Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
НовостьПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: CRISPR-Cas13a biosensing enables rapid, amplification-free RNA diagnostics, yet assay sensitivity varies widely because guide RNAs (gRNAs) differ in their ability to activate the enzyme. Two factors, including the gRNA-target binding affinity and the structural accessibility of the target site, have been proposed to govern activation efficiency, but their relative importance remains unclear. In this study, we systematically disentangle these contributions by measuring binding affinities for gRNAs that span a spectrum of site accessibilities and by comparing their Michaelis-Menten k
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The detection of non-nucleic acid targets encapsulated in extracellular vesicles (EVs) faces two major challenges: (1) difficulties in efficient isolation and the risk of content degradation, and (2) the low abundance of target molecules encapsulated in EVs always leads to failed signal transduction and inadequate output signal intensity. To overcome these limitations, we propose a high-efficiency in-vesicle analysis strategy that integrates targeting probe delivery and regulation by protein signal amplification. By applying aptamer-mediated membrane fusion and "locked-activated" CRISPR-Cas12a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR-Cas systems are adopted as powerful molecular tools for not only genetic manipulation but also point-of-care diagnostics. However, methods to enable diagnostics of non-nucleic-acid targets with these systems are still limited. Herein, by fusing ligand-dependent allosteric ribozymes with CRISPR-Cas12a, a derived CRISPR-Cas system is created for efficient quantitative analysis of non-nucleic-acid targets in 1-2 h. On two different small molecules, the system's generality, reliability and accuracy is demonstrated, and show that the well operability of this system can enable high-throug
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)/CRISPR-associated sequence (CRISPR/Cas) system is a cutting-edge genome-editing tool employed to explore the functions of normal and disease-related genes. The CRISPR/Cas system has a remarkable diversity in the composition and architecture of genomic loci and Cas protein sequences. Owing to its excellent efficiency and specificity, this system adds an outstanding dimension to biomedical research on genetic manipulation of eukaryotic cells. However, safe, efficient, and specific delivery of this system to target cells and t
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cas12a, with its unique targeting and cleavage activity towards DNA, has been widely applied in gene editing and molecular diagnostics. However, there currently lacks an activity regulation strategy that combines flexibility and simplicity to adapt Cas12a to different demands across various application scenarios. In this study, we present a simple yet effective strategy, wherein we systematically mutate the crRNA direct repeat (DR) sequence to uncover a range of distinct crRNA mutants, which are then compiled into a crRNA toolbox to enable flexible regulation of Cas12a activity. By harnessing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The capacity to efficiently deliver the gene-editing enzyme complex to target cells is favored over other forms of gene delivery as it offers one-time hit-and-run gene editing, thus improving precision and safety and reducing potential immunogenicity against edited cells in clinical applications. Here we performed a proof-of-mechanism study and demonstrated that a simian adenoviral vector for DNA delivery can be repurposed as a robust intracellular delivery platform for a functional Cas9/guide RNA (gRNA) complex to recipient cells. In this system, the clinically relevant adenovirus was genetic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplexed protein profiling of tumor-derived small extracellular vesicles (TsEVs) requires signal-conversion strategies that are sensitive, low-background, and orthogonal. Collateral-cleavage CRISPR assays based on Cas12a or Cas13a provide efficient amplification but can compromise single-pot multitarget detection, whereas the sequence-specific cleavage of Cas9 remains underexplored for converting vesicle-surface protein recognition into orthogonal amplified outputs. Here, we report CHAI-sEV, a programmable Cas9-mediated trigger-release strategy based on PAM-bearing hairpin-locking probes (P
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We constructed a CRISPR/Cas12a autocatalytic system based on a miRNA-triggered overhang blocker (OB) cleavage-recombination framework, in which Cas12a sequentially removed steric hindrance to initiate cyclic autocatalysis, enabling exponential signal amplification for visual miRNA detection without target pre-amplification, thereby overcoming direct Cas12a recognition limitations for point-of-care diagnostics.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR/Cas-derived base editors harness various deaminase or glycosylase activities to target bases within non-target strand (NTS) of the R-loop, catalyzing base conversions independent of double-strand break formation. To develop miniature BEs compatible with therapeutic viral vectors, we explore the compact Cas12f system. Through computational modeling and mutagenesis, we establish a highly active enUn1Cas12f1 protein, and subsequently construct the derivative cytosine BE (CBE). Remarkably, the engineered CBE exhibits an unexpected activity to also edit the target strand (TS), indicating its
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas systems inherently lack spatiotemporal control over cleavage events, compromising their accuracy and efficiency in biotechnological applications. Although advances have been made in regulating these systems, developing modular activatable platforms adaptable to diverse stimuli remains challenging. To address this limitation, we developed an innovative modular activatable CRISPR-Cas12a system by engineering a crRNA scaffold with a steric hindrance effector (SHE) motif at its 3'-terminus, attached via a stimulus-cleavable linker. Through systematic evaluation of SHEs with varied sizes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium species cause several vital human diseases, including tuberculosis and non-tuberculous mycobacterial infections, which are treated with different drug regimens Therefore, accurate and rapid diagnosis is essential for effective treatment and controlling the spread of these pathogens. This study aims to develop an isothermal method combining RPA and CRISPR-Cas12a techniques, named as MyTRACK, to detect and differentiate major clinical mycobacteria at the species level. The assay has no cross-reactivity with limit of detection of 1 to 100 copies/reaction for various targeted mycobac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type IV-C CRISPR-Cas systems remain enigmatic compared to other class 1 systems. Here, we expand the type IV-C catalog, identifying two phylogenetically distinct clades primarily found in archaea (IV-C1) or bacteria (IV-C2), distinguishable by the Cas10IVc subunit architecture. We functionally and structurally characterize type IV-C1 systems from Thermococcus onnurineus (Ton) and Pyrococcus abyssi (Pab). Type IV-C complexes assemble with crRNAs derived from distinct CRISPR arrays and recognize a 5'-GGG-3' protospacer adjacent motif (PAM) to bind double-stranded DNA targets. Target recognition
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A large number of SpCas9 orthologs has been computationally identified, but their genome editing potential remains largely unknown. In this study, a GFP-activation assay was used to screen a panel of 18 SpCas9 orthologs, ten of which demonstrated activity in human cells. Notably, these orthologs had a preference for purine-rich PAM sequences. Four of the tested orthologs displayed enhanced specificity compared to SpCas9. Of particular interest is SeqCas9, which recognizes a simple NNG PAM and displays activity and specificity comparable to SpCas9-HF1. In addition, SeqCas9 exhibits superior bas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Today, new methods have been developed to treat or modify the natural course of cardiovascular diseases (CVDs), including atherosclerosis, by the clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR-associated protein 9 (CRISPR-Cas9) system. Genome-editing tools are CRISPR-related palindromic short iteration systems such as CRISPR-Cas9, a valuable technology for achieving somatic and germinal genomic manipulation in model cells and organisms for various applications, including the creation of deletion alleles. Mutations in genomic deoxyribonucleic acid and new genes' placement have
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR/Cas9 system is a powerful genetic engineering technology for Plasmodium falciparum. We here report further improvement of the CRISPR/Cas9 system by combining the Cas9-expressing parasite with a liner donor template DNA. The Cas9-expressing parasite was generated by inserting the cas9 gene in the genome by double crossover recombination. The site-directed mutagenesis and the fusion of fluorescence protein was achieved within two weeks with high efficiency (> 85%), by transfecting the schizonts of the Cas9-expressing parasite with the liner donor template and the plasmid carrying the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas13a is mainly known as an RNA-guided RNA endonuclease. Recent studies show that Leptotrichia buccalis Cas13a (LbuCas13a) can interact with DNA substrates too, without PAM or PFS constraints, but current understanding of DNA-mediated activation is largely based on continuous target strands. Here, we define a structural accessibility principle for LbuCas13a activation by noncontiguous DNA. We show that activation occurs only when overhang positioning creates an accessible protein-DNA interface. Outer overhangs near the crRNA repeat-adjacent side restore strong trans-cleavage activity b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Measures to combat the Plasmodium parasites which cause malaria have become compromised because of reliance on a small arsenal of drugs, emerging drug resistance and the lack of effective vaccines. A promising avenue for addressing these challenges is the revolutionary gene-editing technology CRISPR-Cas9, due to its high efficiency and ease of design for genetic manipulation. The catalytically inactive Cas9 (dCas9)-microbial single-stranded annealing proteins (SSAP)(dCas9-SSAP) is a recently emerged next-generation gene editing system added to the ever-growing CRISPR-Cas9-based technologies. W
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome editing approach by clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/associated protein 9 (CRISPR/Cas9) is a revolutionary advancement in genetic engineering. Owing to its simple design and powerful genome-editing capability, it offers a promising strategy for the treatment of different infectious, metabolic, and genetic diseases. The crystal structure of Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9) in complex with sgRNA and its target DNA at 2.5 Å resolution reveals a groove accommodating sgRNA:DNA heteroduplex within a bilobate architecture with target recognition (REC)
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas12a is a programmable RNA-guided endonuclease whose activation by double-stranded DNA normally depends on the recognition of an adjacent protospacer-adjacent motif (PAM), which constrains target selection in diagnostic applications. Here, we divide the DNA activator into PAM-proximal (Pp) and PAM-distal (Pd) duplexes, spatially separating the PAM requirement from the interrogation of a PAM-less target sequence. FRET, electrophoretic mobility shift, fluorescence polarization, and functional assays indicate that either fragment can associate with Cas12a, but that robust productive acti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования