Toxoplasmosis is a parasitic disease caused by infection with Toxoplasma gondii, capable of infecting a wide range of hosts. The parasite exhibits a broad genetic diversity, necessitating genotypic characterization for genotype identification and associations with epidemiological information. Therefore, the Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) technique is used for characterization. This study aimed to perform genotypic characterization of isolates from pregnant women infected during a human toxoplasmosis outbreak, comparing the RFLP and Sanger Sequencing methodologies. For this pur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conducting genomic selection (GS) in plant breeding programs can substantially speed up the development of new varieties. GS provides more reliable insights when it is based on dense marker data, in which the rare variants can be particularly informative. Despite the availability of new technologies, the cost of large-scale genotyping remains a major limitation to the implementation of GS. We suggest to combine pooled genotyping with population-based imputation as a cost-effective computational strategy for genotyping SNPs. Pooling saves genotyping tests and has proven to accurately capture th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bandavirus dabieense (DBV), the pathogen of SFTS that was included in the WHO's list of priority infectious diseases requiring urgent attention in 2017, belongs to a large and highly diverse class of RNA viruses. Currently, the lack of a unified DBV genotyping standard and the confusion among common genotyping systems cause research result discrepancies and limit the clinical use of genotype data. Here, we re-clustered 738 DBV S-segment sequences from GenBank and identified seven clades (DS1-DS7), and elucidated the horizontal relationships among different genotyping results by comparing these
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter summarized the taxonomy and typing works of Yersinia pestis since it's firstly identified in Hong Kong in 1894. Phenotyping methods that based on phenotypic characteristics, including biotyping, serotyping, antibiogram analysis, bacteriocin typing, phage typing, and plasmid typing, were firstly applied in classification of Y. pestis in subspecies level. And then, with the advancement of molecular biological technology, the methods based on outer membrane protein profiles, fatty acid composition, and bacterial mass fingerprinting were also used to identify the populations within Y.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori (H. pylori) infection correlates closely with gastric diseases such as gastritis, ulcers, and cancer, influencing more than half of the world's population. Establishing a rapid, precise, and automated platform for H. pylori diagnosis is an urgent clinical need and would significantly benefit therapeutic intervention. Recombinase polymerase amplification (RPA)-CRISPR recently emerged as a promising molecular diagnostic assay due to its rapid detection capability, high specificity, and mild reaction conditions. In this work, we adapted the RPA-CRISPR assay on a digital microf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular surveillance of pathogenic microbes works by genotyping isolates with DNA fingerprinting techniques and then using these genotypes to assign individuals to populations. Clonality is assumed in many fingerprinting studies, although this assumption has been shown to be false for many organisms. To accommodate recombining organisms into surveillance programs, methods using population allele frequencies in combination with individual multilocus genotypes are necessary. Here, we develop a statistical method appropriate for haploid recombining microbes that allows individuals to be assigne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variants of p16(INK4a) and p14(ARF), encoded by the CDKN2A locus, may respond differently to the presence of human papillomavirus (HPV). We investigated the potential association of two CDKN2A polymorphisms, 500C > G (rs11515) and 540C > T (rs3088440), with cervical neoplasia in patients with cervical lesions and healthy controls (n = 492). Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP), single-strand conformation polymorphism (SSCP) and/or DNA sequencing techniques were employed for genotyping. The 500G allele was found higher, whereas the 540T/T genotype was le
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR/Cas12a system is extensively employed for nucleic acid detection, where crRNA is typically administered in excess to quantify target levels. However, its non-specific trans-cleavage activity poses challenges for achieving multiplexed detection within a single-pot CRISPR/Cas12a assay. In this study, we introduce a crRNA-limited strategy for multiplexed detection based on the CRISPR/Cas12a system, termed cliCRISPR. This approach correlates fluorescence intensity with crRNA concentration rather than target concentration. By precisely controlling crRNA concentrations, distinct low, medi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The international journal of tuberculosis and lung disease : the official journal of the International Union against Tuberculosis and Lung Disease2015eng
SETTINGS: The new Anyplex™ II MTB/MDR/XDR PCR assay enables the joint analysis of mutations conferring resistance to first- and second-line anti-tuberculosis drugs and the detection of Mycobacterium tuberculosis.
OBJECTIVES: To evaluate the performance of the new Anyplex assay in detecting mutations that confer resistance to first- and second-line drugs in M. tuberculosis cultures.
DESIGN: Results obtained using the new technique were compared with those obtained by phenotypic drug susceptibility testing (DST) and with two GenoType tests for the detection of mutations: GenoType(®) MTBDRplus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of 16S rRNA methyltransferase (16S-RMTases) poses a major therapeutic challenge, as they confer high-level resistance to all clinically relevant aminoglycosides. In Chile, data on these enzymes remain scarce. This study investigated the epidemiological distribution and genetic relatedness of Klebsiella pneumoniae strains carrying 16S-RMTase genes. Antibiotic susceptibility was assessed using the Kirby-Bauer method and complementary techniques. Gene detection was performed via conventional PCR, and genotyping via ERIC-PCR. Among 1,200 K. pneumoniae clinical strains collected betwe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we located eight samples with null alleles of amelogenin out of 10,750 cases, and discussed the influence in gender identification and forensic personal identification. Amelogenin was detected and retested by several autosomal STR kits and sex chromosomal STR kits, and the causes were analyzed by chromosome karyotype analysis and Y chromosome microdeletion detection if necessary. Suspected AMEL-X loss was observed in five samples, but no abnormality was detected in the X-STR loci. AMEL-X was recovered when samples were retested by other detection systems designed with different
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Reports on the incidence of hydatidiform mole (HM) have varied depending on study population and methodology. This institutional-based study was undertaken to identify the incidence of HM in a modern obstetric practice using advanced laboratory diagnostic techniques.
METHODS: A retrospective review of consecutive hospital cases of HM was conducted for a 27-month period. Pathologic diagnoses of partial mole (PM) and complete mole (CM) were based on histopathologic assessment and selective use of p57 immunohistochemistry and molecular genotyping (MG) using formalin-fixed paraffin-emb
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The human papillomavirus (HPV) family is characterized by minimal genotypic differences corresponding to different virus types. The aim of this study was to detect the HPV coinfections and the inner genotype in a series of 336 cervical-vaginal samples.
METHODS: A total of 336 cervical-vaginal samples were taken from 2007 to 2009 using specific molecular techniques such as molecular sequencing and hybridizations. The genome amplification of the L1 open reading frame was analyzed by real-time polymerase chain reaction; direct sequencing was performed by SYBR green fluorescent mole
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While previous studies have investigated the utility of Luminex technology in comparison to other standard techniques, there have been few studies directly comparing different bead-based assays. A key barrier to establishing Luminex technology in research or clinical laboratories is the apparent need to purchase not only encoded bead sets but also the Luminex instrument. However, as flow cytometry instrumentation continues to improve in sensitivity and in the number and diversity of detection parameters, a diverse range of bead-based assays is likely to emerge. Human papillomavirus (HPV) genot
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Haemophilus parasuis is a colonizer of the upper respiratory tract of pigs, although it is better known as the etiological agent of Glässer's disease. Interestingly, several strains can be isolated from a single farm, as determined by both genotyping and serotyping. However, it is not known how an outbreak and the subsequent treatment affect the population of H. parasuis strains. In this study, a farm was studied during an outbreak of Glässer's disease and 1 year after antimicrobial treatment and elimination of clinical signs. Bacterial isolation was attempted from nasal swabs and lesions. Aft
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The number of women infected with human papillomavirus (HPV) and the distribution of the HPV genotypes vary across populations and with age.
OBJECTIVE: To determine the prevalence and genotype distribution of HPV in young married women aged 16-24 years.
METHODS: 1300 women residing in an urban slum in Delhi donated samples of exfoliated cervical cells that were collected by the Digene((R)) kit and tested for the presence of HPV DNA by two techniques in parallel, i.e., PCR using PGMY consensus primers for all HPV types and the Digene HPV test (Hybrid Capture 2 (HC2) Probe B for hi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pneumocystis jirovecii is the causative agent of Pneumocystis pneumonia (PCP) in immunocompromised persons. Knowledge of the transmission and epidemiology of PCP is still incipient, and investigations on these subjects are based exclusively on applications of molecular typing techniques. The polymorphic internal transcribed spacers ITS1 and ITS2 in the ribosomal DNA operon, which in the P. jirovecii genome exist as single-copy DNA, are commonly used as target loci for isolate typing. In the course of genotyping P. jirovecii in respiratory specimens from PCP patients by amplification and clonin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Traditionally, blood group typing has been performed with serologic techniques, the classical method being the hemagglutination test. Serotyping, however, may present important limitations such as scarce availability of rare antisera, typing of recently transfused patients, and those with a positive direct antiglobulin test. Consequently, serologic tests are being complemented with molecular methods. The aim of this study was to develop a low-cost, high-throughput method for large-scale genotyping of red blood cells (RBCs).
STUDY DESIGN AND METHODS: Single-nucleotide polymorphisms
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of Pneumocystis jiroveci drug resistance has been suggested recently by the mutations in the gene encoding dihydropteroate synthase (DHPS). The aim of the present study was to determine the prevalence of DHPS mutations in P. jiroveci strains isolates from bronchoalveolar lavages (BAL) and sputum samples of 21 immunocompromised patients. We used the touchdown-PCR for amplification of DHPS gene and the restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique for discrimination of wild and mutant DHPS genotypes. The DHPS amplification was positive in 17 patients (81%). The associat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
On 6 May 2000, a staphylococcal food poisoning outbreak occurred at a high school, affecting 10 of the 356 students who attended the breakfast. Twenty-seven Staphylococcus aureus isolates, producing enterotoxin A (SEA), SEB-, or non-SEA-E, were recovered from 7 patients, 2 food handlers and left-overs. To investigate the outbreak, we genotyped the isolates by using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and three PCR-based techniques: inter-IS256 PCR typing, protein A gene (spa) typing, and coagulase gene restriction profile (CRP) analysis. Our results show that PFGE was the most discriminato
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования