Infectious diseases are commonly demonstrated to be caused by polymicrobial infections, which correlate with increased infection severity and poorer clinical outcomes. In this study, we report a rare intestinal coinfection case of non-O1/O139 Vibrio cholerae and Salmonella typhimurium, along with V. cholerae septicemia. The data of quantitative real-time PCR and competition assay showed that V. cholerae may present enhanced virulence in the presence of S. typhimurium, and exerted an inhibitory growth effect over S. typhimurium in vitro.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Investigation of the gut-specific bacterial strains including lactobacilli is essential for understanding the bacterial etiology of constipation.
OBJECTIVE: This study aimed to compare the prevalence and quantity of intestinal lactobacilli in constipated children and healthy controls.
METHODS: Forty children fulfilling Rome IV criteria for functional constipation and 40 healthy controls were recruited. Fecal samples were analyzed using species-specific polymerase chain reaction followed by random amplified polymorphic DNA-PCR and quantitative real-time PCR.
RESULTS: Totally, sev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
(1) Background: This study aimed to detect feline coronavirus (FCoV) and characterize spike (S) gene mutation profiles in cats suffering from diseases other than feline infectious peritonitis (FIP) using commercial real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) and reevaluating results by sequencing. (2) Methods: In 87 cats in which FIP was excluded by histopathology and immunohistochemistry, FCoV 7b gene and S gene mutation RT-qPCR was performed prospectively on incisional biopsies and fine-needle aspirates of different organs, body fluids, and feces. Samples positive for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Candida auris has been associated with rapid transmission and high mortality. A novel PCR-based surveillance programme was initiated at a London teaching hospital from January 2018. The results of this implementation until March 2019 are presented along with the clinical, transmission and phylogenetic characteristics encountered in that setting.
METHODS: A real-time PCR assay for C. auris was developed, validated, and implemented for direct use on skin swabs and urine. Environmental swabs were also tested by PCR as an emergency outbreak-control measure. Clinical risk factors and o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The JAK2V617F mutation is a driver mutation of myeloproliferative neoplasms (MPNs). V617F allele burden is considered a risk factor for complications associated with MPNs and is a predictor of prognosis. In Japan, V617F allele burden has been measured in laboratory settings using the i-densyTM IS-5320 genetic analyzer with the quenching probe-Tm (QP-Tm) method. However, since 2020, allele-specific quantitative PCR (AS-qPCR) is being performed in clinical settings for measuring V617F allele burden. To investigate the clinical usefulness of the QP-Tm method in patients with MPNs, we evaluated th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Canine filarioids are zoonotic vector-borne parasitic nematodes distributed mostly in the tropics and subtropics. The aim of this study was to determine the prevalence, distribution, etiology and genetic variation of canine filarioid infections by three different PCR techniques in four Southern Romanian counties. Blood samples of 300 shelter dogs were screened for infections with canine filarioids by real-time PCR. To determine filarioid species and coinfections, samples positive in the initial screening were further tested by conventional PCR and sequenced. Results indicated that 17% of the t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis (VL) is a severe life threatening parasitosis requiring early management of cases. It is an emerging disease in the Mediterranean region with a spread of endemic areas and an increase in case incidence. The patient profile has also evolved with more affected adults, presenting generally non-specific symptoms. Hence the interest of a systematic biological confirmation. The microscopic detection of Leishmania amastigotes in bone marrow aspirates (BMA) smears is the gold standard diagnostic technique. However, it requires invasive sampling. Serological tests searching for s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The tick Rhipicephalus microplus (Ixodida: Ixodidae, Canestrini, 1888) causes substantial economic and health losses in cattle production and is the main vector of Babesia bigemina (Piroplasmidae: Babesidae, Smith & Kilborne, 1893). Babesia bigemina is responsible for a tick-borne disease known as babesiosis that can cause hemolytic anemia, fever and death. In the study reported here, we investigated the relationship between the number of ticks per animal and the number of B. bigemina cytochrome b gene (cbisg) copies in the blood of Brangus and Nellore cattle reared without acarici
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Urinary extracellular vesicles (UEVs) hold RNA in their cargo and are potential sources of biomarkers for gene expression studies. The most used technique for gene-expression studies is quantitative polymerase chain reaction (qPCR). It is critical to use stable reference genes (RGs) as internal controls for normalising gene expression data, which aren't currently available for UEVs.
METHODS: UEVs were precipitated from urine of graft dysfunction patients and healthy controls by Polyethylene glycol, Mn6000 (PEG6K). Vesicular characterisation confirmed the presence of UEVs. Gene exp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Fast and reliable detection of infection is a key to control the SARS-CoV-2 pandemic. Lateral flow antigen tests (LFATs) are inexpensive, easy to use, but have to be verified, as they are rather unspecific and can produce both, false positive and false negative results. Our objective was to combine the speed of LFAT for SARS-CoV-2 with the reliability of qPCR tests.
METHODS: A serial dilution of a patient sample positive for SARS-CoV-2 was prepared and added to LFAT wells from two manufacturers. After evaluation, the devices were opened, the strips removed and extracted in a soluti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Preeclampsia (PE) represents a salient complication of late pregnancy. Long noncoding RNAs (LncRNAs) are critical biological regulators in PE. This study investigated lncRNA MIR193BHG expression and clinical significance in PE.
METHODS: Serum samples were collected from 116 PE patients, including 62 cases of mild PE (mPE) and 54 cases of severe PE (sPE), with another 50 normal pregnant women as controls. LncRNA MIR193BHG expression in serum was detected by RT-qPCR. The correlation between MIR193BHG expression and clinical indicators was determined using Pearson analysis. The downs
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heparin molecules have an inhibitory effect on DNA amplification by binding to the majority of DNA-interacting proteins. Different physical, chemical, and enzymatic methods have been used to degrade and depolymerize heparins in biomedical investigations. In this study, we aimed to evaluate some heparin degradation methods to eliminate the inhibitory effect of heparin on DNA amplification. Here, we report highly efficient, simple, and convenient methods to eliminate the heparin inhibitory effect on DNA amplification by treatments including temperature, nitrous acid, and H2O2/ascorbic acid/sonic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An examination of the nucleic acid sequence alignment of 48 full-length rubella virus genomes revealed that the 5' terminus of the genome is more conserved than the commonly used detection windows for rubella virus RNA located in the E1 protein coding region, suggesting that the 5' terminus could be a target for improving detection of all rubella virus genotypes. Two candidate primer sets were tested and the window between nucleotides (nts) 98 and 251 was found to have the greatest analytical sensitivity for detection of different genotypes. The new method had a limit of detection of four copi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) are a cause of severe human illness and are frequently associated with haemolytic uraemic syndrome (HUS) in children. It remains difficult to identify virulence factors for STEC that absolutely predict the potential to cause human disease. In addition to the Shiga-toxin (stx genes), many additional factors have been reported, such as intimin (eae gene), which is clearly an aggravating factor for developing HUS. Current STEC detection methods classically rely on real-time PCR (qPCR) to detect the presence of the key virulence markers (stx and eae).
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate diagnosis is imperative in dogs with clinical signs of parvovirus infection (CPV-2).
OBJECTIVES: To assess quantitative real-time PCR (qRT-PCR) for the diagnosis of CPV-2 infection, and determine the optimal sampling site. Secondarily, to compare qRT-PCR with a point-of-care PCR kit (PCRun), and to assess sensitivity of serology for CPV diagnosis.
ANIMALS: Sixty dogs with naturally acquired parvovirus infection, 44 unvaccinated puppies, of which 16 were followed after first and second vaccination, 15 adult dogs, of which 10 were followed also after a booster vaccine, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To evaluate the correlation of quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) to the clinical characteristics of patients with viral retinitis.
METHODS: Retrospective case series.
RESULTS: Aqueous or vitreous samples of 20 out of 35 eyes showed qRT-PCR positivity for virus etiology (57.14%). Cytomegalovirus (CMV) was most commonly identified in nine eyes (45%). The mean DNA copy number was 2,68,339.65 copies/mL (range: 90-3205397). DNA copy number significantly correlated with the extent of clinical involvement (P = 0.013); however, there was no correlation between DNA c…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monkeypox has recently been described as a public health emergency of international concern by the World Health Organization and a public health emergency by the United States. If the outbreak continues to grow, rapid scalability of laboratory testing will be imperative. During the early days of the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, laboratories improved the scalability of testing by using a direct-to-PCR approach. To improve the scalability of monkeypox testing, a direct real-time PCR protocol for the detection of monkeypox virus was validated. The assay retains the sensitivity an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
On 22 June, a man who returned to South Korea from Germany tested positive for the monkeypox virus using real-time polymerase chain reaction. We identified 49 contacts concerning the first monkeypox case and classified them into two groups based on risk exposure levels. Through active monitoring of eight people in the medium-risk group and passive monitoring of 41 people in the low-risk group, we identified that no secondary transmission occurred over 21 days. The prompt active or passive monitoring of the index case of imported monkeypox could prevent community transmission in Korea.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Bartonella includes species capable of causing disease in animals and humans. Due to its fastidious nature, direct detection of Bartonella causing human infection relies largely on molecular microbiological methods. Thus, it is imperative that diagnostic assays in use have the ability to detect a range of Bartonella species associated with human disease. In this study, we compared the performance of a real time polymerase chain reaction (PCR) assay targeting the ssrA gene to conventional rpoB-targeted PCR and sequencing for detection and differentiation of Bartonella species in human
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
LipL32 is an outer membrane protein present only on pathogenic Leptospira species, which is the causative agent of leptospirosis. Leptospiro … ospirosis using the collected human sera from patients, in which the results were comparable to the real-time polymerase chain reaction technique.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.