Somatic hypermutation (SHM) status of IGHV gene, despite being a mature diagnostic biomarker in chronic lymphocytic leukemia (CLL), poses serious methodological problems for molecular laboratories. They may choose between inefficient Sanger sequencing protocols and expensive, recently developed next-generation sequencing-based methods. The performance of both types of methods seemed incomparable, and concerted validation of different protocols between laboratories was inconsiderable. Here, a new tagmentation-based approach to sequencing of IGHV locus is presented, which is agnostic to the ampl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasma cells (PCs) represent the final stage of B-cell differentiation and are devoted to the production of immunoglobulin (Ig). Perturbations to their development can result in human disorders characterized by PC expansion and hypergammaglobulinemia. Ig-secreting cells (ISCs) have been identified in secondary lymphoid tissues and bone marrow (BM). Most ISCs in lymphoid tissue are short-lived; in contrast, ISCs that migrate to the BM become long-lived PCs and continue to secrete immunoglobulin for extended periods. However, a small population of long-lived PCs has been identified in rodent spl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic hypermutation (SHM) in variable regions of immunoglobulin genes by activation-induced deaminase (AID) is essential for the maturation of protective antibodies against pathogen and vaccine antigens. AID preferentially mutates cytosines within WRCH motifs (wherein W = A/T, R = A/G, and H = A/C/T) in single-stranded DNA, yet these motifs show large but reproducible variation in mutation frequency, suggesting a crucial role for sequences flanking the WRCH motifs (i.e., a sequence grammar) in determining mutational outcomes. However, the nature of this sequence grammar is poorly understood.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Humanized mice are limited in terms of modeling human immunity, particularly with regards to antibody responses. Here we constructed a humanized (THX) mouse by grafting non-γ-irradiated, genetically myeloablated KitW-41J mutant immunodeficient pups with human cord blood CD34+ cells, followed by 17β-estradiol conditioning to promote immune cell differentiation. THX mice reconstitute a human lymphoid and myeloid immune system, including marginal zone B cells, germinal center B cells, follicular helper T cells and neutrophils, and develop well-formed lymph nodes and intestinal lymphoid tissue, in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The efficacy of antibody responses is inherently linked to paratope diversity, as generated through V(D)J recombination and somatic hypermutation. Despite this, it is unclear how genetic diversification mechanisms evolved alongside codon optimality and affect antibody expression. Here, we analyze germline immunoglobulin (IG) genes, natural V(D)J repertoires, serum IgG, and monoclonal antibody (mAb) expression through the lens of codon optimality. Germline variable genes (IGVs) exhibit diverse optimality that is inversely related to mutability. Hypermutation deoptimizes heavy-chain (IGH) VDJ re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The activation-induced cytidine deaminase (AID) gene, specifically expressed in germinal center B cells in mice, is a member of the cytidine deaminase family. We herein report mutations in the human counterpart of AID in patients with the autosomal recessive form of hyper-IgM syndrome (HIGM2). Three major abnormalities characterize AID deficiency: (1) the absence of immunoglobulin class switch recombination, (2) the lack of immunoglobulin somatic hypermutations, and (3) lymph node hyperplasia caused by the presence of giant germinal centers. The phenotype observed in HIGM2 patients (and in AID
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the dynamics of evolution of Follicular Lymphoma (FL) clones during disease progression is important for monitoring and targeting this tumor effectively. Genetic profiling of serial FL biopsies and examples of FL transmission following bone marrow transplant suggest that this disease may evolve by divergent evolution from a common ancestor cell. However where this ancestor cell resides and how it evolves is still unclear. The analysis of the pattern of somatic hypermutation of the immunoglobulin gene (Ig) is traditionally used for tracking the physiological clonal evolution of B
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Selective microbial colonisation of germ-free piglets is reported to result in expansion of immunoglobulin V(H)- and D(H)-segment usage from an initially limited repertoire. Here, the response of the palatine tonsil to microbial colonisation was compared in age-matched conventionally reared and germ-free piglets. At 3 and 5 days after birth an expansion in the B-cell follicle area was observed in the conventional, microbially colonised animals, which was not seen in the germ-free piglets. Consistent with this observation, sequencing of re-arranged heavy chain V-D-J units demonstrated accumulat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: The recent elucidation of the molecular defects leading to hyper-IgM syndromes has provided considerable insight into the complex mechanisms that govern the antibody maturation in humans.
