Pyrus calleryana and Pyrus betulifolia are wild pear germplasm resources characterized by robust stress resistance and diverse application potentials, serving as prominent pear rootstocks in China. However, their mitochondrial genomes (mitogenomes) remain poorly characterized. This study presents the sequencing, assembly, and comprehensive analysis of the complete mitogenomes of P. calleryana and P. betulifolia. The mitogenomes of P. betulifolia (432,496 bp) and P. calleryana (422,567 bp) are circular DNA molecules, with sizes within the known range for Pyrus and smaller than those of cultivat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumococcus kills over one million children annually and over 90 % of these deaths occur in low-income countries especially in Sub-Saharan Africa (SSA) where HIV exacerbates the disease burden. In SSA, serotype 1 pneumococci particularly the endemic ST217 clone, causes majority of the pneumococcal disease burden. To understand the evolution of the virulent ST217 clone, we analysed ST217 whole genomes from isolates sampled from African and Asian countries.
METHODS: We analysed 226 whole genome sequences from the ST217 lineage sampled from 9 African and 4 Asian countries. We constr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autism spectrum disorder (ASD) is characterized by impaired social interaction and communication, and restricted interests. It is generally accepted that ASD is caused by abnormalities in the structure or functions of the brain. Recent genome-wide analyses have identified copy number variations (CNVs) of neuronal genes in the genomes of ASD patients. CNV is a commonly observed phenomenon in human beings. During the first cell division of meiosis, irregular crossing over between homologous chromosomes results in loss or duplication of a segment. From 2007 to 2010, several groups performed a lar
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Graves' disease (GD) is a common autoimmune disorder. However, the circulating proteins that causally drive its pathogenesis remain largely unconfirmed by genetic evidence. Identifying such proteins is critical for developing novel therapeutics. Methods: We performed a two-sample Mendelian randomization (MR) analysis using genetic instruments for 4907 plasma proteins and summary statistics from a GD genome-wide association study (GWAS) of European ancestry to identify causal proteins. We subsequently conducted protein-protein interaction (PPI) network analysis and used AlphaFold3 to model the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A major area of effort in current genomics is to distinguish mutations that are functionally neutral from those that contribute to disease. Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) are amino acid substitutions that currently account for approximately half of the known gene lesions responsible for human inherited diseases. As a result, the prediction of non-synonymous SNPs (nsSNPs) that affect protein functions and relate to disease is an important task.
PRINCIPAL FINDINGS: In this study, we performed a comprehensive analysis of deleterious SNPs at both functional and structural leve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenoviruses (Ads) are icosahedral, nonenveloped viruses with a double-stranded DNA genome. The 51 known Ad serotypes exhibit profound variations in cell tropism and disease types. The number of observed Ad infections is steadily increasing, sometimes leading to fatal outcomes even in healthy individuals. Species B Ads can cause kidney infections, hemorrhagic cystitis, and severe respiratory infections, and most of them use the membrane cofactor protein CD46 as a cellular receptor. The crystal structure of the human Ad type 11 (Ad11) knob complexed with CD46 is known; however, the determinants
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To detect the ectodysplasin A (EDA) gene mutation in patients with hypohidro-tic ectodermal dysplasia (HED), and to analyze the distribution pattern of missing permanent teeth and the systemic manifestation of HED patients with EDA gene mutation.
METHODS: Twelve HED families were enrolled from clinic for genetic history collection, systemic physical examination and oral examination. Peripheral blood or saliva samples were collected from the probands and the family members to extract genomic DNA. PCR amplification and Sanger sequencing were utilized to detect the EDA gene variations
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There have been considerable recent advances in understanding the genetic architecture of Tourette syndrome (TS) as well as its underlying neurocircuitry. However, the mechanisms by which genetic variation that increases risk for TS-and its main symptom dimensions-influence relevant brain regions are poorly understood. Here we undertook a genome-wide investigation of the overlap between TS genetic risk and genetic influences on the volume of specific subcortical brain structures that have been implicated in TS. We obtained summary statistics for the most recent TS genome-wide association study
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chromosomal abnormalities are the most common cause of recurrent abortions and miscarriages (RAM), but micro-variations on chromosomes causing RAM have never been previously studied. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the single nucleotide variations frequently present at genome with the density of at least one common (>20% allele frequency) SNP per kilobase pair. It has already been reported that SNP array examination for chromosomal abnormalities has better performance than the conventional cytogenetic karyotyping.
METHODS: We applied SNP array to detect the chromosomal
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The major histocompatibility complex (MHC) genes coding for antigen presenting molecules are the most polymorphic genes in vertebrate genome. The MHC class II DRA gene shows only small variation in many mammalian species, but it exhibits relatively high level of polymorphism in Equidae, especially in donkeys. This extraordinary degree of polymorphism together with signatures of selection in specific amino acids sites makes the donkey DRA gene a suitable model for population diversity studies. The objective of this study was to investigate the DRA gene diversity in three different populations o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sex-biased dispersal potentially underpins the genetic structural mismatch in genetic structure between differently inherited genetic loci, but accurately evaluating the effect of sex-biased dispersal is challenging due to other sex-biased traits and limitations in usable data. Brown bears exhibit extreme male-biased dispersal, with significant genetic differences between maternally and paternally inherited loci. This study aims to investigate how the characteristic genetic structure in Hokkaido, Japan has been shaped and to evaluate the influence of male-biased dispersal and environmental bar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The majority of genetic variations in the human genome that lead to variety of different diseases are caused by non-synonymous single nucleotide polymorphisms (nsSNPs). Neurofibromatosis type 2 (NF2) is a deadly disease caused by nsSNPs in the NF2 gene that encodes for a protein called merlin. This study used various in silico methods, SIFT, Polyphen-2, PhD-SNP and MutPred, to investigate the pathogenic effect of 14 nsSNPs in the merlin FERM domain. The G197C and L234R mutations were found to be two deleterious and disease mutations associated with the mild and severe forms of NF2, respectivel
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Owing to clonal inheritance, haploid status and lack of recombination, structural polymorphism in the human Y chromosome is more prevalent than that in the remaining parts of the genome. We studied structural organization of the AZFc region, assessed microdeletions therein and studied copy number variation (CNV) of several candidate genes in 750 Indian males. FISH mapping of 13 Y-specific BAC/cosmid clones uncovered a hitherto unreported AZFc configuration showing inter-DAZ gene sequence onto the Yp instead of Yq region. Such inter-DAZ gene arrangements were also detected in five German males
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue (DEN) constitutes a major viral arthropod-borne human illness. South America was last considered free of dengue two decades ago when a dramatic increase in the number of dengue fever and hemorrhagic dengue cases had been reported. Five viruses were isolated in Buenos Aires City from the 1999-2000 Paraguay outbreak. RT-PCRs obtained directly from plasma were cloned into pGemT vectors and sequences of the structural genes and NS1 were analyzed. Three viruses were full-length sequenced from RT-PCR obtained from cell-culture isolates. Excess of synonymous over non-synonymous mutations sugge
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Snake venoms are complex biochemical systems that function primarily in prey subjugation and defense, yet their composition varies extensively across individuals, populations, species, and environments. This variation provides a powerful framework for investigating ecological and evolutionary processes. Here, we offer a forward-looking synthesis of snake venom diversity that proposes new research directions and highlights how venom variation can illuminate eco-evolutionary dynamics across biological scales. We review evidence for 10 key contexts in which venom variation arises, including withi
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Siraitia grosvenorii (monk fruit) is a dioecious medicinal crop native to southern China, yet its terpene synthase (TPS) gene family and the molecular basis of floral sexual dimorphism remain unexplored.
METHODS: Genome-wide identification of the TPS gene family was performed using HMMER and BLAST-based approaches. Phylogenetic classification, gene structure and conserved motif characterization, and comparative synteny analyses were conducted. Transcriptome data from leaves and fruits at different developmental stages were analyzed for tissue-specific expression profiling. Promote
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A major challenge in clinical genomics is to classify genetic variations correctly, since it directly affects disease diagnosis and personal care. The existing methods tend to be based on the combination of different factors, such as protein structure, population frequencies, phenotypic annotations, and sequence conservation. Nevertheless, these methods often cannot be used to achieve the necessary interpretability, quantify uncertainty, and address rare cases. This paper presents a probabilistic gradient boosting model on variant pathogenicity prediction. The suggested framework applies biolo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Providencia alcalifaciens is a gut commensal bacterium and also an emerging enteric pathogen associated with sporadic infections and outbreak cases in humans. The most notable outbreak caused by this bacterium occurred in 1996 in Fukui Prefecture, Japan, affecting 270 individuals. However, the pathogenic mechanisms responsible for this outbreak remain unknown. In this study, we identified the key virulence determinants of the Fukui outbreak strains through genomic and functional analyses. These strains uniquely carry a ~162 kb large plasmid encoding a type III secretion system (T3SS) closely h
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Japanese encephalitis virus is an arbovirus that causes severe damage to the central nervous system. At present, there are still 67,900 cases of Japanese encephalitis worldwide every year, which poses a global public health concern and causes great economic losses to animal husbandry. In this study, we analyzed the epidemiology, transmission, and evolution of JEV based on the NCBI database. E and NS1 were emphatically analyzed for amino acid variation and predicted protein structure. Gene recombination and the evolutionary rate of JEV were analyzed using RDP 4 and BEAST. The maximum clade
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An intricate interplay between evolutionary and demographic processes has frequently resulted in complex patterns of genetic and phenotypic diversity in alpine lineages, posing serious challenges to species delimitation and biodiversity conservation planning. Here we integrate genomic data, geometric morphometric analyses and thermal tolerance experiments to explore the role of Pleistocene climatic changes and adaptation to alpine environments on patterns of genomic and phenotypic variation in diving beetles from the taxonomically complex Agabus bipustulatus species group. Genetic structure an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования