Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
16235 публикаций
Поиск: 241 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 1689 с найденным полным текстом
IEEE transactions on computational biology and bioinformatics2025eng
Multiple objectives have emerged in tuning protein-protein interaction (PPI) networks, such as identifying cross-species network similarities and predicting protein complexes and functions. Despite the proliferation of tuning methodologies, challenges remain in balancing accuracy and efficiency. In this paper, we introduce GA2Vec, a novel approach for globally aligning multiple PPI networks using genetic algorithms in a many-to-many fashion. GA2Vec leverages vector embeddings of protein sequences from ProtBERT, ESM-2, and ProtT5-XL-UniRef50 to reconstruct weighted PPI networks, incorporating f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To compare between two archwire (AW) sequences in terms of alignment speed and root resorption (RR).
MATERIALS AND METHODS: Fifty-four patients (14 males, 40 females) requiring orthodontic treatment were randomly allocated into two groups; in group A (mean age 18.3) treatment started with 0.014″ nickel titanium (NiTi) followed by 0.019″×0.025″ NiTi AW while group B (mean age 18.9) the AW sequence was 0.014″ NiTi, 0.018″ NiTi, 0.016″×0.022″ NiTi, 0.019″×0.025″ NiTi. The primary outcome was to compare the alignment speed of the crowded upper and lower teeth between the two different
Рандомизированное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genomic sequence similarity comparison is a crucial research area in bioinformatics. Multiple Sequence Alignment (MSA) is the basic technique used to identify regions of similarity between sequences, although MSA tools are widely used and highly accurate, they are often limited by computational complexity, and inaccuracies when handling highly divergent sequences, which leads to the development of alignment-free (AF) algorithms.
RESULTS: This paper presents TreeWave, a novel AF approach based on frequency chaos game representation and discrete wavelet transform of sequences for ph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To compare the clinical effectiveness of conventional nickel-titanium (NiTi) and heat-activated nickel-titanium (HANT) archwire sequences in terms of anterior alignment, root length, alveolar bone changes and pain.
METHODS: This was a two-arm parallel randomised controlled trial. Patients (Little's Irregularity Index (LII) 7-9 mm) requiring fixed orthodontic treatment with first premolar extractions were enrolled. Participants were randomly allocated (1:1) using a computer-generated random sequence to either the HANT or conventional NiTi group. Digital scans were obtained at baseli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a previous study a genomic library of L. interrogans serovar lai was constructed by the present authors. Hybridization analysis (In situ, dot blot, Southern blot) with the DNA fragment containing OmpL1 (alpha-32P labeled) was performed. One of positive clones designated pDC38, was analyzed with 9 restriction enzymes (EcoRI, Bam HI, Hind III, Bgl, XbalI, ScaI, KpnI, PstI, Dra II). DNA hybridization was applied to analyze the homology of the recombinant fragment of ompL1 with the DNA of 18 strains of L. interrogans. The results showed that the homology of fragments of ompL1 were present in pa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcohol Use Disorder (AUD) is a polygenic disease defined by the inability to regulate alcohol consumption despite adverse consequences. C57BL/6J (B6) and DBA/2J (D2) mice, the progenitor strains to the BXD recombinant inbred strain, exhibit differences in voluntary ethanol consumption and other ethanol behaviors, making them frequently used models for studying genetic influences on ethanol responses. The B6 genome is the standard reference genome for the majority of mouse RNA-sequencing (RNAseq) studies, including studies on D2 mice. We hypothesized that aligning B6 and D2 RNAseq data to thei
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Optimum alignment in all pairwise combinations among a group of amino acid sequences generated a distance matrix. These distances were clustered to evaluate relationships among the sequences. The degree of relationship among sequences was also evaluated by calculating specific distances from the distance matrix and examining correlations between patterns of specific distances for pairs of sequences. The sequences examined were a group of 20 amino acid sequences of scorpion toxins originally published and analyzed by M.J. Dufton and H. Rochat in 1984. Alignment gap penalties were constant for a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rumba turning sequence is technically demanding, but the repeatability of continuous kinematic waveforms during repeated performance remains unclear. This study examined trial-to-trial repeatability and curve-level reliability of rotational-progress-aligned kinematic waveforms during the primary 360° rotation in a standardized rumba turning sequence, corresponding to the initial spiral turn. Fifteen high-level adolescent female Latin dancers completed 5 valid trials at 76 beats per minute. Kinematic data were collected using a 10-camera Vicon 3-dimensional motion capture system (100 Hz). S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: It has been suggested that heat-activated NiTi archwires (HANT) speed up crowding alleviation. HANT wires are available with different austenite finish temperatures.
OBJECTIVE: The aim of the present study was to compare the effectiveness of two alignment sequences using thermally activated archwires with different austenite activation temperatures for the correction of mandibular anterior crowding.
MATERIAL AND METHODS: The following NiTi archwire sequence was used for both groups: 0.012 in (conventional NiTi), 0.018 in (heat-activated NiTi archwires), 0.016×0.022 in (heat-act
СтатьяРандомизированное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular epidemiology and HIV-1 transmission networks reconstruction can provide insights into transmission dynamics and inform public health strategies. Long HIV sequences, such as near full-length (nFL) genomes, can improve the accuracy of phylogenetic inference. However, relatively short pol sequences are still broadly used for inferring molecular HIV clusters. Whether a mix of long and short HIV-1 sequences can improve phylogenetic inference of molecular HIV clusters remains unknown. We propose a flexible approach called T-shaped alignments that incorporates both nFL HIV-1 genomes and par
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Previous transcriptomic studies demonstrated an acute genomic storm in circulating immune cells after trauma that gradually returns to baseline. The magnitude and duration of these changes is associated with post-injury complications. We hypothesised that other immune cell features emerging in the subacute timeframe should be associated with recovery.
METHODS: We applied DOGMA-seq on peripheral blood mononuclear cells isolated at day 3 after injury from the patients undergoing slow or fast recovery from critical illness (n = 8/group), along with age-and-sex matched healthy control
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the rapid development of biotechnology, gene sequencing methods are gradually improved. The structure of gene sequences is also more complex. However, the traditional sequence alignment method is difficult to deal with the complex gene sequence alignment work. In order to improve the efficiency of gene sequence analysis, D2 series method of k-mer statistics is selected to build the model of gene sequence alignment analysis. According to the structure of the foreground sequence, the sequence to be aligned can be cut by different lengths and divided into multiple subsequences. Finally, acco
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular systematists generally rely on computer algorithms to establish the alignment of DNA sequences. However, when alignment regions are characterized by multiple insertions and deletions, these gap-filled stretches of DNA are often excised before phylogenetic reconstruction. This exclusion of systematic data is generally determined by subjective criteria. We explore a replicable methodology in which the comparison of several multiple sequence alignments can be used to eliminate regions of unstable sequence alignment. Using crocodilian and insect mitochondrial (mt) ribosomal (r) DNA as ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequence changes in viral genomes generate protein sequence diversity that enables viruses to evade the host immune system, hindering the development of effective preventive and therapeutic interventions. The massive proliferation of sequence data provides unprecedented opportunities to study viral adaptation and evolution. An alignment-free approach removes various restrictions posed by an alignment-dependent approach for studying sequence diversity. The publicly available tool, UNIQmin, offers an alignment-free approach for studying viral sequence diversity at any given rank of taxonomy line
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein sequence and structure similarity-based search is an important task, which underpins protein annotation, evolutionary analysis, large-scale functional inference, and the exploration of the protein "dark space". The rapid growth of sequence and predicted structure databases has spurred diverse search methods, yet their evaluation remains limited to fold-level similarity and inconsistent benchmarking protocols.
RESULTS: We present a comprehensive benchmark for protein sequence and structure search. Using this framework, we evaluate 14 representative methods spanning sequence
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Partial order alignment (POA) has emerged as a fundamental component in long-read error correction, assembly and pangenomics. However, conventional POA algorithms are limited by high time and memory requirements, making them inefficient for large-scale data sets. Here, we present minipoa, a fast and memory-efficient POA tool that incorporates seed-chain-align heuristics, adaptive or static banding strategies, and single-instruction multiple-data optimizations. Minipoa achieves up to a fivefold speedup over abPOA, reduces memory usage by up to 16-fold, and improves correction accuracy, while ma
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Segmental duplications play an important role in genome evolution via their contribution to copy-number variation, gene-family diversification, and the emergence of novel functions. The detection of segmental duplications is challenging due to heterogeneous amelioration of sequence similarity among duplicates, which hinders the reconstruction of continuous sequence alignment. Here we introduce SegMantX, a novel approach for the identification of diverged segmental duplications in prokaryote genomes using local alignment chaining. In this approach, local alignments resulting from a preliminary
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid growth of biological sequence data has increased the need for easy, accessible, and scalable tools for sequence comparison and analysis. The EMBL-EBI Job Dispatcher framework helps meet this need by providing a single web-based platform that offers many commonly used tools, including the BLAST, Clustal Omega, and EMBOSS programs. In this article, we provide a practical, easy-to-follow guide to the main tool categories available in Job Dispatcher, focusing on multiple sequence alignment and sequence similarity search. We present step-by-step workflows that demonstrate how to run these
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue virus (DENV) serotyping is essential for epidemiological surveillance, clinical risk assessment, and vaccine evaluation, as the four dengue serotypes differ in pathogenicity, immune interactions, and population dynamics. Existing subtyping methods largely rely on sequence alignment and phylogenetic inference, which can be computationally intensive and unreliable for short, fragmented, or error-prone sequences commonly generated in diagnostic and surveillance settings. There is a need for fast, alignment-free serotyping approaches that maintain high accuracy across heterogeneous sequence
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SUMMARY: We describe the application of distance geometry methods to the three-dimensional visualization of sequence relationships, with examples for mumps virus SH gene cDNA and prion protein sequences. Sequence-sequence distance measures may be obtained from either a multiple sequence alignment or from sets of pairwise alignments.
AVAILABILITY: C/Perl code and HTML/VRML files from http://www.nibsc.ac.uk/dg3dseq/
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.