RECENT FINDINGS: The study of a large cohort of patients revealed unexpected clinical, immunological and genetic findings, which have significant implications on the molecular basis of immunoglobulin class switch recombination and somatic hypermutation, as shown for hypomorphic mutations in the nuclear factor-kappaB essential modulator (NEMO) gene and peculiar activation-induced cytidine d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel role for human neutrophilic granulocytes was recently described, showing that these cells, upon entering the spleen, can be reprogrammed into a distinct B cell-helper neutrophil phenotype that is capable of eliciting B cell responses such as immunoglobulin secretion, class switch recombination and somatic hypermutation. Using similar protocols, we detected a homogeneous population of CD15(high)CD16(high) neutrophils in fresh human spleen samples, which did not differ in phenotype and function from blood neutrophils. No phenotypic characteristics of costimulatory nature were detected on
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Naive B cells diversify via clonal expansion, immunoglobulin isotype switching, phenotypic variation and somatic hypermutation (SHM). Diversity in antigenic targets, functional classes and the production kinetics of antibodies affects immunity to malaria. Here we show that individual clones diversify over time during Plasmodium infection. During the first week, amid widespread bystander activation, isotype switching initiates soon after Myc upregulation and overlaps with clonal expansion, resulting in isotype variegation among clones. During the second week, expanded clones seeding germinal ce
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Activation-induced cytidine deaminase (AID) plays a key role in the induction of somatic hypermutation and class switching at the immunoglobulin loci of B lymphocytes. AID overexpression can induce a mutator phenotype in lymphoid and nonlymphoid cell lines, suggesting that AID by itself is sufficient to trigger hypermutation and class switching. AID expression in vivo is considered to be restricted to germinal center B lymphocytes, yet AID expression is also seen in many B cell lymphomas, hinting at a potential role for the development of these malignancies. We used a GFP-based reversion assay
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Broad activation of host T-cell immunity by immune checkpoint blockade, has revolutionized the treatment of some but not all B-cell lymphoproliferative disorders (LPDs). The challenge for next generation immunotherapeutics, is to successfully induce anti-tumor specific T-cell immunity across a range of B-LPDs, without provoking immune-related adverse events. An emerging strategy is to target neoantigens. Neoantigens are immunogenic peptides, unique to malignant cells, that are presented to T-cells via human leukocyte antigens. Neoantigens most commonly arise from non-synonymous mutations but c
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Hyper-immunoglobulin M syndromes (HIGM) are a heterogeneous group of genetic disorders resulting in defects of immunoglobulin class switch recombination (CSR), with or without defects of somatic hypermutation (SHM). They can be classified as defects of signalling through CD40 causing both a humoral immunodeficiency and a susceptibility to opportunistic infections, or intrinsic defects in B cells of the mechanism of CSR resulting in a pure humoral immunodeficiency. A HIGM picture can also be seen as part of generalized defects of DNA repair and in antibody deficiency syndromes, such as comm
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The analysis of immunoglobulin heavy chain variable (IGHV) region may disclose the influence of antigens in Burkitt's lymphomas (BL). IGHV sequences from 38 patients and 35 cell lines were analyzed. IGHV3 subset genes were the most used and IGHV4-34 gene was overrepresented. IGHV genes were mutated in 98.6% of the cases, 36% acquired potential glycosylation sites, and in 52% somatic-hypermutation-process was ongoing. Binding motifs for superantigens like Staphylococcal protein A and carbohydrate I/i were preserved in 89% of the cases. IGHV analysis of BL cells supports a germinal center origin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) has a heterogeneous biological behavior, which is highly influenced by its immunogenetic, epigenetic, and genomic properties. The remarkably variable clinical course of the disease has been associated with genetic features such as chromosomal abnormalities, the presence of either high or low numbers of somatic hypermutations (SHM) in the variable region of the immunoglobulin heavy chain locus (IGHV), and somatic mutations of several specific driver genes. Next-generation sequencing (NGS) technologies have provided a comprehensive characterization of the genom
ОбзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Common variable immunodeficiency (CVID) is a heterogeneous syndrome characterized by impaired immunoglobulin production and usually presents with a normal quantity of peripheral B cells. Most attempts aiming to classify these patients have mainly been focused on T- or B-cell phenotypes and their ability to produce protective antibodies, but it is still a major challenge to find a suitable classification that includes the clinical and immunologic heterogeneity of these patients.
OBJECTIVE: In this study we evaluated the late stages of B-cell differentiation in a heterogeneous popul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD5+ diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) has recently been identified as a subgroup with different clinical characteristics from CD5- DLBCL and as having a poorer outcome than CD5- DLBCL. Data regarding differences in gene alteration between CD5+ and CD5- DLBCL have accumulated. In this article, we report an analysis of the immunoglobulin heavy-chain gene variable region (VH) gene in 35 cases of CD5+ DLBCL and compare these cases with those with the germline of the VH gene (GL-VH) and those with a somatically hypermutated VH gene (HM-VH). When the CD5+ DLBCL cases were subdivided with a cuto
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Twenty-eight heavy-chain variable (VH1) region genes and the immunoglobulin (IgM) heavy-chain constant region of an isogenic Xenopus hybrid, X. laevis/X. gilli, LG7, have been sequenced. The LG7 clone represents the first Xenopus hybrid that is homozygous for the IgH locus. The VH1 family was specifically investigated because VH1 genes are used by the antibodies produced during the Xenopus antidinitrophenol (DNP) response, These VH1 germ-line sequences establish a so-called "dictionary" that is available for studying somatic hypermutational mechanisms in immunized frogs.
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent evidence suggests that complex karyotype (CK) defined by the presence of ≥3 chromosomal aberrations (structural and/or numerical) identified by using chromosome-banding analysis (CBA) may be relevant for treatment decision-making in chronic lymphocytic leukemia (CLL). However, many challenges toward the routine clinical application of CBA remain. In a retrospective study of 5290 patients with available CBA data, we explored both clinicobiological associations and the clinical impact of CK in CLL. We found that patients with ≥5 abnormalities, defined as high-CK, exhibit uniformly dismal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования