Decalcified formalin-fixed and paraffin-embedded (dFFPE) bone marrow trephines remain the primary source of gDNA in hematopathological diagnostics. Here, we investigated the applicability of next-generation sequencing (NGS) to dFFPE samples. Chronic myelomonocytic leukaemia (CMML) is a haematopoietic stem cell malignancy delineated by genetic heterogeneity. Recently characteristic mutations have been identified for this entity in a distinct group of genes (TET2, CBL, KRAS). We comparatively investigated DNA extracted from fresh mononuclear cells as well as dFFPE samples from four CMML patients…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current primary treatment for epistaxis in accident and emergency departments is the insertion of Merocel packs. If these are properly inserted, but fail to control bleeding, it is necessary to insert a bismuth iodoform paraffin paste (BIPP) pack. A BIPP pack, when properly inserted, has the potential to stop most bleeds, but books and journals suggest a method of insertion that limits its effectiveness. A safer and more effective way of packing a nose with BIPP than the traditional method is described.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To assess the myringoplasty graft take rate, comparing two methods of post-operative ear packing: bismuth iodoform paraffin paste (BIPP) gauze versus tri-adcortyl ointment (TAO).
METHODS: A retrospective study of patients who had undergone myringoplasty at our department within a three-year period was undertaken. Data, including age, site and size of perforation, grade of surgeon, surgical approach, use of post-operative ear dressings, complications, and audiometric outcome, were collected from the patient notes and analysed. The overall success rate of the operation (with success…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American cutaneous leishmaniasis (ACL) is an endemic disease in Northern Argentina. We applied the polymerase chain reaction (PCR) followed by a hybridization labelled probe to 21 paraffin embedded human skin biopsies, already analyzed histologically, from leishmaniasis endemic areas in the province of Tucumán, Argentina. We used primers previously designed to detect a Leishmania-specific 120-base-pair fragment of kinetoplast DNA minicircle, other two primer pairs that amplify kDNA minicircles belonging to the L. braziliensis and L. mexicana complexes respectively, and specific oligonucleotide…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new method of diagnosing cysticercus or larval stage of the human tapeworm, Taenia saginata, also known as Cysticercus bovis, in formalin-fixed bovine tissue was developed using a monoclonal antibody to T. saginata and avidin-biotin complex immunohistochemistry. Grossly recognizable viable and degenerate cysts were identifiable after immunohistochemical staining and could be differentiated from Sarcocystis, Actinobacillus, or non-cyst, normal bovine structures. Thenew test should permit laboratory confirmation of suspected T. saginata cysticercus lesions.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious laryngotracheitis virus (ILTV) is routinely diagnosed by histopathologic examination of trachea, eyelid, and lung tissues. Lesion … rther validate the ability of this assay to detect ILT, nested PCR was performed in formalin-fixed, paraffin-embedded tissues from 35 cases of respiratory disease. Of the 35 cases, 12 were considered ILT suspects on the basis of initial clinical observation. Eleven of the 12 ILT-suspect cases were diagnosed as ILT, and the remaining 24 were diagnosed as no …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An immunohistochemical assay using catalyzed signal amplification (CSA), which is based on the peroxidase catalyzed deposition of biotinylated tyramide, is a highly sensitive method to visualize weak immunohistochemical signals originating from rare antigens or masked antigens in formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues. However, CSA methods are hampered by poor reproducibility and the complexity of their staining procedures. In this study, we aimed to apply the CSA procedure to a capillary gap-based, automated immunostainer, TechMate Horizon, to perform immunohistochemical signal ampl…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Proto-oncogene MYC, mapped to chromosomal band 8q24 and the genes for hepatocyte growth factor (HGF at 7q21) and its receptor, M … Frozen tissue from 17 HCCs was used for CGH analysis and sections of corresponding formalin-fixed, paraffin-embedded HCC tissue were used for dual-color FISH with locus-specific (LSI-cMYC for chromosome 8q24 and LSI D7S486 for chromosome 7q31) and centromeric probes, CEP8 (8p11.1-q11.2) and CEP7 (7p11.1-q11.2) (Vysis, Inc, Downers Grove, IL). This study i …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An immunohistochemical method for determining the variety of Cryptococcus neoformans in formalin-fixed paraffin-embedded tissues was developed using mAbs 471, 302 and CRND8. The method was validated primarily using veterinary patients for which both formalin-fixed lesions and a cultured isolate were available. L-Canavanine glycine bromothymol blue (CGB) agar and the 'Crypto-Check' kit were used to determine the variety and serotype, respectively, of cultured isolates. Immunohistochemistry accurately predicted the C. neoformans variety in all tissue specimens. The CGB agar method of determining…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Length alterations in short repetitive DNA sequences, termed microsatellite instability (MSI), are used as a diagnostic criterion of replication errors caused by various mutations in at least five mismatch repair genes. Therefore, MSI analysis is useful in clinical practice to identify patients with hereditary nonpolyposis colorectal cancer (HNPCC). MSI can be detected by amplification of microsatellite loci in DNA extracted from paraffin-embedded tumor and corresponding peritumoral specimens after numerous time consuming steps limiting the clinical utilities. Rapid microsatellite analysis, a …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For quantificative determination of ERBB2 gene amplification in archival human carcinoma specimens we have developed a rapid, non-radioactiv … method was used for quantificative determination of ERBB2 gene amplification in 195 formalin-fixed, paraffin-embedded breast carcinoma tissues. ERBB2 gene amplification was found in 52 (26%) of these tumors and correlated significantly with tumor size, absence of estrogen receptor (ER) and pS2 expression, but not with absence of progesterone receptor (PR) …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We attempted to evaluate whether Widéhn's quick re-embedding method from paraffin blocks is useful for dermatopathological diagnosis. Regarding fine preservation of nuclei, tono-fibrils and desmosomes of keratinocytes in normal skin, we could recognize no difference between the quick re-embedding method and traditional re-embedding methods. However, preservation of mitochondria and Birbeck granules in Langerhans cells was poor regardless of the method used. Furthermore, we studied the ultrastructural features of some viral skin diseases including molluscum contagiosum, herpes simplex, varicell…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The distinction between reactive mesothelium and mesothelioma in pleural biopsy specimens is notoriously difficult, and conventional immunohistochemical markers have provided no relief. The object of this study was to examine the frequency of immunohistochemically detectable p53 overexpression in routinely processed, paraffin-embedded tissue from pleural mesotheliomas and from pleura showing reactive mesothelial hyperplasia, using a polyclonal antibody to formalin-resistant p53 epitopes, and to consider the diagnostic utility of this antibody in the distinction between mesothelioma and reactiv…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malignant histiocytosis (MH) is a term that has been used to describe a syndrome in which there is a systemic proliferation of cells that have the cytologic appearance of atypical histiocytes. Biopsy materials from 15 patients with malignant lymphoma diagnosed as malignant histiocytosis in a previous study reported in 1975 were analyzed by a panel of antibodies and reclassified using current nosologic concepts of malignant lymphoma. The antibodies used comprised reagents detecting a formalin-resistant epitope on B-cells (L26), T-cells (anti-CD3, anti-leu 22 [CD43], and UCHL1 [CD45RO]), monocyt
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nuclear DNA content of paraffin-embedded tissue from 48 adrenocortical neoplasms, 18 histologically normal control adrenal glands, and five hyperplastic adrenal glands was analyzed retrospectively using flow cytometry. Aneuploidy was compared with morphologic criteria as a predictor of recurrence. All 18 controls, five hyperplastic glands, and 39 neoplasms were diploid. Nine neoplasms were aneuploid. Compared with their diploid counterparts, aneuploid neoplasms were more likely to weigh more than 50 g (P less than 0.0001) and to have three or more histologic features of carcinoma (P less than …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tartrate-resistant acid phosphatase activity may be demonstrated in paraffin-embedded liver and spleen specimens as well as in decalcified bone marrow biopsies after fixation in a mixed glutaraldehyde-formaldehyde-calcium acetate solution. This technique may routinely be applied to haematologically relevant material and aids in the differential diagnosis of hairy-cell leukaemia.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Same-tissue section multimodal imaging is a powerful strategy that spatially profiles tissue histology, cell populations and molecular composition while maximizing tissue economy, preserving spatial molecular relationships, and increasing co-registration capacity. However, performing multiple modalities on the same tissue section can destroy or chemically alter the tissue, compromising downstream data. Here, we systematically assess integration of picrosirius red staining, hematoxylin and eosin staining, and multiplexed immunofluorescence into N-glycan and extracellular matrix peptide matrix-a
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyvinyl chloride (PVC) is one of the most widely used polymers, which contrasts with the low amount of literature on the leaching of assoc … H3n+1Cln+1 (accounting for ∼8 % in PVC standards) and polychlorinated alkanes making up chlorinated paraffins, given that they share the same chemical formulas. A methodology for discriminating between signals arising from VCOs and chlorinated paraffins has been proposed. VCOs were detected in 88 % of the samples analysed (other than standards), and in par …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-Seq analysis of Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded (FFPE) samples has emerged as a highly effective approach and is increasingly being used in clinical research and drug development. However, the processing and storage of FFPE samples are known to cause extensive degradation of RNAs, which limits the discovery of gene expression or gene fusion-based biomarkers using RNA sequencing, particularly methods reliant on Poly(A) enrichment. Recently, researchers have developed an exome targeted RNA-Seq methodology that utilizes biotinylated oligonucleotide probes to enrich RNA transcripts of int…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue represents the primary source of clinical tissue and is routinely used in MALDI-MSI studies. However, it is not particularly suitable for lipidomics imaging given that many species are depleted during tissue processing. Irrespective, a number of solvent-resistant lipids remain, but their extraction may be hindered by the cross-link between proteins. Therefore, an antigen retrieval step could enable the extraction of a greater number of lipids and may provide information that is complementary to that which can be obtained from other biomolecules, s…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования