As an obligate intracellular, developmentally regulated bacterium, Chlamydia is sensitive to amino acid fluctuations within its host cell. When human epithelial cells are treated with the cytokine interferon gamma (IFN-γ), the tryptophan (Trp)-degrading enzyme, indoleamine-2,3-dioxygenase, is induced. Chlamydiae within such cells are starved for Trp and enter a state of so-called persistence. Chlamydia lacks the stringent response used by many eubacteria to respond to this stress. Unusually, chlamydial transcription is globally elevated during Trp starvation with transcripts for Trp codon-cont
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Symphalangism (SYM or SYM1) is an autosomal dominant disorder characterized by multiple joint fusions. The disease is caused by mutations of the NOG gene, that maps to chromosome 17q22. So far, only six independent NOG mutations have been identified. We have analysed an Italian family in which father and son had bilateral symphalangism and detected a novel NOG mutation (P35S), originated in the father from a c.914C>T transition. A different mutation in the same codon (P35R) has been previously described. Comparison between different noggin gene hortologs shows that codon 35 is conserved. There
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repeat-associated non-AUG (RAN) translation of mutant FMR1 messenger RNA (mRNA) containing CGG repeat expansions results in the production of a toxic polyglycine protein (FMRpolyG), which contributes to fragile X premutation-associated conditions (FXPAC), including fragile X-associated tremor/ataxia syndrome (FXTAS). The 5' untranslated region of FMR1 mRNA folds into a thermodynamically stable secondary structure at the region of excessively expanded CGG repeats and constitutes a template for RAN translation initiated from near-cognate start codons located upstream of the CGGs. Cis-regulatory
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myocilin is known to be associated with the pathogenesis of juvenile-onset primary open angle glaucoma. The tissue distribution of myocilin transcripts has been analyzed in both humans and mice, and a high level of expression in the retina and skeletal muscle has been reported. The functions of myocilin in these tissues are unknown. We isolated rat myocilin cDNA and examined the expression pattern of myocilin, including its expression in endocrine organs, using Northern blot analysis. The rat myocilin cDNA sequence has two in-frame initiation codons, the upstream and downstream ATGs correspond
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Cancer cells utilize codon-biased translation to fuel tumorigenesis and drug resistance; however, underlying mechanisms remain poorly understood. In this study, we show that ALKBH1 is overexpressed in acute myeloid leukemia (AML) and essential for leukemia stem cell/leukemia-initiating cell self-renewal and AML development/maintenance but dispensable for normal hematopoiesis. ALKBH1 enhances mitochondrial assembly/function and oxidative phosphorylation, crucial for AML survival/proliferation and resistance to venetoclax, a potent BCL2 inhibitor and widely used first-line targeted t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report four new mutations in Japanese patients with mucopolysaccharidosis IVA (MPSIVA) who were heterozygous for a common double gene deletion. A nonsense mutation of CAG to TAG at codon 148 in exon 4 was identified, resulting in a change of Q to a stop codon and three missense mutations. V (GTC) to A (GCC) at codon 138 in exon 4, P (CCC) to S (TCC) at codon 151 in exon 5, and P (CCC) to L (CTC) at codon 151 in exon 5. Introduction of these mutations into the normal GALNS cDNA and transient expression in cultured fibroblasts resulted in a significant decrease in the enzyme activity. V138A a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Niemann-Pick disease (NPD) is a rare autosomal recessive hereditary disease characterized by deficient activity of acid sphingomyelinase.
CASE PRESENTATION: We present a case of NPD type B with a unique compound heterozygosity for SMPD1 (NM_000543.4:c.[84delC];[96G > A]) in which both mutations that induce an early stop codon are located before the second in-frame initiation codon. The clinical presentation of the patient is compatible with NPD type B. She was initially diagnosed of Gaucher Disease, but her altered lipid profile led to a clinical suspicion of NPD. Combined high do
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several mutations in the rhodopsin gene in patients affected by autosomal dominant retinitis pigmentosa (ADRP) have recently been described. We report four new rhodopsin mutations in ADRP families, initially identified as hetero-duplexed PCR fragments on hydrolink gels. One is an in-frame 12-bp deletion of codons 68 to 71. The other three are point mutations involving codons 190, 211, and 296. Each alters the amino acid encoded. The codon 190 mutation has been detected in 2 from a panel of 34 ADRP families, while the remaining mutations were seen in single families. This suggests that, consist
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic hepatitis B (CHB) is caused by the Hepatitis B virus (HBV) and affects millions of people worldwide. Developing an effective CHB therapy requires using in vivo screening methods, such as mouse models reflecting CHB based on hydrodynamic delivery of plasmid vectors containing a replication-competent HBV genome. However, long-term expression of HBV proteins is accompanied by production of progeny virions, thereby requiring a Biosafety Level (BSL) 3 animal facility. In the present study, we introduced a point mutation in the START codon of the HBV polymerase to develop a mouse model refle
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The explore the genetic basis for a patient with microcytic hypochromic anemia and iron deficiency anemia.
METHODS: Common deletions and variants of the globin genes were detected by Gap-PCR and next generation sequencing (NGS). Suspected mutations were verified by Sanger sequencing.
RESULTS: Gap-PCR and NGS showed that the proband has carried a αα/-α 3.7 deletion and a heterozygous c.2T>A (p.Met1Lys) mutation in the initiation codon of the HBA2 gene. The patient and her father both carried α HBA2 c.2T>A(p.Met1Lys) α/-α 3.7, while her mother and other family members were -α3.7/-α3
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rett syndrome (RTT) is a neurodevelopmental disorder caused by mutations in the X-linked MECP2 gene. Recently, a new MeCP2 isoform was described, MeCP2_e1, which skips exon 2 and has an alternative N-terminus, translated from exon 1, whereas MeCP2_e2 is translated from a start codon in exon 2. Since the incorporation of exon 1 into standard sequencing protocols for RTT, few exon 1 mutations have been described and are thus assumed to be only rare causes of RTT. Also, studies have suggested that the frameshift mutations identified in exon 1 affect both isoforms. Our aim in this study was to ass
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repeat-associated non-AUG (RAN) translation was discovered in 2011 in spinocerebellar ataxia type 8 (SCA8) and myotonic dystrophy type 1 (DM1). This non-canonical form of translation occurs in all reading frames from both coding and non-coding regions of sense and antisense transcripts carrying expansions of trinucleotide to hexanucleotide repeat sequences. RAN translation has since been reported in 7 of the 53 known microsatellite expansion disorders which mainly present with neurodegenerative features. RAN translation leads to the biosynthesis of low-complexity polymeric repeat proteins with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the core protein-coding region of hepatitis C virus (HCV), evidence exists for both phylogenetically conserved RNA structures and a +1 alternative reading frame (ARF). To investigate its role in HCV infection, we introduced four stop codons into the ARF of a genotype 1a H77 molecular clone. The changes did not alter the core protein sequence, but were predicted to disrupt RNA secondary structures. An attenuated infection was established after inoculation of the mutant HCV RNA into an HCV naïve chimpanzee. The acute infection was atypical with low peak viremia, minimal alanine aminotransfera
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic clones coding for actin have been isolated from two species of the crustacean Artemia, A. parthenogenetica and A. franciscana. The Act211 isoform gene was isolated from A. parthenogenetica, and the two other isoform genes, Act302 and Act403, were isolated from A. franciscana. The comparison of the nucleotide sequence of genomic and cDNA clones showed an interspecific divergence of 4% in translated and 6.1% in untranslated regions. However, the establishment of the partial structure of the Act211 gene in A. franciscana and of the Act302 gene in A. parthenogenetica suggests their similar
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inaccurate expression of the genetic code, also known as mistranslation, is an emerging paradigm in microbial studies. Growing evidence suggests that many microbial pathogens can deliberately mistranslate their genetic code to help invade a host or evade host immune responses. However, discovering different capacities for deliberate mistranslation remains a challenge because each group of pathogens typically employs a unique mistranslation mechanism. In this study, we address this problem by studying duplicated genes of aminoacyl-transfer RNA (tRNA) synthetases. Using bacterial prolyl-tRNA syn
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deficiency in a recently characterized lysosomal enzyme, palmitoyl-protein thioesterase (PPT), leads to a severe neurodegenerative disorder of children, infantile neuronal ceroid lipofuscinosis (NCL). Over 36 different mutations in the PPT gene have been described, and missense mutations have been interpreted in the light of the recently solved X-ray crystallographic structure of PPT. In the current study, we assessed the biochemical impact of mutations through the study of cells derived from patients and from the expression of recombinant PPT enzymes in COS and Sf9 cells. All missense mutatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Progressive proximal muscle weakness is present both in spinal muscular atrophy (SMA) type III (Kugelberg-Welander disease) and in GM2 gangliosidosis, diseases that segregate in an autosomal recessive fashion. The SMN gene for SMA and the HEXA gene for GM2 gangliosidosis were investigated in a woman with progressive proximal muscle weakness, long believed to be SMA type III (Kugelberg-Welander type). She and her family underwent biochemical studies for GM2 gangliosidosis. Analysis of SMN excluded SMA. Biochemical studies on GM2 gangliosidosis showed deficiency in hexosaminidase A activity and
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Noncoding and synonymous coding variants that exert their effects via alternative splicing are increasingly recognized as an important category of disease-causing variants. In this report, we describe two siblings who presented with hypotonia, profound developmental delays, and seizures. Brain magnetic resonance imaging (MRI) in the proband at 5 yr showed diffuse cerebral and cerebellar white matter volume loss. Both siblings later developed ventilator-dependent respiratory insufficiency and scoliosis and are currently nonverbal and nonambulatory. Extensive molecular testing including oligo ar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied 41 patients with beta-thalassaemia major and their parents by using a combination of polymerase chain reaction (PCR) amplification, slot-blot hybridization of allele-specific oligonucleotide (ASO), and direct genomic sequencing. Eight different point mutations were characterized. C to T substitution at nucleotide (nt) 654 of intervening sequences (IVS) 2, accounting for 46.3% of mutant beta-globin genes, is the most common mutation in Taiwan, followed by frameshift codons 41/42 with four nucleotides (TCTT) deletion for 31.7%, A to G substitution at position -28 of promotor area for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.