Abortion in ruminants represents an important economic concern for farmers. Microbial agents, such as Brucella spp., Chlamydia spp., Coxiella burnetii, Leptospira spp., Neospora caninum, Salmonella spp. and Toxoplasma gondii, are among the main infectious causes of abortion and require rapid and reliable diagnosis. This study describes the development of a multi-screening assay using Fast Real-Time PCR (Fast qPCR) that allows, in a single test, the simultaneous identification of the above-mentioned abortive agents. This multi-screening approach is characterized by a mean diagnostic sensitivity
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European journal of pediatric surgery : official journal of Austrian Association of Pediatric Surgery ... [et al] = Zeitschrift fur Kinderchirurgie2016eng
Purpose Systemic and local immune environments in human biliary atresia (BA) were analyzed. Methods Plasma concentrations of 19 inflammatory components in 16 preoperative BA patients (median age, 51 days), 13 normal controls (NCs) (44 days), and 15 cholestatic controls (CC) (23 days) were measured using flow cytometry, and compared according to post-Kasai outcomes in BA patients. Hepatic mRNA levels of representative helper T (Th) cell cytokines and forkhead box protein 3 (FoxP3) quantified by real-time reverse transcription polymerase chain reaction were compared between BA and non-BA. Result
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monitoring Streptococcus pneumoniae serotype distribution is important to assess the impact and effectiveness of pneumococcal vaccine programs. With the challenges of Quellung serotyping, PCR-based serotype prediction is increasingly being used for large-scale epidemiological studies. This study used real-time (RT)-PCR targeting the genes encoding autolysin (lytA) and capsular biosynthesis gene A (cpsA) of S. pneumoniae in nucleic acids extracted directly from nasopharyngeal (NP) swabs submitted for viral studies. If the specimen was lytA or cpsA PCR-positive, then serotype prediction was perf
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circulating microRNAs (miRNAs) have received considerable attention as a novel class of biomarkers for the diagnosis of cancer and as signalling molecules in mediating intercellular communication. Schistosomes, the causative agents of schistosomiasis, live in the blood vessels of a mammalian host in the adult stage. In the present study, we characterized schistosome-specific small RNA populations in the plasma of rabbits infected with Schistosoma japonicum (S. japonicum) using a deep sequencing method and then identified five schistosome-specific miRNAs, including four known miRNAs (Bantam, mi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Secreted aspartic proteases (Sap), encoded by a family of 10 SAP genes, are key virulence determinants in Candida albicans. Although biofilm-associated bloodstream infections (BSIs) are frequently caused by C. albicans, SAP gene expression in C. albicans biofilms formed by BSI isolates has not been evaluated. We compared the expression of two SAP genes, SAP5 and SAP9, in C. albicans biofilms formed by BSI isolates with those formed by isolates from other body sites. Sixty-three C. albicans isolates were analyzed, comprising 35 BSI isolates and 28 from other sites. A denture-strip biofilm model
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The real-time PCR assay is the most sensitive test for screening and diagnosing sexually transmitted infections (STIs) and has made diagnosing these infections easier for clinicians. The aim of this study was to investigate the reliability, accuracy, and usefulness of the real-time multiplex PCR assay for the detection of seven sexually transmitted microorganisms in clinical samples.
METHODS: A total of 897 specimens from 365 symptomatic patients and 532 asymptomatic volunteers were collected over a 10-month period. A total of 696 subjects provided 50ml of first-voided urine as sa
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus (HEV) is a major cause of acute viral hepatitis in many parts of the developing world. It is responsible for both sporadic infections and large scale epidemics and may be associated with significant mortality during pregnancy. Over the past two decades many serological and nucleic acid based diagnostic tests for HEV have been developed, including several reverse transcription real-time polymerase chain reaction assays (RT-qPCR). One of the most widely used of these RT-qPCRs is that developed by Jothikumar and colleagues (Journal of Virological Methods 2006, 131, 65-71). Whils…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We compared real-time polymerase chain reaction (PCR) and a newly developed enzyme immunoassay (EIA) for the detection of noroviruses (NoV) in 70 stool samples taken from outbreaks and sporadic cases of acute gastroenteritis. The real-time PCR classified more samples as positive than the EIA (26 versus 10) and detected more outbreaks of NoV (six versus two). Real-time PCR offers rapid and sensitive diagnosis for both sporadic cases and outbreaks of NoV gastroenteritis and, by comparison, the reduced sensitivity and specificity of the EIA will result in negative samples having to be tested by P…
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The literature on childhood tuberculous empyema (TE) is limited. The aim of this study was to examine the clinicopathological characteristics and outcome of paediatric TE and methods of prompt diagnosis and treatment. Between January 2014 and April 2019, 27 consecutive patients with TE aged ≤15 years [mean (SD) 12.2 (3.3), range 6-15] were retrospectively reviewed. The following were reviewed: baseline demographics, symptoms, laboratory and pathological examination, radiographical findings, microbiological data, anti-tuberculous and surgical treatment and clinical outcome. Acid-fast bacillus (
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective To evaluate the diagnostic accuracy of different laboratory approaches for tuberculous peritonitis(TP).Methods The clinical data of patients with suspected TP who were mainly manifested as ascites in Peking Union Medical College Hospital from January 2014 to June 2017 were retrospectively analyzed. Ascites samples were tested with different diagnostic approaches,including acid fast stain,culture for mycobacterium,real-time polymerase chain reaction for identifying DNA of mycobacterium tuberculosis,and T-cell spot of tuberculosis test(T-SPOT.TB). Results Totally 163 cases aged 15-84 y…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the expression profile of microRNA (miRNA) in umbilical cord blood from infants with hypoxic ischemic encephalopat … MiRNA expression profiles were determined using a microarray assay and confirmed using quantitative real-time polymerase chain reaction.
RESULTS: Seventy miRNAs were differentially expressed between case and control groups. Of these hsa-miR-374a was the most significantly downregulated in infants with HIE vs controls. Validation of hsa-miR-374a expression using quantitative real-ti …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serial quantitation of BCR-ABL mRNA levels is an important indicator of therapeutic response for patients with chronic myelogenous leukemia and Philadelphia chromosome-positive acute lymphoblastic leukemia, but there is substantial variation in the real-time quantitative polymerase chain reaction methodologies used by different testing laboratories. To help improve the comparability of results between centers we sought to develop accredited reference reagents that are directly linked to the BCR-ABL international scale. After assessment of candidate cell lines, a reference material panel compri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To screen several genes that are differentially expressed in uterine leiomyoma and matched unaffected myometrium by using microarray-based hybridization and real-time polymerase chain reaction analyses.
DESIGN: Screen by arrays for < or =2,400 known genes in leiomyoma and control myometrium.
SETTING: University clinical research laboratory.
PATIENT(S): Four patients with leiomyoma scheduled for surgery during the proliferative phase.
INTERVENTION(S): Four paired samples of leiomyoma and adjacent myometrium were obtained from patients undergoing hysterectomy.
MAIN OUTCOME MEASUR…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The relationship between influenza virus infectivity and virus shedding, based on different diagnostic methods, has not been defined.
METHODS: Three donor ferrets infected with 2009 pandemic influenza A(H1N1) underwent daily quantitative culture, antigen-detection testing, and real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Eight contacts were sequentially cohoused with each of the donors for 24 hours during days 3-10 after inoculation.
RESULTS: Transmission was observed until day 5 after inoculation, corresponding to high culture titers and positive results o
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The progression of Pneumocystis carinii pneumonia was temporally monitored and quantified by real-time polymerase chain reaction of P. carinii-specific DNA in oral swabs and lung homogenates from infected rats. DNA levels correlated with the number of P. carinii organisms in the rats' lungs, as enumerated by microscopic methods. This report is the first of a noninvasive, antemortem method that can be used to monitor infection in a host over time.
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The purpose of this survey was to develop a novel and rapid isothermal nucleic acid based detection assay of Vibrio cholerae by polymerase spiral reaction (PSR) in emergency situations.
METHODS: The current study was conducted in Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran in 2021. The conserved ctxA gene sequence of V. cholerae was used as a target of designed two pairs of primers. Amplification of nucleic acids performed under isothermal temperature of 65 °C in 55 min by using Bst DNA polymerase. PSR amplified products were real-time visualized under UV transillumi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Real-time reverse transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR) is nowadays commonly used to diagnose viral infections. This assay provides cycle threshold (Ct) values, which inversely correlate with viral load but do not directly indicate infectivity. The relationship between Ct values and infectivity remains unclear. As a first step, we assessed this relationship in nasopharyngeal samples from 97 seasonal influenza A (IAV) and 95 influenza B (IBV) virus-rRT-PCR-positive patients. Samples were cultured, viral RNA was quantified using reverse transcriptase digital PCR, and antibody titers
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHFV) is a high-consequence tick-borne pathogen requiring accurate molecular tools for reliable viral load assessment. This study evaluated and compared the performance of a laboratory-optimized quantitative real-time RT-PCR (qRT-PCR) assay with a digital PCR (dPCR) platform for the detection and absolute quantification of CCHFV RNA. Analytical validation was performed using a characterized viral isolate propagated in Huh7 cells, followed by serial dilution analysis to assess sensitivity, linearity, and dynamic range. Clinical performance was further eva
СтатьяВалидационное исследованиеОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hookworm infections, primarily affecting children and pregnant women are major health concern. As part of global efforts to eradicate neglected tropical diseases (NTDs) through mass chemotherapy, reliable diagnostic methods are urgently needed as regions work towards elimination. In this study, we have developed a LAMP-based method to detect hookworm infection in faecal samples. The primers, tailored for the LAMP assay, were designed targeting ITS-1 region of Ancylostoma duodenale using Primer Explorer version 5. Five hundred (500) human stool samples were subjected to microscopy and DNA extra
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxiella burnetii, the causative agent of Q fever, accumulates on dust of farm premises with infected animals, but the interpretation of PCR detection on dust is challenging. To investigate whether bacterial load in environmental dust together with the within-flock seropositivity could be indicative of the C. burnetii infection status in small-ruminant flocks, 249 farms (202 sheep, 18 goats, and 29 sheep-goat mixed) in the Balearic Islands were investigated. Dust samples were analyzed by real-time PCR targeting C. burnetii IS1111, and C. burnetii loads (genome equivalents/mg dust) were estimat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.