The precise role of pre-mRNA processing factors (PRPs) in human tumorigenesis has not been yet explored. The object of the present study was to explore the effects of PRP3 in a common metastatic skin cancer, keratinocyte-derived cutaneous squamous cell carcinoma (cSCCs). RT-qPCR and western blotting were conducted to measure the expression levels of PRP3 in various cSCC cell lines and cSCC tissues. A benign epidermal keratinocyte cell line was transfected with a eukaryotic expression plasmid to overexpress PRP3. In addition, the endogenous expression level of PRP3 in cSCC cells was silenced us
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and single-nucleus RNA-sequencing (snRNA-seq) offer complementary advantages for corneal transcriptomics study. However, variations in cell-type distribution across platforms and the technical challenges in isolating corneal cells may lead to misinterpretation of biological conclusions. This study aimed to establish cell-type-specific recommendations for corneal transcriptomics.
METHODS: We systematically evaluated scRNA-seq and snRNA-seq performance using matched human and mouse corneal datasets. The expression of Col8a1 and Kdr was measured by
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Posterior capsular opacification is the most common complication after cataract surgery. Abnormal proliferation, migration, epithelial-mesenchymal transition, and extracellular matrix synthesis of residual lens epithelial cells are considered to be the main pathogenic mechanisms. Hepatocyte nuclear factor 4α has been reported to regulate epithelial-mesenchymal transition in different tumors. Our objective was to investigate the role and mechanism of hepatocyte nuclear factor 4α in posterior capsular opacification.
METHODS: Hepatocyte nuclear factor 4α expression was tested in posteri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) has the capacity to immortalize a subpopulation of resting B lymphocytes. Lymphoblastoid cell lines (LCL) established in this way carry the latent EBV genome as multiple copies of an extrachromosomal episome. Viral gene expression in LCLs is highly restricted; products identified correspond to a membrane protein (latent membrane protein; LMP), a nuclear antigen complex (Epstein-Barr nuclear antigens; EBNAs 1 to 6), two small RNA species (EBERs 1 and 2) and RNA species thought to encode a second membrane-associated polypeptide designated terminal protein (TP). Here we h
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small nucleolar RNA host genes (SNHGs) are a distinctive subgroup of long non-coding RNAs whose loci can generate both host lncRNA transcripts and intronic small nucleolar RNAs. In hepatocellular carcinoma (HCC), dysregulated SNHGs have been linked to tumor growth, epithelial-mesenchymal transition, metastasis, stemness, immune remodeling, extracellular vesicle communication, and therapeutic resistance. However, the clinical meaning of these associations remains uneven because many reported mechanisms are based on limited cell-line experiments, retrospective cohorts, or non-stratified HCC mode
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric carcinoma (GC) is a malignant tumor that is detrimental to human health. Transfer RNA-derived small RNAs are a newly identified class of noncoding small RNAs with specific biological functions that are aberrantly expressed in cancer. The aim of this study was to investigate the potential of hsa_tsr013526 as a biomarker for GC. Quantitative real-time fluorescence polymerase chain reaction was used to detect the expression level of hsa_tsr013526. The molecular characteristics of hsa_tsr013526 were verified by agarose gel electrophoresis, Sanger sequencing, and separation of nuclear and c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pulmonary nodules associated with Epstein-Barr virus (EBV)-related atypical infectious mononucleosis have rarely been described.
OBSERVATIONS: A 12-year-old Japanese boy, upon admission, revealed multiple small round nodules (a total of 7 nodules in 4 to 8 mm size) in the lungs on computed tomography. The hemorrhagic pharyngeal tonsils with hot signals on 18F-fluorodeoxyglucose-positron emission tomography-computed tomography were biopsied revealing the presence of EBV-encoded small nuclear RNA (EBER)-positive cells; however, no lymphoma was noted. The patient was diagnosed as hav
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant gene expression caused by aberrant nuclear reprogramming results in developmental abnormalities in cloned animals and ultimately their death. MicroRNAs (miRNAs), a family of ∼ 22 nucleotide, non-coding, single-stranded RNA molecules, are considered as key regulators of gene expression. Numerous miRNAs and their expression patterns have been identified in various species. However, the significance of miRNAs in developmental abnormalities in cloned animals is unclear. Small RNA libraries were generated from the placentas of cloned (somatic cell nuclear transfer, SCNT) and normally produ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer (GC) is one of the malignant tumors with the highest morbidity and mortality in the world. Early diagnosis combined with surgical treatment can significantly improve the prognosis of patients. Therefore, it is urgent to seek higher sensitivity and specificity biomarkers in GC. tRNA-derived small RNAs are a new non-coding small RNA that widely exists in tumor cells and body fluids. In this study, we explore the expression and biological significance of tRNA-derived small RNAs in GC.
MATERIALS AND METHODS: First of all, we screened the differentially expressed tRNA-de
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis treatments commonly mitigate bone loss but rarely restore lost bone mass. Yes-associated protein (Yap) nuclear translocation is crucial for the osteogenic differentiation of bone marrow stromal cells (BMSCs), but is disrupted by many factors under osteoporotic conditions. Long non-coding RNAs (lncRNAs) regulate BMSCs differentiation and Yap localization across diseases, exhibiting tissue- and cell-specific effects. However, their role in aberrant Yap signaling within BMSCs under osteoporosis remains unclear. Here, we identify small nucleolar RNA host gene 18 (lnc-Snhg18), a functi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteonecrosis of the jaw is the progressive loss and destruction of bone affecting the maxilla or mandible in patients treated with antiresorptive and antiangiogenic agents without receiving prior radiation therapy. The pathogenesis involves the inflammatory pathway of receptor activator of nuclear factor NF-kB ligand and the macrophage colony-stimulating factor, essential for osteoclast precursors survival and proliferation and acting through its receptor c-Fms. Evidence has shown the role of non-coding RNAs in the pathogenesis of osteonecrosis of the jaw and this finding might be useful in d
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The SMN protein is essential and participates in the assembly of macromolecular complexes of RNA and protein in all cells. The best-characterized function of SMN is as an assembler of spliceosomal small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs). SMN performs this function as part of a complex with several other proteins called Gemins. snRNPs are assembled in the cytoplasm in a stepwise manner and then are imported to the nucleus where they participate globally in the splicing of pre-mRNA. Mutations in the SMN1 gene result in the motor neuron disease, spinal muscular atrophy (SMA). Most of these muta
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small nuclear RNAs (snRNAs) are essential factors in messenger RNA splicing. By means of homozygosity mapping and deep sequencing, we show that a gene encoding U4atac snRNA, a component of the minor U12-dependent spliceosome, is mutated in individuals with microcephalic osteodysplastic primordial dwarfism type I (MOPD I), a severe developmental disorder characterized by extreme intrauterine growth retardation and multiple organ abnormalities. Functional assays showed that mutations (30G>A, 51G>A, 55G>A, and 111G>A) associated with MOPD I cause defective U12-dependent splicing. Endogenous U12-d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates concentrate RNA and protein machinery that facilitate RNA processing, ribonucleoprotein assembly, and gene regulation. Some evidence supports that condensates can modulate RNA folding, but measuring RNA structure within native condensates remains an unsolved challenge. Here we introduce RAID-MaP, a strategy that combines APEX proximity labeling with dimethyl sulfate (DMS) chemical probing to measure RNA structure within defined subcellular compartments. We applied RAID-MaP to resolve late stages of ribosomal RNA (rRNA) folding within the granular component (GC) of the
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human rhinovirus (HRV) triggers exacerbations of asthma and chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Cigarette smoking is the leading risk factor for the development of COPD and 25% of asthmatics smoke. Smoking asthmatics have worse symptoms and more frequent hospitalizations compared to non-smoking asthmatics. The degree of neutrophil recruitment to the airways correlates with disease severity in COPD and during viral exacerbations of asthma. We have previously shown that HRV and cigarette smoke, in the form of cigarette smoke extract (CSE), each induce expression of the neut
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sensitivity of laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC) to chemotherapy shows large heterogeneity. The role of miRNA in small extracellular vesicles (sEV) in chemotherapy resistance is under investigation. However, the regulation and sorting mechanism of sEV miRNAs remains unclear. In this study, small RNA sequencing was used to explore miRNA expression profiles in sEV of LSCC after cisplatin stimulation; RNA pull-down, mass spectrometry, and EMSA were used to clarify the binding of candidate RNA-binding protein (RBP) and candidate miRNA. Immunostaining and microRNA fluorescence in situ hy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA), the most frequent human congenital motor neuron degenerative disease, is caused by loss-of-function mutations in the highly conserved survival motor neuron gene SMN1. Mutations in SMN could affect several molecular processes, among which aberrant pre-mRNA splicing caused by defective snRNP biogenesis is hypothesized as a major cause of SMA. To date little is known about the interactions of SMN with other splicing factor genes and how SMN affects splicing in vivo. The nematode Caenorhabditis elegans carries a single ortholog of SMN, smn-1, and has been used as a m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-nucleus RNA-sequencing (snRNA-seq) has revealed new levels of cellular organization and diversity within the human brain. However, full-length mRNA isoforms are not resolved in typical snRNA-seq analyses using short-read sequencing that cannot capture full-length transcripts. Here we combine standard 10x Genomics short-read snRNA-seq with targeted PacBio long-read snRNA-seq to examine isoforms of genes associated with neurological diseases at the single-cell level from prefrontal cortex samples of diseased and nondiseased human brain, assessing over 165,000 cells. Samples from 25 postmo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spliceosome cycle consists of assembly, catalysis, and recycling phases. Recycling of postspliceosomal U4 and U6 small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs) requires p110/SART3, a general splicing factor. In this article, we report that the zebrafish earl grey (egy) mutation maps in the p110 gene and results in a phenotype characterized by thymus hypoplasia, other organ-specific defects, and death by 7 to 8 days postfertilization. U4/U6 snRNPs were disrupted in egy mutant embryos, demonstrating the importance of p110 for U4/U6 snRNP recycling in vivo. Surprisingly, expression profiling of th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The repeat expansion in the human genome contributes to neurodegenerative disorders such as spinocerebellar ataxia (SCA) and amyotrophic lateral sclerosis. Transcripts with repeat expansions undergo noncanonical translation called repeat-associated non-AUG (RAN) translation. The NOP56 gene, implicated in SCA36, contains a GGCCTG repeat in its first intron. In tissues of patients with SCA36, poly (Gly-Pro) and poly (Pro-Arg) peptides, likely produced through NOP56 RAN translation in (NOP56-RAN), have been detected. However, the detailed mechanism underlying NOP56-RAN remains unclear. To address
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования