Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
19071 публикаций
Поиск: 279 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 5637 с найденным полным текстом
Psoriasis (PS) is linked to altered polyamine metabolism, which may drive chronic inflammation and abnormal keratinocyte proliferation. We integrated transcriptomics and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to identify polyamine metabolism-related genes (PMRGs) as biomarkers for PS and elucidate their mechanisms. Through the application of differential expression analysis, three machine learning algorithms, combined with receiver operating characteristic (ROC) analysis and expression quantification, biomarkers related to polyamine metabolism in PS were identified. Furthermore, the expression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic foot ulcers (DFUs) are devastating diabetic complications characterized by an extremely high non-healing rate and elevated risk of life-threatening outcomes. To characterize the cellular landscape and macrophage-associated alterations between DFU tissue and diabetic non-ulcer foot (DNFU) skin, we performed a comprehensive reanalysis of publicly available single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) datasets.
METHODS: A fully reproducible R-based analytical pipeline was used to process public scRNA-seq count matrices (GSE165816) from 5 DFU and 8 DNFU skin samples. A total of 27,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a common neurodegenerative disorder in which ferroptosis and immune dysregulation have been implicated. However, the crosstalk between ferroptosis-related transcriptional signatures and peripheral immune alterations in PD remain unclear. Herein, we integrated bulk transcriptomic datasets and a peripheral blood single-cell dataset to identify ferroptosis-related genes associated with PD and to evaluate their diagnostic potential. Initially, we identified 16 abnormally expressed ferroptosis-related genes (AEFRGs) associated with peripheral immune cell infiltration in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patient-derived organoids (PDOs) are widely used preclinical models for colorectal cancer (CRC). However, conventional PDO cultures frequently lose tumor microenvironment (TME) components and undergo culture-induced transcriptional drift. A chemically defined induction system (CiPDO) has been proposed to preserve fetal-like plasticity states, yet a direct single-cell comparison of CiPDO versus conventional PDO against the matched primary tumor is lacking.
OBJECTIVE: To evaluate and compare the single-cell transcriptional fidelity of chemically induced PDO (CiPDO) and conventional
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this chapter is to provide a comprehensive, step-by-step methodology for the analysis of circulating tumor cell (CTC) interactions within the blood microenvironment, from the acquisition of CTCs to single-cell transcriptomic sequencing and subsequent data analysis. Our methodological approach involved the following steps: (1) Data Preprocessing: The raw sequencing data were subjected to stringent quality control and preprocessing to remove artifacts and outliers that could potentially skew the analysis. (2) Seurat analysis: Utilizing the Seurat package, we performed dimensionali
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing evidence indicates that cellular senescence, metabolic dysfunction, stromal remodeling, and immune perturbation collectively contribute to disease progression. However, senescence-related biomarkers with diagnostic potential and microenvironmental relevance in sarcopenia remain insufficiently defined. We integrated bulk transcriptome data from sarcopenia and control samples, with senescence-associated gene sets from the GenAge and CellAge databases to identify senescence-related differentially expressed genes (DEGs). Transcriptomic landscape was characterized via principal component
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure of cells or tissues to chemical compounds can be analyzed through transcriptomic signatures, which can be used to classify chemical agents. This information can also enrich Adverse Outcome Pathways (AOP). Transcriptional signatures have generally been obtained using "bulk" analysis, by which the global gene expression pattern of an entire tissue is determined. Although this approach has been useful in toxicology, some information is lost, especially when tissues containing multiple cell types are considered. With the advent of single-cell transcriptomics (scRNA-seq), it is now possibl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, the fast development of single-cell RNA-seq (scRNA-seq) techniques has enabled high-resolution transcriptomic statistical analysis of individual cells in heterogeneous tissues, which can help researchers to explore the relationship between genes and human diseases. The emerging scRNA-seq data results in new analysis methods aiming to identify cell-level clustering and annotations. However, there are few methods developed to gain insights into the gene-level clusters with biological significance. This study proposes a new deep learning-based framework, scENT (single cell gENe clusTer)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing measures gene expression in individual cells, but RNA released from damaged cells can be captured alongside RNA from intact cells, producing spurious signals that affect cell identification and biological interpretation. Although many computational tools aim to remove ambient RNA, their relative performance has not been systematically evaluated.Using simulated and experimental datasets from diverse tissues and species, we assessed seven tools for accuracy in estimating contamination levels, robustness across biological and technical conditions, and sensitivity to sub
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dilated cardiomyopathy (DCM) is a prevalent myocardial disease with a grim poor prognosis, and its pathogenesis remains poorly understood. Necroptosis, a programmed cell death mechanism, is believed to be significantly involved in the pathogenesis of DCM. This study aimed to identify necroptosis-related hub genes associated with DCM and predict potential agents for DCM. All analyses exclusively utilized publicly available datasets from the Gene Expression Omnibus database. Differentially expressed genes were identified in the DCM dataset GSE128095. The least absolute shrinkage and selection op
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Resolving cellular heterogeneity requires methods that capture both discrete cell types and their functional relationships. Existing single-cell clustering approaches often produce flat partitions, limiting their ability to reveal rare cell states and continuous biological transitions. Here, we introduce scMustree, a computational framework that constructs a multi-scale hierarchy of single-cell transcriptomes, enabling integrated analysis of cellular organization and functional relationships. scMustree employs a top-down iterative decomposition to isolate transcriptionally homogene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has emerged as a powerful tool for dissecting cellular heterogeneity in plants at a high resolution. In particular, scRNA-seq has been applied to unravel the complex cell identities and regulatory networks of distinct phloem cell types. Because phloem cells are small and under high osmotic pressure, isolating and maintaining viable protoplasts is a challenge for successful phloem scRNA-seq. Here, we present an optimized protocol for isolating vasculature-enriched protoplasts from mature Arabidopsis thaliana leaves. Following tissue harvesting, protoplasti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundSystemic lupus erythematosus (SLE) is a complex autoimmune disease characterized by heterogeneous clinical manifestations and multi-organ involvement. Current understanding of SLE pathogenesis remains limited, particularly due to the cellular and molecular diversity of immune cells across tissues. Therefore, a comprehensive review synthesizing recent advances in applying single-cell technologies to SLE research is urgently needed to bridge this knowledge gap.TechnologySingle-cell RNA sequencing (scRNA-seq) provides high-resolution transcriptomic profiling at the single-cell level. Th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoarthritis (OA) represents the most common degenerative joint disease, with emerging evidence linking it to lysosomal dysfunction and ferroptotic cell death. This study aimed to identify candidate biomarkers associated with lysosomal function and ferroptosis in OA, thereby providing a theoretical basis for subsequent experimental research.
METHODS: We obtained OA datasets and ferroptosis-related genes (FRGs) from publicly accessible repositories, while lysosome-related genes (LRGs) were compiled from published literature. Potential candidate genes emerged through the intersect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rare-cell identification is essential for dissecting disease mechanisms and developmental programs. Existing methods mostly rely on fixed-size neighbourhood graphs to separate rare-cell populations in single-cell expression data, which may embed rare cells into dominant clusters under varying sampling densities. This paper proposes the RAG method for identifying rare cells based on regularized adaptive graphs, which can better separate rare cells. Specifically, the regularized adaptive graph is constructed by estimating cell-specific radii from Euclidean-cosine hybrid dissimilarity to constrai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pig is an important model for biomedical studies, yet the immune cell heterogeneity, the subtle relationship between immune cells and the inter-breed immune variation in pigs remains poorly characterized. Here, we generate single-cell transcriptomes for the Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMCs) of two pig breeds with distinct immune traits including Duroc and Meishan pigs – with the latter have better immune capacity. RESULTS: Dozens of cell types are annotated, with γδ T lymphocytes making up one-fifth of all PBMCs. A list of putative novel markers is identified in each cell
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The heterogeneity of cells constitutes the foundation of development, adaptation and evolution, therefore understanding the expression and spatial distribution patterns of genes in different plant tissues has extremely high research value. Traditional transcriptome sequencing can only perform mixed-sequencing analysis on multicellular tissues and fails to detect intercellular heterogeneity. However, the groundbreaking development and integration of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and spatial transcriptomics (ST) are leading forest tree biology into a new era. This review systematically
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tomato contains various classes of metabolites conferring benefits to human health and plant defense. Metabolic reprogramming of tomato induced by plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR), such as Streptomyces spp., provides a feasible solution to enhance fruit quality and plant performance. However, the spatiotemporal and intensity characteristics of plant metabolism rewired following PGPR inoculation remain largely uncovered. Here, we characterized the landscape of PGPR-mediated metabolic reprogramming in whole plants of tomato. Large-scale single-cell transcriptomic and metabolomic analy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study presented a comprehensive characterization of the osteomyelitis immune microenvironment, identified driver genes and pathogenic cell populations underlying disease progression, and uncovered potential therapeutic targets through single-cell and bulk transcriptomic analysis.
METHODS: We analyzed time-series transcriptomic sequencing data from mouse osteomyelitis samples in the dataset GSE168896. Fuzzy c-means clustering was applied to reveal gene sets linked to disease progression. Immune cell infiltration analysis was conducted through the online tool ImmuCellAI-mouse. F
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The placenta is a complex organ with multiple immune and non-immune cell types that promote fetal tolerance and facilitate the transfer of nutrients and oxygen. The nonhuman primate (NHP) is a key experimental model for studying human pregnancy complications, in part due to similarities in placental structure, which makes it essential to understand how single-cell populations compare across the human and NHP maternal-fetal interface. We constructed a single-cell RNA-Seq (scRNA-Seq) atlas of the placenta from the pigtail macaque (Macaca nemestrina) in the third trimester, comprising
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.