In this paper an overview of the present knowledge on antibodies against DNA will be presented. Diagnostic, prognostic and pathogenic aspects of anti-DNA will be highlighted. Detection of antibodies to DNA in the circulation of a patient by an assay selective for high avidity anti-DNA is highly diagnostic for SLE. Anti-DNA of low avidity occurs in rheumatic diseases other than SLE as well, making detection of such antibodies of less diagnostic value. Furthermore, data will be presented that show that the anti-DNA ELISA in its present form is not suited as a diagnostic tool. Not only disease fe
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methyltransferases are drug targets for myelodysplastic syndrome (MDS), chronic myelomonocytic leukemia (CMML), acute myelogenous leukemia (AML) and possibly β-hemoglobinopathies. We characterize the interaction of nucleoside analogues in DNA with a prokaryotic CpG-specific DNA methyltransferase (M.MpeI) as a model for mammalian DNMT1 methyltransferases. We tested DNA containing 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), 5-hydroxycytosine (5OHC), 5-methyl-2-pyrimidinone (in the ribosylated form known as 5-methylzebularine, 5mZ), 5,6-dihydro-5-azacytosine (dhaC), 5-fluorocytosine (5FC), 5-chlorocytosi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Damage to DNA is generally considered to be a harmful process associated with aging and aging-related disorders such as neurodegenerative diseases that involve the selective death of specific groups of neurons. However, recent studies have provided evidence that DNA damage and its subsequent repair are important processes in the physiology and normal function of neurons. Neurons are unique cells that form new neural connections throughout life by growth and re-organisation in response to various stimuli. This "plasticity" is essential for cognitive processes such as learning and memory as well
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pentachlorophenol (PCP) is a possible human carcinogen detected widely in the environment. A quinone metabolite of PCP, tetrachloro-1,4-benzoquinone (Cl4BQ), is a reactive electrophile with the capacity to damage DNA by forming bulky covalent DNA adducts. These quinone adducts may contribute to chlorophenol carcinogenesis, but their structures, occurrence, and biological consequences are not known. Previous studies have indicated that several DNA adducts are formed in vivo in rats exposed to Cl4BQ, but these adducts were not identified structurally. In the present study, we have elucidated the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Borrelia DNA was detected by polymerase chain reaction in the blood of patients who had suffered from tick suction. DNA was revealed in 28.7 of the blood samples from patients with the erythematous form of Ixodes tick-born borrelioses (ITBB) and in 14.3% of those diagnosed as having tick-borne encephalitis. Blood Borrelia DNA was not detected in patients with end-stage and chronic ITBB. Comparing the results of detection of DNA with those Borrelia protein antibodies has shown that the antibody titers detectable in the patients having Borrelia DNA are lower than those in the patients with the s
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phase separation model for transcription suggests that transcription factors (TFs), coactivators, and RNA polymerases form biomolecular condensates around active gene loci and regulate transcription. However, the structural details of condensates remain elusive. In this study, for Nanog, a master TF in mammalian embryonic stem cells known to form protein condensates in vitro, we examined protein structures in the condensates using residue-level coarse-grained molecular simulations. Human Nanog formed micelle-like clusters in the condensate. In the micelle-like cluster, the C-terminal disor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication protein A (RPA), the trimeric single-stranded DNA-binding protein complex of eukaryotic cells, is important to DNA replication and repair. Phosphorylation of the p34 subunit of RPA is modulated by the cell cycle, occurring during S and G2 but not during G1. The function of phosphorylated p34 remains unknown. We show that RPA p34 phosphorylation is significantly induced by ionizing radiation. The phosphorylated form, p36, is similar if not identical to the phosphorylated S/G2 form. gamma-Irradiation-induced phosphorylation occurs without new protein synthesis and in cells in G1. Mut
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA-protein complexes induced in intact cells by chromate have been isolated and compared with those formed by other agents such as cis-platinum. Actin has been identified as one of the major proteins that is complexed to the DNA by chromate based upon a number of criteria including, a molecular weight and isoelectric point identical to actin, positive reaction with actin polyclonal antibody, and proteolytic mapping. Chromate and cis-platinum both complex proteins of very similar molecular weight and isoelectric points and these complexes can be disrupted by exposure to chelating or reducing a
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Closely spaced long inverted repeats, also known as DNA palindromes, can undergo intrastrand annealing to form DNA hairpins. The ability to form these hairpins results in genome instability, difficulties in maintaining clones in Escherichia coli and major problems for most DNA sequencing approaches. Because of their role in genomic instability and gene amplification in some human cancers, it is important to develop systematic approaches to detect and characterize DNA palindromes.
RESULTS: We developed a new protocol to identify palindromes that couples the S1 nuclease treated Cot0
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the human ChlR1 (DDX11) gene are associated with a unique genetic disorder known as Warsaw breakage syndrome characterized by cellular defects in genome maintenance. The DNA triplex helix structures that form by Hoogsteen or reverse Hoogsteen hydrogen bonding are examples of alternate DNA structures that can be a source of genomic instability. In this study, we have examined the ability of human ChlR1 helicase to destabilize DNA triplexes. Biochemical studies demonstrated that ChlR1 efficiently melted both intermolecular and intramolecular DNA triplex substrates in an ATP-dependen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cu-TMPipPrOPP and Zn-TMPipPrOPP, two new cationic metallo derivatives of TMPipPrOPP (5,10,15,20-tetrakis{4-[3-(1-methyl-1-piperidinyl)propoxy]phenyl}porphyrin), a porphyrin with four bulky side chains, were synthesized and characterized. The interactions of the new metalloporphyrins with structurally different DNAs were then compared with those of TMPipPrOPP. The introduction of bulky side chains provides the porphyrin derivatives with excellent binding specificity for G-quadruplex DNA, which is reflected by (1) the significantly different optical responses of TMPipPrOPP toward G-quadruplexes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stabilized trimers of the HIV-1 Env surface glycoprotein are considered as one of the main directions in the design of an HIV-1 vaccine, both individually and in prime-boost immunization strategies. The article presents the results of a study of the immunogenicity of the Env trimer of the recombinant HIV-1 CRF63_02A6 in the form of a recombinant protein and a DNA vaccine, as well as in the prime-boost immunization scheme. The Env trimer in the form of a protein and a DNA vaccine induced the formation of specific antibodies with virus-neutralizing activity against HIV-1 Env-pseudoviruses.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Previous studies from our research group have shown that trisomy 8 and the amplification of the 8q24.21 region is very frequent in gastric cancer (GC). Little is known about the role of most genes located in this region. Thus, the aim of this study was to understand the possible impact of transcriptional alterations and copy number variation (CNV) of four genes located in the 8q24.21 region - FAM49B, FAM84B, GSDMC and miR-5194 - in GC.
MATERIALS AND METHODS: Fifty-one to 85 matched pairs of tumoral and adjacent non-tumoral gastric tissues, from patients with primary GC, were u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circular triplex-forming oligonucleotides (CTFOs) have previously been shown to bind tightly to short single-stranded homopurine DNAs in a sequence-specific manner. In view of the importance of double-stranded DNA as a target in the development of gene-specific therapeutic and diagnostic agents, we have investigated the binding of CTFOs to double-helical DNA.
RESULTS: DNA-binding experiments show that a CTFO can recognize its homopurine target when the target is embedded in a long duplex. Unlike their linear counterparts, CTFOs bind the double helix in two topologically distinct f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The "Mg(2+)-Sarkosyl crystals" (M band) technique distinguishes between membrane-bound and free intracellular DNA. This procedure was employed to investigate the nature of the reactions necessary to convert input T4 DNA to a rapidly sedimenting form. Energy poisoning inhibits this attachment reaction. Neither protein nor DNA synthesis appears to be required, but experiments with rifampin and extensively irradiated T4 suggest that RNA synthesis is involved. These results were confirmed by a second procedure for the determination of rapidly sedimenting DNA.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A female Japanese xeroderma pigmentosum (XP) patient with severe skin lesions and various neurologic abnormalities was assigned to complementation group A by conventional cell fusion studies. Ultraviolet (UV)-irradiated skin fibroblasts showed a biphasic survival curve, as measured by colony-forming ability. The surviving fraction decreased rapidly up to 2 J/m2 of UV, with a steep slope of D(O) (mean lethal dose) = 0.95 J/m2. At much higher doses it decreased more slowly, with D(O) = 3.5 J/m2. To èlucidate the cause of this unique survival response, we isolated a large number of independent cl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ATM protein kinase regulates the response of the cell to DNA damage by associating with and then phosphorylating proteins involved in cell cycle checkpoints and DNA repair. Here, we report on deletion studies designed to identify protein domains required for ATM to phosphorylate target proteins and to control cell survival following exposure to ionizing radiation. Deletion studies demonstrated that amino acids 1-150 of ATM were required for the ATM protein to regulate cellular radiosensitivity. Additional deletions and point mutations indicated that this domain extended from amino acids 81
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stress-induced misfolding and intraneuronal aggregation of the highly conserved nucleic acid binding protein TDP-43 (transactive response DNA binding protein 43 kDa) and its fragments have been implicated in amyotrophic lateral sclerosis and several other neurodegenerative diseases. However, the physicochemical mechanism of its misfolding from the functional folded state is poorly understood. TDP-43 is a four-domain protein and performs the essential nucleic acid binding function with the help of its two tandem RNA recognition motif domains naturally tethered by a linker (called here the tethe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ustilago maydis is a dimorphic basidiomycete that exists as a yeast-like haploid form and a filamentous dikaryotic form. The yeast-like morphology is exploited for protoplast-based, PEG (polyethylene glycol)-mediated transformation, which is a simple and reliable means for introducing DNA into protoplasts. In U. maydis, this approach has been widely used for gene deletion/insertion, complementation, and transgene expression. In short, U. maydis yeast-like cells are grown to mid-log phase, and their cell walls are enzymatically digested in the presence of an osmotic stabilizer to generate stabl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leprosy urgently needs a precise and early diagnostic tool. The sensitivity of the direct (bacilli staining, Mycobacterium leprae DNA) and indirect (antibody levels, T cell assays) diagnostics methods vary based on the clinical form. Recently, PCR-based M. leprae DNA detection has been shown to differentially diagnose leprosy from other dermatological conditions. However, accuracy can still be improved, especially for use with less invasive clinical samples. We tested different commercial DNA extraction kits: DNeasy Blood & Tissue, QIAamp DNA Microbiome, Maxwell 16 DNA Purification, PowerSoil
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.