MS-based metabolomic profiling of plasma oxylipins and PUFAs in 52 pediatric sarcoma patients (29 OS, 23 ES) and 20 healthy controls. Transcriptomic data from public dataset
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the clinical differences between hemodialysis (HD) and peritoneal dialysis (PD) are well established, the specific biological mechanisms underlying these differences remain incompletely understood. We performed untargeted proteomic and transcriptomic analyses of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from healthy controls (CTRs) and patients with chronic kidney disease undergoing HD or PD. Key findings were validated in an independent cohort using standardized biomolecular techniques. Bioinformatic analysis identified 36 differentially expressed proteins and 19 transcripts between
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Carpal tunnel syndrome (CTS) is a common condition in pregnancy, yet reliable tools for identifying women at high risk-particularly those with gestational diabetes mellitus (GDM)-remain lacking. Although GDM shares metabolic features with type 2 diabetes, a recognised CTS risk factor, whether GDM itself causally increases CTS risk and through which molecular pathways has not been established.
METHODS: We used linkage disequilibrium score regression and two-sample Mendelian randomization across FinnGen and UK Biobank to evaluate the genetic correlation and causal effect of GDM on C
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Diabetic retinopathy (DR) is often recognized as a marker of systemic microvascular disease, but the metabolic links to other complications, such as diabetic nephropathy (DN), remain unclear. We aimed to identify systemic metabolic signatures shared by DR and DN and investigate their potential causal mechanisms.
METHODS: Multi-tissue metabolomic profiling of the retina, plasma, and kidney was performed in streptozotocin-induced diabetic mice. Clinical relevance was supported by public human DR and DN transcriptomic datasets. Causal relationships were assessed by two-sample Mendelian
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human papillomavirus (HPV) infection is a major contributor to cervical cancer (CC), yet the molecular mechanisms driving HPV-associated immune evasion remain largely undefined.
METHODS: Bulk RNA-seq (The Cancer Genome Atlas [TCGA]-CESC) and single-cell RNA-seq datasets (GSE171894, GSE197461) were analyzed to elucidate transcriptional and immune landscape differences between HPV-positive and HPV-negative cervical tumors. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using DESeq2. Functional enrichment analyses were conducted through gene set enrichment analysis (GSEA), gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cerebrospinal fluid (CSF) is a liquid biological medium immersing the brain and spinal canal. For patients with metastatic cancer from the lung, tumor cells release their cell-free DNA (cfDNA) into the CSF. We applied a nanopore single-molecule sequencing approach to analyze the fragmentation, methylation, and hydroxymethylation patterns present in CSF-derived cell-free DNA from patients with metastatic lung cancer to the brain. We compared the cancer cfDNA finding to non-cancer healthy controls and their CSF cell-free DNA. Among cancer patients, we observed enriched mono-nucleosome levels and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the role of ubiquitination-related genes in pancreatic cancer (PC) using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), spatial transcriptomics, and multi-omics approaches. scRNA-seq data (GSE155698) from PC samples identified 12 cell types, with endothelial cells exhibiting high ubiquitination scores (High_ubiquitin-Endo) and enriched interactions with fibroblasts/macrophages via WNT, NOTCH, and integrin pathways. Spatial transcriptomics (GSE235315) validated cell-type localization. Mendelian randomization (SMR) analysis prioritized TRIM9 as a PC-protective gene, downregulate
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.