Incompatible plant-pathogen interactions result in the rapid cell death response known as hypersensitive response (HR) and activation of host defense related genes. To understand the cellular mechanism controlling defense response better, a novel pathogenesis-related (PR) gene and putative cell wall protein gene, CaTin2, was isolated through differential screening of a hot pepper cDNA library and characterized. CaTin2 gene was locally and systemically induced in hot pepper plants upon TMV-P0 inoculation which induces HR. However, CaTin2 gene wasn't regulated by bacterial HR-specific signal pat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus cereus G9241 was isolated from a welder suffering from an anthrax-like inhalation illness. B. cereus G9241 encodes two megaplasmids, pBCXO1 and pBC210, which are analogous to the toxin- and capsule-encoding virulence plasmids of Bacillus anthracis. Protein modeling predicted that the pBC210 LF homologue contained an ADP-ribosyltransferase (ADPr) domain. This putative bacterial ADP-ribosyltransferase domain was denoted CerADPr. Iterative modeling showed that CerADPr possessed several conserved ADP-ribosyltransferase features, including an α-3 helix, an ADP-ribosyltransferase turn-turn
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lymphocyte homing to secondary lymphoid tissue and lesions of chronic inflammation is directed by multi-step interactions between the circulating cells and the specialized endothelium of high endothelial venules (HEVs). In this study, we used the PCR-based method of suppression subtractive hybridization (SSH) to identify novel HEV genes by comparing freshly purified HEV endothelial cells (HEVECs) with nasal polyp-derived microvascular endothelial cells (PMECs). By this approach, we cloned the first nuclear factor preferentially expressed in HEVECs, designated nuclear factor from HEVs (NF-HEV).
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenesis of cholera diarrhea requires cholera toxin (CT)-mediated adenosine diphosphate (ADP)-ribosylation of stimulatory G protein (Gsα) in enterocytes. CT is an AB5 toxin with an inactive CTA1 domain linked via CTA2 to a pentameric receptor-binding B subunit. Allosterically activated CTA1 fragment in complex with NAD+ and GTP-bound ADP-ribosylation factor 6 (ARF6-GTP) differs conformationally from the CTA1 domain in holotoxin. A surface-exposed knob and a short α-helix (formed, respectively, by rearranging "active-site" and "activation" loops in inactive CTA1) and an ADP ribosylating tur
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Besides classical scorpion toxin-potassium channel binding modes, novel modes remain unknown. Here, we report a novel binding mode of native toxin BmKTX towards Kv1.3 channel. The combined experimental and computational data indicated that BmKTX-D33H analog used the classical anti-parallel β-sheet domain as the channel-interacting interface together with the conserved channel pore-blocking Lys(26). However, the wild-type BmKTX was found to use Arg(23) rather than Lys(26) as the new pore-blocking residue, and mainly adopt the turn motif between the α-helix and antiparallel β-sheet domains to re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Twelve herpesviral deoxythymidine kinases were examined for regions of sequence similarity by multiple alignment. Six highly conserved sites were observed. Site 1 corresponded to a glycine-rich loop that forms part of the ATP-binding pocket in porcine adenylate kinase (PAK), and site 5 corresponded to a region in PAK, located on one lobe of the cleft, that contains arginine residues that bind substrate phosphoryl groups. Site 3, consisting of the motif -DRH-, is thought to be involved in thymine/deoxythymidine recognition; site 4, which is nearby, probably participates in this function as well
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STING is an endoplasmic reticulum (ER)-associated transmembrane protein that turns on and quickly turns off downstream signaling as it translocates from the ER to vesicles. How STING signaling is attenuated during trafficking remains poorly understood. Here, we show that trafficking-mediated STING degradation requires ER exit and function of vacuolar ATPase complex. Late-stage STING vesicles are sorted to Rab7-positive endolysosomes for degradation. Based on analysis of existing structures, we also identified the helix amino acid 281 (aa281)-297 as a motif required for trafficking-mediated STI
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: It is well established that the RpoN-RpoS sigma factor (σ(54)-σ(S)) cascade plays an essential role in differential gene expression during the enzootic cycle of Borrelia burgdorferi, the causative agent of Lyme disease. The RpoN-RpoS pathway is activated by the response regulator/σ(54)-dependent activator (also called bacterial enhancer-binding protein [bEBP]) Rrp2. One unique feature of Rrp2 is that this activator is essential for cell replication, whereas RpoN-RpoS is dispensable for bacterial growth. How Rrp2 controls cell replication, a function that is independent of RpoN-RpoS
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tryptophan-rich peptides, being short and suitable for large-scale chemical synthesis, are attractive candidates for developing a new generation of antimicrobials to combat antibiotic-resistant bacteria (superbugs). Although there are numerous pictures of the membrane-bound structure of a single tryptophan (W), how multiple Trp amino acids assemble themselves and interact with bacterial membranes is poorly understood. This communication presents the three-dimensional structure of an eight-residue Trp-rich peptide (WWWLRKIW-NH2 with 50% W) determined by the improved two-dimensional nuclear magn
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A large kindred with adult-type X-linked Alport syndrome was studied with regard to a defect in the recently described COL4A5 collagen gene. Southern blot analysis with COL4A5 cDNA probes showed loss of a MspI restriction site. Direct sequencing of cDNA amplified from lymphoblast mRNA demonstrated a single-base substitution converting a glycine codon to arginine at position 325 in the alpha 5 chain of type IV collagen. The triple-helical collagenous domain of alpha 5(IV), characterized by a Gly-X-Y repeat sequence, is interrupted 22 times by noncollagenous sequences. The mutation creates an ad
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immediate early proteins of human herpesvirus 6A (HHV-6A) are expressed at the outset of lytic infection and thereby regulate viral gene expression. Immediate early protein 2 (IE2) of HHV-6A is a transactivator that drives a variety of promoters. The C-terminal region of HHV-6A IE2 is shared among IE2 homologs in betaherpesviruses and is involved in dimerization, DNA binding, and transcription factor binding. In this study, the structure of the IE2 C-terminal domain (IE2-CTD) was determined by X-ray crystallography at a resolution of 2.5 Å. IE2-CTD forms a homodimer stabilized by a β-barrel co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Van der Woude syndrome (VWS) and popliteal pterygium syndrome (PPS) are autosomal dominant clefting disorders recently discovered to be caused by mutations in the IRF6 (Interferon Regulatory Factor 6) gene. The IRF gene family consists of nine members encoding transcription factors that share a highly conserved helix-turn-helix DNA-binding domain and a less conserved protein-binding domain. Most IRFs regulate the expression of interferon-alpha and -beta after viral infection, but the function of IRF6 remains unknown. We have isolated a full-length zebrafish irf6 cDNA, which encodes a 492 amino
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The three-dimensional solution structure of mu-conotoxin GIIIB, a 22-residue polypeptide from the venom of the piscivorous cone snail Conus geographus, has been determined using 2D 1H NMR spectroscopy. GIIIB binds with high affinity and selectivity to skeletal muscle sodium channels and is a valuable tool for characterizing both the structure and function of these channels. Structural restraints consisting of 289 interproton distances inferred from NOEs and 9 backbone and 5 side chain dihedral angle restraints from spin-spin coupling constants were used as input for simulated annealing calcula
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Fos oncogene gene family is evolutionarily conserved throughout Eukarya. Fos proteins characteristically have a leucine zipper and a basic region with a helix-turn-helix motif that binds DNA. In vertebrates, there are several Fos homologs. They can homo- or hetero-dimerize via the leucine zipper domain. Fos homologs coupled with other transcription factors, like Jun oncoproteins, constitute the Activator Protein 1 (AP-1) complex. From its original inception as an oncogene, the subsequent finding that they act as transcription factors binding DNA sequences known as TRE, to the realization t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Animal venoms are rich sources of ligands for studying ion channels and other pharmacological targets. Proteomic analyses of the soluble venom from the Mexican scorpion Vaejovis mexicanus smithi showed that it contains more than 200 different components. Among them, a 36-residue peptide with a molecular mass of 3864 Da (named Vm24) was shown to be a potent blocker of Kv1.3 of human lymphocytes (K(d) ∼ 3 pM). The three-dimensional solution structure of Vm24 was determined by nuclear magnetic resonance, showing the peptide folds into a distorted cystine-stabilized α/β motif consisting of a singl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Morganella morganii produces an inducible, chromosomally encoded AmpC beta-lactamase. We describe in this study three new variants of AmpC within this species with apparent pIs of 6.6 (M19 from M. morganii strain PP19), 7.4 (M29 from M. morganii strain PP29), and 7.8 (M37 from M. morganii strain PP37). After gene sequencing, deduced amino acid sequences displayed one to six substitutions when compared to the available Morganella AmpC sequences. An AmpR-encoding gene was also found upstream of ampC, including the LysR regulators' helix-turn-helix DNA-binding domain and the putative T-N11-A-prot
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A point mutation from guanine (G) to adenine (A) at nucleotide position 1081 in the hemagglutinin-neuraminidase (HN) gene has been associated with neurovirulence of Urabe AM9 mumps virus vaccine. This mutation corresponds to a glutamic acid (E) to lysine (K) change at position 335 in the HN glycoprotein. We have experimentally demonstrated that two variants of Urabe AM9 strain (HN-A1081 and HN-G1081) differ in neurotropism, sialic acidbinding affinity and neuraminidase activity. In the present study, we performed a structure-function analysis of that amino acid substitution; the structures of
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
FabG performs the NADPH-dependent reduction of β-keto acyl-acyl carrier protein substrates in the elongation cycle of fatty acid synthesis. We report the characterization of a temperature-sensitive mutation (fabGΔ8) in Escherichia colifabG that results from an in-frame 8-amino-acid residue deletion in the α6/α7 subdomain. This region forms part of one of the two dimerization interfaces of this tetrameric enzyme and is reported to undergo significant conformational changes upon cofactor binding, which define the entrance to the active-site cleft. The activity of the mutant enzyme is extremely t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, a cDNA sequence of Huiyang chicken interferon-gamma (IFN-gamma) receptor alpha-chain (chIFNGR-1) gene wasgenerated using rapid amplification of cDNA ends (RACE) method for the first time. The predicted 422 amino acids showed approximately 25%-29% sequence identity and 53%-55% similarity to mammalian homologues. There are two fibronectin type-III (FN-III) domains of about 110 residues in the extracellular domain, and LPKS and YDKPH motifs in the intracellular domain, which are conserved in the mammalian IFNGR-1 as the binding sites of JAK1 and STAT1. Expression analysis by Northe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The authors investigated 32 patients with the muscle form of CPT II deficiency. Total carnitine palmitoyltransferase enzyme system (CPT) activity was normal but abnormally inhibited by malonyl-CoA, palmitoyl-CoA, and the detergents Triton X and Tween 20. Mutation analysis identified three described mutations (S113L, P50H, and F448L) and two novel mutations (M214T and Y479F). Using modeling techniques, a structure could be identified anchoring the protein in the membrane. Only one of the five mutations (Y479F) is located within this region.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.