The H9N2 subtype of avian influenza A viruses (AIV) has spread among domestic poultry and wild birds worldwide. H9N2 AIV is sporadically transmitted to humans from avian species. A total of 42 laboratory-confirmed cases of non-fatal human infection with the Eurasian Y280 and G1 lineages have been reported in China, Hong Kong, Bangladesh and Egypt since 1997. H9N2 AIV infections in poultry have become endemic in Asia and the Middle East and are a major source of viral internal genes for other AIV subtypes, such that continuous monitoring of H9N2 AIV is recommended. In this study, a new, one-ste
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rabies is a neglected disease mostly affecting the developing world. Accurate and reliable diagnostic and surveillance data forms the foundation for the formulation and monitoring of control strategies. Although various sensitive and specific tests are available for detection of rabies virus, implementation of these tests in low-resource settings are challenging and remains limited. In this study, we describe the developed of a reverse transcription recombinase polymerase amplification assay for the detection of rabies virus. The analytical sensitivity of this assay was determined to be 562 RN
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a rapid and reliable method for the detection of Toxoplasma gondii in meat and animal tissues based on real-time polymerase chain reaction (PCR). Samples were collected from cattle, small ruminants, horses, and pigs raised or imported into Sicily, Italy. All DNA preparations were assayed by real-time PCR tests targeted to a 98-bp long fragment in the AF 529-bp repeat element and to the B1 gene using specific primers. Diagnostic sensitivity (100%), diagnostic specificity (100%), limit of detection (0.01 pg), efficiency (92-109%), and precision (mean coefficient of variation = 0.60%), …
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Following the success of nucleic acid-based detection in virology and bacteriology, multiplex real-time PCRs are increasingly used as first-line diagnostics in clinical parasitology, replacing microscopy. The detection and quantification of parasite-specific DNA in faeces is highly sensitive and specific and allows for cost-effective high-throughput screening. In this paper we discuss the clinical consequences of this radical change in diagnostic approach, as well as its potential drawbacks. In the Netherlands, routine diagnostic laboratories have been pioneering the implementation of multiple
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interferon (IFN)-γ has been shown to be associated with immunity to Marek's disease virus (MDV). The overall objective of this study was to investigate the causal relationship between IFN-γ and vaccine-conferred immunity against MDV in chickens. To this end, 3 small interfering RNAs (siRNAs) targeting chicken IFN-γ, which had previously been shown to reduce IFN-γ expression in vitro, and a control siRNA were selected to generate recombinant avian adeno-associated virus (rAAAV) expressing short-hairpin small interfering RNAs (shRNAs). An MDV challenge trial was then conducted: chickens were vac
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dengue is a mosquito-borne viral disease that has become more prevalent in the last few decades. Most patients are viremic when they present with symptoms, and early diagnosis of dengue is important in preventing severe clinical complications associated with this disease and also represents a key factor in differential diagnosis. Here, we designed and validated a hydrolysis-probe-based one-step real-time RT-PCR assay that targets the genomes of dengue virus serotypes 1-4.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: The primers and probe used in our RT-PCR assay were designed to target the 3'
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent, ongoing epidemic of hand, foot, and mouth disease (HFMD), which is caused by enterovirus infection, has affected millions of children and resulted in thousands of deaths in China. Enterovirus 71 (EV71) and coxsackie A16 (CA16) are the two major distinct pathogens for HFMD. However, EV71 is more commonly associated with neurologic complications and even fatalities. Therefore, simultaneously detecting and differentiating EV71 and CA16 specifically from other enteroviruses for diagnosing HFMD is important. Here, we developed a one-step, triplex, real-time RT-PCR assay for the simultan
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neonatal encephalopathy induced by perinatal asphyxia is a serious condition associated with high mortality and morbidity. Inflammation after the insult is thought to contribute to brain injury. This inflammatory response to hypoxia-ischemia (HI) may not only occur in the brain but also in peripheral organs. The aim of the present study was to investigate the effect of neonatal HI on the inflammatory response in the liver in comparison to inflammation in the brain.
METHODS: HI was induced in P7 Wistar rats by unilateral carotid artery occlusion and hypoxia. Cytokine and chemokine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Usutu virus (USUV) has been isolated in several African and European countries mainly from mosquitoes and birds. However, previous benign and two recent severe cases of human infections point out the need of a tool for the identification of USUV in human samples. A published real-time reverse transcription (RT) PCR assay for the detection of USUV in human blood or cerebrospinal fluid does not take into account the genetic variability of USUV in different geographic regions. Therefore, this article presents a quantitative real-time RT-PCR assay based on sequences from Europe and Africa. Primers
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Real-time PCR was used to investigate the role of progesterone (P4) and oestradiol (E2) in regulation of endometrial cytosolic, secretory and calcium-independent phospholipase A2 (PLA2G4A, PLA2G2A and PLA2G6, respectively) gene expression. Ovariectomized mares underwent 6 days of E2 pre-treatment followed by 14 days of P4 supplementation. At the start of P4 treatment (Day 1), mares were assigned in a 2 × 2 factorial design to receive either E2 or vehicle starting on Day 11 and endometrial biopsy collection on either Day 14 when P4 concentrations remained high (>4 ng/ml) or Day 16 when P4 conce
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop a rapid, sensitive and specific assay method, based on multiplex real time PCR for identifying Vibrio cholerae and distinguishing Vibrio cholerae O139 serotype from Vibrio cholerae.
METHODS: Cholera toxin A subunit gene (ctxA) and glycosyltransferase gene (LPSgt) were chosen as targets according to Vibrio cholerae and Vibrio cholerae O139 serotype, and then the primers and TaqMan-MGB probe were designed. The 5'end of probes was labeled with FAM and VIC fluoresceins respectively while the 3'end of probes was labeled with MGB. The PCR reaction was optimized systematically.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study was conducted to determine the percentage and predictive factors of patients achieving a sustained molecular response (MR)4.0 over 24 months. We included 93 patients diagnosed with chronic myeloid leukemia (CML) in chronic phase, continuously treated with imatinib and achieving negative nested reverse transcriptase-polymerase chain reaction or at least MR3.0 by real-time quantitative - polymerase chain reaction for at least 3 months. Patients with at least MR4.0 achievement were serially tested by droplet digital polymerase chain reaction every 6 to 8 months for 24 months. Median ag
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated neurologic complications following noncongenital Zika virus infection in 11 children who presented with central nervous system signs. Zika virus RNA was detected by real-time reverse transcription-polymerase chain reaction in cerebrospinal fluid. Approximately one-quarter of patients required antiepileptic medication in follow-up, and 2 children progressed to learning difficulties or developmental delay.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: DNA biodistribution studies are essential in the development of cell and gene therapies. A key step of these studies is the extraction of vector DNA (vDNA) and genomic DNA (gDNA) from complex biological samples. In this work, key DNA extraction parameters were evaluated and optimized to ensure consistent and efficient DNA recovery.
METHODS: Recovery was evaluated in multiple tissue types by spiking known amounts of vDNA and/or mouse gDNA into surrogate rabbit matrices, performing extraction using a DNA extraction kit under various conditions, and then quantifying the recovered DNA by qP
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Borealpox virus (Alaskapox virus, BRPV), a neglected zoonotic Orthopoxvirus (OPXV), has been reported only in Alaska, usually causing mild infections. A recent fatal case in the Kenai Peninsula has raised concerns about its public health impact. Like other OPXVs, BRPV diagnosis relies on molecular tools, making species-specific assays essential. In this study, we developed and validated two BRPV-specific molecular assays: a TaqMan-based real-time PCR (rtPCR) and a droplet digital PCR (ddPCR) using the QIAcuity platform. Both target the viral CC-chemokines inhibitor (vCCI) gene, showing high se
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The escalating incidence of emerging pathogens and their propensity for co-infection pose a severe threat to the sustainable intensification of Penaeus vannamei aquaculture. To address this challenge, a novel triplex TaqMan quantitative PCR (qPCR) assay was developed for the simultaneous detection of three high-risk agents: Infectious Myonecrosis Virus (IMNV), Decapod Iridescent Virus 1 (DIV1), and Covert Mortality Nodavirus (CMNV). This study not only establishes a robust multiplex platform but also systematically optimises its performance, achieving superior analytical sensitivity and reprod
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Citrus viroid V (CVd-V), a member of the species Apscaviroid epsiloncitri (family Pospiviroidae), is a graft-transmitted pathogen that spreads through infected propagation material and has been reported in several countries. Recently, it has been detected for the first time in Italy. Although CVd-V is generally considered asymptomatic, foliar and stem symptoms have been observed in Etrog citron. In several citrus species, mixed infections of CVd-V with other viroids give synergistic effects that cause more severe symptoms. To evaluate its spread, a specific and sensitive RT-qPCR assay was deve
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of a new corn ear rot was recently described in Germany and has since received increased attention following detections in several European and Asian countries. All reports consistently identify Trichoderma afroharzianum as the causal agent. The potential impact on maize production, combined with the risk of misdiagnosis as other ear rot diseases, highlights the need for a rapid and accurate diagnostic method for the reliable detection of T. afroharzianum. In this study, we developed a PCR-based diagnostic tool including an endpoint PCR and a real-time TaqMan assay targeting the
СтатьяВалидационное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To establish a quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) method for detection of Streptococcus mutans based on ready-to-use lyophilized reference materials (RMs) and apply it in screening of probiotics against cariogenic S. mutans.
METHODS: Primers and probes were designed targeting the gtfB gene, a specific single-copy gene associated with the core cariogenicity of S. mutans. A qPCR detection method was established and systematically validated. Ready-to-use lyophilized RMs derived from S. mutans ATCC 25175 with high uniformity and stability were prepared to construct…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus subtilis subsp. natto is a specialized functional group essential for fermented soybean production. Despite its industrial importance, genetic differentiation of this lineage remains challenging because of its high genomic similarity within the B. subtilis species complex. Here, we developed and validated a high-precision quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) assay targeting the comQ gene-a core component of the quorum-sensing system. Comparative genomic analysis of 70 bacterial genomes, including 9 B. subtilis strains newly sequenced in this study, revealed that the…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.