BACKGROUND: Little is known about the functional mechanisms through which genetic loci associated with substance use traits ascertain their effect. This study aims to identify and functionally annotate loci associated with substance use traits based on their role in genetic regulation of gene expression.
METHODS: We evaluated expression Quantitative Trait Loci (eQTLs) from 13 brain regions and whole blood of the Genotype-Tissue Expression (GTEx) database, and from whole blood of the Depression Genes and Networks (DGN) database. The role of single eQTLs was examined for six substance use trait…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We here present the first genetic fine mapping of experimental autoimmune neuritis (EAN), the animal model of Guillain-Barré syndrome, in a rat advanced intercross line. We identified and refined a total of five quantitative trait loci on rat chromosomes 4, 10, and 12 (RNO4, RNO10, RNO12), showing linkage to splenic IFN-gamma secretion and disease severity. All quantitative trait loci were shared with other models of complex inflammatory diseases. The quantitative trait locus showing strongest linkage to clinical disease was Ean6 and spans 4.3 Mb on RNO12, harboring the neutrophil cytosolic fa…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Migraine is the most common brain disorder, affecting approximately 14% of the adult population, but its molecular mechanisms are poorly understood. We report the results of a meta-analysis across 29 genome-wide association studies, including a total of 23,285 individuals with migraine (cases) and 95,425 population-matched controls. We identified 12 loci associated with migraine susceptibility (P<5×10(-8)). Five loci are new: near AJAP1 at 1p36, near TSPAN2 at 1p13, within FHL5 at 6q16, within C7orf10 at 7p14 and near MMP16 at 8q21. Three of these loci were identified in disease subgroup analy
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative traits important to organismal function and fitness, such as brain size, are presumably controlled by many small-effect loci. Deciphering the genetic architecture of such traits with traditional quantitative trait locus (QTL) mapping methods is challenging. Here, we investigated the genetic architecture of brain size (and the size of five different brain parts) in nine-spined sticklebacks (Pungitius pungitius) with the aid of novel multilocus QTL-mapping approaches based on a de-biased LASSO method. Apart from having more statistical power to detect QTL and reduced rate of false p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To investigate the mitochondrial dysfunction-related genes and their regulatory mechanisms involved in primary open angle glaucoma (POAG), which is characterized by retinal ganglion cell loss.
METHODS: Multi-omic summary-data-based Mendelian randomization (SMR) integrating methylation quantitative trait loci (mQTL), expression quantitative trait loci (eQTL), and protein quantitative trait loci (pQTL) were performed for mitochondrial genes with genome-wide association studies (GWAS) of POAG and related traits [intraocular pressure (IOP), macular retinal nerve fiber layer thickness (mRNFL)…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Birds have a unique bone physiology, due to the demands placed on them through egg production. In particular their medullary bone serves as a source of calcium for eggshell production during lay and undergoes continuous and rapid remodelling. We take advantage of the fact that bone traits have diverged massively during chicken domestication to map the genetic basis of bone metabolism in the chicken. We performed a quantitative trait locus (QTL) and expression QTL (eQTL) mapping study in an advanced intercross based on Red Junglefowl (the wild progenitor of the modern domestic chicken) and Whit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genetic improvement of wool and growth traits is a major goal in the sheep industry, but their underlying genetic architecture r … for LW, and leukocytes and macrophages were the most relevant cells for CN. For the six traits, 54 quantitative trait loci (QTL) were identified covering 81 candidate genes on 21 ovine autosomes. Multiple candidate genes showed strong tissue-specific expression, e.g. BNC1 (associated with MFD) and CHRNB1 (LW) were specifically expressed in skin and muscle, respectively. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The discovery and use of genetic markers associated with carotenoid levels can help to exploit the genetic potential of maize for provitamin A accumulation more effectively. Provitamin A carotenoids are classes of carotenoids that are precursors of vitamin A, an essential micronutrient in humans. Vitamin A deficiency is a global public health problem affecting millions of people, especially in developing countries. Maize is one of the most important staple crops targeted for provitamin A biofortification to help alleviate vitamin A deficiency in developing countries. A genome-wide association
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To define shared genetic and multi-scale mechanisms underlying comorbidity between sick sinus syndrome (SSS) and atrial fibrillation (AF).
METHODS: We integrated genome-wide association study (GWAS) summary statistics for SSS and AF with Genotype-Tissue Expression (GTEx) expression and splicing quantitative trait loci (eQTL/sQTL), atrial single-cell and spatial transcriptomics, and epigenomics. We identified trait-relevant tissues and pathways, prioritized shared cell types, quantified genome-wide and local genetic sharing, detected joint loci by cross-trait meta-analysis, and link…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oil quality improvement is a primary target for rapeseed breeding, with particular emphasis on erucic acid. Although some QTLs for fatty acid metabolism have been identified, the genetic network of erucic acid remains poorly explored, except for FAE1. The present study constructed a high-density genetic map using an F2 population of 200 individuals from a cross between high-erucic and high-oleic parents and identified a novel QTL (HO/HE17) for erucic acid content, which was validated in the F2:3 population. Fine mapping refined HO/HE17 to a 552 kb region flanked by markers 17SNP2 and loc9 on c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the causal relevance of melatonin metabolism, which provides the biological basis for circulating melatonin levels, to specific depression symptom subtypes, we performed a targeted systematic review of melatonin metabolism pathways in the human brain and liver. Using two-sample Mendelian randomization (MR), we assessed the causal effects of metabolism pathways and/or individual genes on major depressive disorder (MDD) and nine symptom subtypes derived from Patient Health Questionnaire-9 (PHQ-9). Instrumental variables (IVs) were expression quantitative trait loci (eQTL) for eigh…
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Parkinson's disease (PD) involves heterogeneous neurodegenerative processes across brain cell types. The cell-type-specific effects of genetic risk remain unclear.
OBJECTIVE: We aimed to identify cell-type-specific causal genes for PD and to link genetic risk to molecular mechanisms and therapeutic opportunities.
METHODS: We performed the first cell-stratified Mendelian randomization integrating single-cell expression quantitative trait loci data from eight brain cell types with large PD genome-wide association studies datasets, followed by validation, neuropathological correlati…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Autophagy dysregulation has been implicated in the toxic protein aggregates of amyotrophic lateral sclerosis (ALS). However, the … controls), along with data on DNA methylation, RNA splicing, gene expression, and protein abundance quantitative trait loci (QTLs) in both blood and brain tissues (mQTL, sQTL, eQTL, and pQTL, respectively) sourced from European cohorts. Cis-variants situated proximal to or within the 604 autophagy-related genes, exhibiting robust associations with molecular alterations i …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Immunoglobulin G (IgG) N-glycosylation is associated with mild cognitive impairment through the regulation of inflammatory balance; however, the underlying mechanisms remain unclear.
METHODS: Our study utilized a post-genome-wide association studies (GWAS) method that integrated GWAS data for cognitive function with gene expression quantitative trait loci (eQTL), protein QTL (pQTL), and IgG N-glycan-QTL data.
RESULTS: Mendelian randomization (MR) analyses suggested bidirectional causalities between glycan peaks (GPs) and cognitive function, with GP7, GP12, and GP19 showing a causa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vegetable legumes are nutritionally and ecologically important crops. However, their genetic improvement has not kept pace with the increasing challenges posed by climate change due to the polygenic nature of stress tolerance, narrow genetic diversity, and the persistent gap between molecular discoveries and field-level cultivar development. Although recent reviews have examined individual genomic tools or specific stress responses, a comprehensive synthesis integrating genomics-assisted breeding, multi-omics technologies, genome editing, and speed breeding within a unified crop improvement fr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hybrid RIB-9184 × RIB-15131 combines high yield (18.84 g plant⁻¹) with iron (46.16 mg kg⁻¹), zinc (38.86 mg kg⁻¹), and protein (11.91%); Fe-Zn correlation (rg = 0.82) permits simultaneous biofortification. Pearl millet [Pennisetum glaucum (L.) R. Br., syn. Cenchrus americanus (L.) Morrone] is a climate-resilient cereal with inherently high micronutrient levels, making it a priority crop for biofortification. Understanding gene action for yield and nutritional traits is essential for designing effective breeding strategies. Ten diverse inbred lines were crossed in a half-diallel design (Griffin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing early-maturing maize varieties with improved tolerance to high-density planting is essential for enhancing yield in China. In thi … and high genetic variation in the population. A genome-wide association study (GWAS) identified 380 quantitative trait loci (QTLs) for both ED and EL under two planting densities. In total, 138 and 89 annotated genes were identified within QTLs detected under normal and high-density planting conditions, respectively. Among them, Zm00001eb288330 (a TPX2 family protein) an …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Genetic diversity and genetic differentiation between Gossypium hirsutum-Gossypium barbadense introgression lines (ILs) and early-maturing upland cotton lines are critical for resolving the core breeding contradiction in Xinjiang cotton region: narrow genetic basis of early-maturing cultivars and late maturity of ILs with superior fiber quality. Xinjiang is one of the major cotton-producing regions in China, and breeding high-quality early-maturing upland cotton adapted to local ecological conditions is essential for improving cotton yield and quality. However, the genetic relation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mendelian randomization (MR) leverages genetic variants as instrumental variables to infer causal relationships between molecular traits and diseases, however, identifying the specific causal genes underlying disease risk remains challenging. Here, we present MULTI (Multi-tissue Unified Likelihood-based Transcriptomic Integration), a Bayesian MR framework that integrates genetic information across tissues to improve the accuracy of causal inference. MULTI yields reliable estimates even when the number of instruments in a single tissue is limited, and further increases statistical power by adap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cold stress is a major abiotic constraint to wheat production in temperate regions, particularly in the Kashmir Valley of north-western Himalayas, India, where prolonged low temperatures delay growth, reduce yield, and disrupt the rice-wheat cropping system. To address this challenge, we evaluated a panel of 340 nested synthetic hexaploid wheat introgression lines, developed by introgressing allelic diversity from Aegilops tauschii and Triticum durum into bread wheat. The panel was phenotyped for cold stress tolerance, electrolyte leakage index, and yield-related traits across three temperate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования