Mammarenaviruses cause serious diseases such as Lassa fever and Argentine hemorrhagic fever that threaten global public health; however, vaccines and therapeutic options remain limited. Therefore, developing a broadly effective vaccine against mammarenaviruses is a priority. In this study, we systematically analyzed the main structural protein sequences of ten mammarenaviruses. We combined antigenic epitopes from the Immune Epitope Database (IEDB) and used inverse vaccination and immunoinformatics methods to screen for highly conserved B- and T-cell epitopes with strong immunogenicity. We then…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human metapneumovirus (HMPV) is a leading cause of acute respiratory tract infections, particularly in pediatric, elderly, and immunocompromised populations. Despite its clinical significance, no licensed vaccine is currently available for HMPV. This study employed an in silico immunoinformatics-based approach to design a multi-epitope subunit vaccine candidate targeting key structural proteins of HMPV, including Matrix2-2, Matrix2-1, Matrix, and Phosphoprotein. B-cell and T-cell epitopes were systematically predicted and screened based on their immunogenicity, antigenicity, non-toxicity, and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipid nanoparticles-mRNA play important roles in SARS-CoV-2 infection control. Avian coronavirus infectious bronchitis virus (IBV) comprises eight genotypes with a lack of cross-protection, causing severe economic losses to the poultry industry. Using immunoinformatics methods, five consensus sequence antigens against prevalent IBV strains were designed. Four monovalent lipid nanoparticles-mRNA (GI-19, GI-13, GI-7, GVI-1) and one quadrivalent lipid nanoparticles-mRNA were constructed to develop a broad-spectrum IBV vaccine. The safety and biodistribution of the lipid nanoparticles-mRNA were ev…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pneumocystis jirovecii poses a significant threat to immunocompromised individuals, necessitating the development of an effective vaccine. This study employs an immunoinformatics approach to design a promising vaccine candidate against P. jirovecii. Utilizing various computational tools, the study identified potential antigenic epitopes capable of eliciting immune responses within the P. jirovecii major surface glycoprotein C. The chosen epitopes were evaluated using computational tools for their allergenicity, interferon-γ and interleukin activation ability, and toxicity, ensuring the selecti…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The group of large clostridial toxins (LCTs) includes toxins A (TcdA) and B (TcdB) from Clostridioides difficile, hemorrhagic and lethal tox … re, this study emphasizes the importance of understanding lesser-explored toxins and proposes using immunoinformatics to identify their immunodominant regions. By mapping these regions using silico tools and considering their homology with TcdA and TcdB, the study aims to guide future research in veterinary vaccinology. It also explores alternatives to overcome the …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the availability of prevention and treatment strategies and advancing immunization approaches, the influenza virus remains a global … nicity of the vaccine and the formation of stable complexes, respectively. Ultimately, based on the immunoinformatics analysis, the universal mRNA multi-epitope vaccine designed in this study might have a protection potential against the various subtypes of influenza A and B.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic echinococcosis (CE) is one of the most important zoonotic parasite diseases in human, livestock, and wildlife worldwide. Development … inst CE. To this end, various tools can be applied, including immune-based genomics and proteomics, immunoinformatics, systems vaccinology and mathematical/computational modeling. In this review, we aimed to provide comprehensive insights upon the current status of vaccination trials against E. granulosus, and also articulate some perspectives on the production of …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human Norovirus belongs to a family Calciviridae, and was identified in the outbreak of gastroenteritis in Norwalk, due to its seasonal prev … were utilized. These proteins were subjected to B and T cell epitopes prediction by using reliable immunoinformatics tools. The antigenic and non-allergenic epitopes were selected for the subunit vaccine, which can activate cellular and humoral immune responses. Linkers joined these epitopes together. The vaccine structure was modelled and validated by using Errat …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The highly polymorphic yet homologous nature of HLA antigens (Ags) constitutes a milieu of public and private B-cell epitopes of varying degrees far exceeding the coverage of the existing cross-reactive groups (CREGs). To support the on-going efforts in updating serological categorisation and designing the next generation single antigen bead (SAB) panel of higher resolution and broader population coverage, an algorithm named AminoAcid3D (AA3D) has been developed as a research tool for designing SAB panels and predicting which amino acid residues (termed 'eps') could be involved in Ag-antibody
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human leukocyte antigen (HLA) class I molecules are highly polymorphic, restricting peptide binding to narrow sequence subsets. Designing peptides that bind multiple HLA supertypes-termed superbinders-offers a promising strategy for broad-spectrum T cell vaccines and immunotherapies. Here, we present superHLA, a computational framework that combines Markov Chain Monte Carlo optimization with state-of-the-art major histocompatibility complex binding predictors to design synthetic 9-mer peptides with broad HLA-binding profiles. Using superHLA, we generated over 190,000 candidate superbinders pre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying tumor-specific T-cell antigens is essential for advancing cancer immunotherapy and enabling precision-driven, AI-assisted discovery. While artificial intelligence (AI) and machine learning (ML) have significantly impacted healthcare and biotechnology, existing approaches often struggle with the inherent complexity and sequence dependency of antigen data, resulting in suboptimal predictive performance. In this study, we propose a Deep Neural Network (DNN)-based framework specifically designed to address these challenges in computational tumor T-cell antigen identification. The propo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell recognition of infected or malignant cells is central to both spontaneous and therapy-induced cellular immune responses against pathogens and cancer. This recognition is elicited by the interaction between T-Cell Receptors (TCRs) and epitopes, which consist of antigenic peptides displayed on major histocompatibility complex molecules. TCR-epitope interactions are characterized by high diversity in TCR and epitope sequences and high structural flexibility in TCR loops. As a result, deciphering the rules of TCR-epitope recognition specificity and accurately predicting these interactions r
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identification of peptide immunogens in a pathogen proteome can help to develop diagnostic kits, therapeutics, and preventive vaccines. Traditional methods for identifying such peptides are often laborious, time-consuming, and resource intensive, resulting in limited efficiency and scalability. Given the extensive size and diversity of viral proteomes, the use of state-of-the-art computational tools has become essential for identifying immunogenic fragments. This study presents MHCmet, a deep learning tool for identifying such peptide fragments that bind human MHC class I receptors. The key in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identification of the origin of pathogenic immune cells is crucial for therapeutic interventions and diagnosis but pseudotime methods struggle to trace immune cells accurately. Current trajectory inference methods for B cell development and response in health and disease either ignore or underutilize antigen receptor sequence information, limiting their ability to resolve developmental pathways, particularly for pathogenic populations. Widely used methods such as Monocle 3 reconstruct developmental paths from transcriptomic similarity alone, discarding the features from immune receptors. Dande
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germline targeting vaccination strategies against highly variable pathogens such as HIV aim to elicit broadly neutralizing antibodies (bnAbs) with particular immunogenetic or structural features. The V2 apex of the HIV Env protein is a promising target for a class of bnAbs that contain conserved structural motifs in the heavy chain complementarity determining region 3 (CDRH3). Here, we show that these structural motifs are targetable by vaccination by characterizing V2 apex "axe-like" CDRH3s in the human repertoire and developing immunogens capable of engaging them. We determined the frequency
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent Ebola virus disease (EVD) outbreaks make the development of efficacious and low cost vaccines against Ebola virus (EBOV) an urgent goal. Multiepitopic vaccines allow a rational design rendering vaccines able to induce proper immune responses in terms of polarization and potency. In addition, the pathogen variants can be easily covered by including epitopes conserved among relevant isolates. Other important aspects to consider in vaccination are the costs associated to production, distribution, and administration of the vaccine. Plants provide an advantageous platform for this purpos
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD), the leading cause of dementia, is a progressive neurodegenerative disorder marked by memory loss, cognitive declin … s safe and effective candidates for vaccine development. In this study, we employed a computational immunoinformatics approach to identify novel Aβ42-mimicking peptides derived from non-coding DNA sequences, representing an unconventional yet rich source of bioactive peptides. A virtual peptide library was generated from intergenic regions of the Escherichia coli g …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The design of effective mRNA vaccines requires rigorous target selection, optimization, and validation to ensure stability, immunogenicity, … argeting both the coding sequence (CDS) and multi-epitope vaccine construct (MEVC). It incorporates immunoinformatics-based epitope selection, population coverage analysis, codon adaptation index optimization, minimum free energy-based RNA secondary structure assessment, target accessibility into a unified computational development workflow. The resulting construct …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The capsid protein (CP), the primary structural component and key antigen of infectious spleen kidney necrosis virus (ISKNV), remains poorly characterized in terms of its antigenic epitopes. These epitopes, typically ∼20 amino acid residues in length, are specific chemical groups determining antigenic specificity. To address this gap, we employed immunoinformatics to analyze CP epitopes. Subsequently, a multi-epitope vaccine targeting ISKNV (MEV) was designed, constructed, and screened. Immune response evaluation revealed that the predicted three T lymphocyte and five B lymphocyte epitopes exh…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human T-lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) is the first discovered human oncogenic retrovirus that can cause adult T-cell leukemia/lymphoma, HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis, and several other diseases. Due to the poor prognosis of these diseases and the limited therapeutic modalities, the need for an HTLV-1 vaccine is crucial. The current study has used an artificial intelligence-driven reverse vaccinology approach to design an mRNA vaccine against HTLV-1. The two most antigenic proteins of the virus were selected and analyzed using multiple immunoinformatics tools to…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования