BACKGROUND: Severe asthma (SA) has been a challenging health issue worldwide. In this view, a complementary study of gene expression profiles could be helpful. Protein-protein interaction network analysis could help better understand the molecular changes and, ultimately, the underlying mechanisms of treatment approaches. The identification of the critical genes involved in severe asthma is the main aim of this study.
MATERIALS AND METHODS: Data were retrieved from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and pre-evaluated via GEO2R to find the significantly differentially expressed genes (
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe eosinophilic asthma is a treatment-resistant subtype that remains poorly controlled with conventional therapies. According to the latest European Respiratory Society (ERS) guidelines, anti-interleukin-5 (anti-IL-5) biologics such as mepolizumab are recommended for these patients. However, not all individuals respond favorably to mepolizumab. This study aimed to identify gene expression biomarkers predictive of therapeutic response to mepolizumab, facilitating early identification of likely responders. Transcriptomic data (GSE274410) were obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Множественный склероз (MS) — аутоиммунное и нейродегенеративное заболевание, затрагивающее примерно 1 миллион человек в Соединенных Штатах. Несмотря на обширные исследования механизмов развития заболеваний, многие аспекты биологических изменений в ходе НР и различные симптомы среди пациентов остаются неясными. В эпоху секвенирования с высокой производительностью транскриптомные базы данных заполняются данными. Однако массивные данные о последовательности РНК (RNA-seq) обычно используются только для дифференциального анализа экспрессии генов. Альтернативное скрещивание - ключевой процесс, котор
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dyslexia is a learning disability that negatively affects reading, writing, and spelling development at the word level in 5%-9% of children. The phenotype is variable and complex, involving several potential cognitive and physical concomitants such as sensory dysregulation and immunodeficiencies. The biological pathogenesis is not well-understood. Toward a better understanding of the biological drivers of dyslexia, we conducted the first joint exome and metabolome investigation in a pilot sample of 30 participants with dyslexia and 13 controls. In this analysis, eight metabolites of interest e
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is no doubt that alternative splicing is conserved in chickens and mammals, but evaluating the effects of nutrition on alternative splicing in chickens is crucial in a wide range of fields. Although the olive diet has been extensively studied in human, mouse, and chicken systems, little is known about its impact on chicken alternative splicing systems. Hence, the current study aimed to assess the effect of feeding polyphenol-enriched olive mill wastewater to female broiler chickens via alternative splicing by analyzing high-throughput sequencing raw reads of RNA utilizing genomics and bi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aims to explore the expression of hnRNP K in cervical carcinogenesis and to investigate the regulatory role of hnRNP K on HPV16 oncogene expression as well as biological changes in cervical cancer cells.
METHODS: In total 1042 subjects, including 573 with the normal cervix and 469 with different grades of cervical lesions were enrolled in this study to explore the association between hnRNP K and HPV16 oncogene expression in cervical carcinogenesis. Additionally, the Gene Omnibus (GEO) database was used to analyze hnRNP K mRNA expression in cervical cancerization. Meanwhile
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) was used to understand the pathogenesis of subacute ruminal acidosis (SARA) and identify potential genes related to the disease. Microarray data from dataset GSE143765, which included 22 cows with and nine cows without SARA, were downloaded from the NCBI Gene Expression Omnibus (GEO). Results of WGCNA identified highly correlated modules of sample genes, and Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analyses allowed further biological insights into SARA-related modules. The protein-protein inter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To screen the differentially expressed proteins (DEPs) in human bronchial epithelial cells (HBE) treated with atmospheric fine particulate matter (PM 2.5).
METHODS: HBE cells were treated with PM 2.5 samples from Shenzhen and Taiyuan for 24 h. To detect overall protein expression, the Q Exactive mass spectrometer was used. Gene ontology (GO), Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG), and Perseus software were used to screen DEPs.
RESULTS: Overall, 67 DEPs were screened in the Shenzhen sample-treated group, of which 46 were upregulated and 21 were downregulated. In total, 252
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Critics of organ donation after circulatory death (DCD) argue that, even if donors are past the point of autoresuscitation, they have not satisfied the "irreversibility" requirement in the circulatory and respiratory criteria for determining death, since their circulation and respiration could be artificially restored. Thus, removing their vital organs violates the "dead-donor" rule. I defend DCD donation against this criticism. I argue that practical medical-ethical considerations, including respect for do-not-resuscitate orders, support interpreting "irreversibility" to mean permanent cessat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Digitalization and digital health are transforming research practices, while economic growth is increasingly driven by the information commons. In the case of biological sciences, information commons, such as public biobanks and free/libre open source software (FLOSS), are of paramount importance for both research and the bioeconomy. In a time of digitalization, however, information commons are vulnerable to violations, such as the free-rider problem, that render the commons unsustainable. Consequently, it has been argued that the enclosure of the informational common resources is the only mea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fetal growth restriction defined as the failure to achieve the fetal genetic growth potential is a major cause of perinatal morbidity and mortality. The role of maternal adaptations to placental insufficiency in this disorder is still not fully understood. We aimed to investigate the biological processes and protein-protein interactions involved in late-onset fetal growth restriction in particular. We applied 2D nano LC-MS/MS proteomics analysis on maternal blood samples collected at the time of delivery from 5 singleton pregnancies with late-onset fetal growth restriction and 5 uncomplicated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Effects of stresses associated with extremely preterm birth may be biologically "recorded" in the genomes of individuals born preterm via changes in DNA methylation (DNAm) patterns. Genome-wide DNAm profiles were examined in buccal epithelial cells from 45 adults born at extremely low birth weight (ELBW; ≤1000 g) in the oldest known cohort of prospectively followed ELBW survivors (Mage = 32.35 years, 17 male), and 47 normal birth weight (NBW; ≥2500 g) control adults (Mage = 32.43 years, 20 male). Sex differences in DNAm profiles were found in both birth weight groups, but they were greatly enh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Strabismus refers to the misalignment of the eyes and occurs in 2-4% of individuals. The low-resolution label "strabismus" covers a range of heterogeneous defects, which makes it challenging to unravel this condition. Consequently a coherent understanding of the causes is lacking. Here, we attempt to gain a better understanding of the underlying genetics by combining gene curation, diverse bioinformatic analyses (including gene ontology, pathway mapping, expression and network-based methods) and literature review. Through a phenotype-based curation process, we identify high-confidence and perm
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the changes in the expression of specific genes that occur during the acute-to-chronic post-stroke phase, we identified differentially expressed genes (DEGs) between naive cortical tissues and peri-infarct tissues at 1, 4, and 8 weeks after photothrombotic stroke. The profiles of DEGs were subjected to the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway and gene ontology analyses, followed by string analysis of the protein-protein interactions (PPI) of the products of these genes. We found 3771, 536, and 533 DEGs at 1, 4, and 8 weeks after stroke, respectively. A marked d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To identify differentially expressed circular RNAs (circRNAs) in corneal neovascularization.
METHODS: We established an alkali burn-induced corneal neovascularization model and performed circRNA expression profiling to identify differentially expressed circRNAs between avascular corneas and vascularized corneas. Gene ontology enrichment and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analyses of the host genes of dysregulated circRNAs were performed to determine the related biological modules and pathological pathways. Real-time polymerase chain reactions were performed to detect the exp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interaction of Neisseria meningitidis (NM) with human brain microvascular endothelial cells (hBMECs) initiates of multiple cellular processes, which allow bacterial translocation across the blood-brain barrier (BBB). NM is equipped with several antigens, which interacts with the host cell receptors. Recently we have shown that adhesin MafA (UniProtKB-X5EG71), relatively less studied protein, is one of those surface exposed antigens that adhere to hBMECs. The present study was designed to comprehensively map the undergoing biological processes in hBMECs challenged with NM or MafA using RNA sequ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To analyze the component of adult worm excretory/secretory protein(AWESP) from Trichinella spiralis using the shotgun method, and find out the active component underlying its regulatory effect on colitis in humans.
METHODS: The T. spiralis AWESP was prepared, separated by SDS-PAGE, lysed with trypsin, and analyzed by shotgun LC-MS/MS. The protein components were determined with the Masco software and classified using the Gene Ontology(GO) method in cellular components, molecular functions, and biological processes.
RESULTS: The AWESPs isolated by SDS-PAGE had a Mr of 15 000-116 00
Поддержка исследования: вне правительства СШАСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Our aim was to explore the mechanism of post-transplant organ function decrease induced by brain death (BD) and discover a potential candidate drug for improving the survival and organ function after BD. MATERIAL AND METHODS The microarray data developed from the liver tissues after BD were further analyzed by bioinformatics methods. The differentially expressed genes (DEGs) were computationally predicted and the DEGs that involved biological functions were explored by gene ontology (GO) analysis. The candidate agents that could induce the reverse gene signature were predicted based
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus 71 (EV71) is one of the leading causes of hand, foot and mouth disease with neurological complications in some cases. To study the pathogenesis of EV71 infection, large-scale analyses of EV71 infected cells have been performed. However, most of these studies employed rhabdomyosarcoma (RD) cells or used transcriptomic strategy. Here, we performed SILAC-based quantitative proteomic analysis of EV71-infected U251 cells, a human glioma cell line. A total of 3125 host proteins were quantified, in which 451 were differentially regulated as a result of EV71 infection at 8 or 20 hpi or bot
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multimodal data combined in an integrated dataset can be used to aim the identification of instrumental biological actions that trigger the development of a disease. In this paper, we use an integrated dataset related to cutaneous melanoma that fuses two separate sets providing complementary information (gene expression profiling and imaging). Our first goal is to select a subset of genes that comprise candidate genetic biomarkers. The derived gene signature is then utilized in order to select imaging features, which characterize disease at a macroscopic level, presenting the highest, mutual i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования