A major problem limiting reproducible use of liquid extraction surface analysis (LESA) array sampling of dried surface-deposited liquid samples is the unwanted spread of extraction solvent beyond the dried sample limits, resulting in unreliable data. Here, we explore the use of the Droplet Microarray (DMA), which consists of an array of superhydrophilic spots bordered by a superhydrophobic material giving the potential to confine both the sample spot and the LESA extraction solvent in a defined area. We investigated the DMA method in comparison with a standard glass substrate using LESA analys
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Borrelia burgdorferi, the agent of Lyme disease (LD), uses host-derived signals to modulate gene expression during the vector and mammalian phases of infection. Microarray analysis of mutants lacking the Borrelia host adaptation regulator (BadR) revealed the downregulation of genes encoding enzymes whose role in the pathophysiology of B. burgdorferi is unknown. Immunoblot analysis of the badR mutants confirmed reduced levels of these enzymes, and one of these enzymes, encoded by bb0086, shares homology to prokaryotic magnesium chelatase and Lon-type proteases. The BB0086 levels in B. burgdorfe…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies have shown that fastigial nucleus stimulation (FNS) reduces tissue damage resulting from focal cerebral ischemia. Although the mechanisms of neuroprotection induced by FNS are not entirely understood, important data have been presented in the past two decades. MicroRNAs (miRNAs) are a newly discovered group of non-coding small RNA molecules that negatively regulate target gene expression and are involved in the regulation of cell proliferation and cell apoptosis. To date, no studies have demonstrated whether miRNAs can serve as mediators of the brain's response to FNS, which l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: 4-Nitrophenol (4-NP) is a prioritized environmental pollutant and its toxicity has been investigated using zebrafish, advocated as an alternative toxicological model. However, molecular information of 4-NP induced hepatotoxicity is still limited. This study aimed to obtain molecular insights into 4-NP-induced hepatotoxicity using zebrafish as a model.
METHODS: Adult male zebrafish were exposed to 4-NP for 8, 24, 48 and 96h. Livers were sampled for microarray experiment, qRT-PCR and various histological analyses.
RESULTS: Transcriptomic analysis revealed that genes associated with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human papillomavirus-related oropharyngeal squamous cell carcinoma has a unique biology and improved prognosis. A new focus is to identify prognostic biomarkers specifically in this human papillomavirus-positive cohort. We analyzed cyclin D1 immunostaining on a tissue microarray of patients with known clinical follow-up and p16 and human papillomavirus status (by E6/E7 RNA in situ hybridization). Cyclin D1 staining was read visually and digitally. Cutoffs of 5%, 10%, and 30% were separately analyzed as was linear intensity data derived from the image analysis. For the 202 tumors, cyclin D1 exp
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To date, three molecular markers (ER, PR, and CYP2D6) have been used in clinical setting to predict the benefit of the anti-estrogen tamoxifen therapy. Our aim was to validate new biomarker candidates predicting response to tamoxifen treatment in breast cancer by evaluating these in a meta-analysis of available transcriptomic datasets with known treatment and follow-up. Biomarker candidates were identified in Pubmed and in the 2007-2012 ASCO and 2011-2012 SABCS abstracts. Breast cancer microarray datasets of endocrine therapy-treated patients were downloaded from GEO and EGA and RNAseq dataset
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The migration of vascular smooth muscle cells (VSMCs) from the media to the intima is proposed to be a key event in the development of ather … the changes of gene expression in rat primary VSMCs (rVSMCs) infected with C. pneumoniae. Both the microarray analysis and quantitative real-time reverse transcription (RT)-PCR revealed that TLR2 mRNA expression was strongly upregulated 12 h after C. pneumoniae infection. RT-PCR and Western blot analysis further showed that the expression levels of TLR2 mRNA and pro …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Androgen receptor is an essential transcriptional factor that contributes to the development and progression of prostate cancer. In this study, we investigated the androgen regulation and functional analysis of 14-3-3ζ in prostate cancer.
EXPERIMENTAL DESIGN: Using chromatin immunoprecipitation (ChIP) combined with DNA microarray (ChIP-chip) analysis in LNCaP cells, we identified a functional androgen receptor-binding site in the downstream region of the 14-3-3ζ gene. Androgen regulation was examined by quantitative reverse transcription PCR and Western blot analysis. Prostate cancer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Intraductal papillary mucinous neoplasms (IPMN) are precursors to infiltrating pancreatic ductal adenocarcinomas. Widespread epigenetic alterations are characteristic of many cancers, yet few studies have systematically analyzed epigenetic alterations of neoplastic precursors. Our goal was to conduct genome-wide CpG island methylation profiling to identify aberrantly methylated loci in IPMNs.
EXPERIMENTAL DESIGN: We compared the CpG island methylation profiles of six IPMNs to normal primary pancreatic duct samples using methylation CpG island amplification (MCA) and Agilent CpG islan
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Because patients with silicosis who are chronically exposed to silica particles develop not only pulmonary fibrosis, but also complications … e to asbestos-induced apoptosis after more than 8 months of continuous exposure. The results of DNA microarray analysis showed that the expression of 139 genes was altered by long-term and low-level exposure to asbestos, and the profile was almost similar among the six sublines when compared with the original MT-2 cells that had never been exposed to asbestos. Pathwa …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The study aim to identify novel molecular subtypes of ovarian cancer by gene expression profiling with linkage to clinical and pathologic features.
EXPERIMENTAL DESIGN: Microarray gene expression profiling was done on 285 serous and endometrioid tumors of the ovary, peritoneum, and fallopian tube. K-means clustering was applied to identify robust molecular subtypes. Statistical analysis identified differentially expressed genes, pathways, and gene ontologies. Laser capture microdissection, pathology review, and immunohistochemistry validated the array-based findings. Patient survival
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To screen the differential expression gene profile in nasal mucosa of seasonal allergic rhinitis (SAR) and SAR with asthma, oligonucleotide microarray (Affymetrix HG-U133-plus2) was employed to analyze the changes of gene expressions with GeneSpring software.
METHODS: Inferior turbinate mucosa was obtained from five SAR patients and four SAR with asthma patients. Total RNA was extracted from the nasal mucosal biopsies and pooled into one SAR control pool and one SAR with asthma patient pool, and biotin-labeled cRNA probes were hybridized with Affymetrix HG-U133-plus2 array. The hyb
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori is dependent upon the production of the highly abundant and active metalloenzyme urease for colonization of the human stomach. Thus, H. pylori has an absolute requirement for the transition metal nickel, a required cofactor for urease. To investigate the contribution of genes that are factors in this process, microarray analysis comparing the transcriptome of wild-type H. pylori 26695 cultured in brucella broth containing fetal calf serum (BBF) alone or supplemented with 100 microM NiCl(2) suggested that HP1512 is repressed in the presence of 100 microM supplemental nickel.…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: While menopause results in the loss of cyclic steroid production, evidence exists for persistent, albeit reduced, ovarian androg … al ovarian stroma, corpora lutea (CL), ovarian follicles, placenta, and myometrium. Oligonucleotide microarray analysis was performed to compare the gene expression profiles of PMO with pre-menopausal ovarian stroma. Real-time RT-PCR was performed for LH/HCG receptor (LHCGR), steroidogenic acute regulatory (StAR), cholesterol side-chain cleavage (CYP11A), 3beta-hydro …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Split-hand/foot malformation (SHFM) is a congenital disability characterized by the absence or hypoplasia of the central ray of the hands and/or feet. This study reports a causative variant in the TP63 gene in a Chinese family exhibiting limb anomalies associated with SHFM4.
METHODS: Enrolled in this study was a Chinese family with limb anomalies without any other clinical features. Karyotype analysis and chromosomal microarray analysis (CMA) were conducted to identify chromosomal abnormalities. Whole exome sequencing (WES) was utilized to investigate sequence variants, while RNA …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The goal of this study was to investigate the expression of micro ribonucleic acid (miR)-129 in the tissues and serum of patients with gastric cardia adenocarcinoma (GCA) and to analyze its correlation with the prognosis of GCA patients.
METHODS: A total of 100 hospitalized patients diagnosed with GCA in our hospital and 80 normal controls (HCs) were enrolled, the RNA in the tissues and serum was extracted, and the differentially expressed miRNAs in GCA patients were screened by means of miRNA microarray analysis. Moreover, the expression of miR-129 was detected by qRT-PCR, and th…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of medical genetics. Part B, Neuropsychiatric genetics : the official publication of the International Society of Psychiatric Genetics2007eng
Gilles de la Tourette Syndrome (TS) is a heritable, neurodevelopmental disorder characterized by motor and vocal tics. As no single gene or region has emerged from standard linkage approaches, TS may result from several as-yet-unidentified genetic factors, and may also occur due to infection-triggered, autoimmune processes. Etiological or pathogenic differences might result in clinically indistinguishable TS subgroups. We have previously used whole genome human oligonucleotide microarrays in an attempt to identify patterns of gene expression in blood linked with TS. In this proof-of-principle
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The complement system, a core component of innate immunity, plays a key role in the tumorigenesis and progression of colon cancer. Although dysregulation in proteins associated with the complement and coagulation cascades (CCC) pathway has been identified in colon cancer, comprehensive investigations in this area are still scarce. In the present study, differential expression analysis was performed on colon adenocarcinoma (COAD) obtained from the GEPIA2 database (www.gepia2.cancer-pku.cn), to compare gene expression profiles between tumor tissues and paired adjacent normal tissues. A threshold
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune hepatitis (AIH) lacks a disease-specific diagnostic biomarker, particularly for patients who present with acute onset, normal IgG levels, or seronegative profiles. Recent advances in high-throughput autoantibody profiling technologies have enabled the systematic discovery of novel AIH-associated autoantigens. This review summarizes emerging autoantibodies that have been identified through proteome-wide screening approaches, including human protein microarrays and phage immunoprecipitation sequencing. Particular attention is given to anti-docking protein 2 (DOK2) and anti-mitochondri
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Graphically encoded hydrogel microparticle-based biosensing is a promising suspension microarray platform by virtue of multiplexing capability, robust sensitivity, and facilitated downstream analysis. However, the absence of a long-term and stable storage protocol for the hydrogel microparticle has been a bottleneck for the sensing platform to be adapted to practical fields. In this study, the polyethylene glycol (PEG) nanofiller-mediated lyophilization strategy of the hydrogel microparticles is presented. To inhibit the lyophilization-induced deformation of the porous structure and geometries
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования