Expressed sequence tags (ESTs), are short cDNA sequences obtained from expressed genes in any plant tissue of Gossypium spp. and represent a suitable approach for studying the transcriptome in the absence of a reference genome. In this study, protocols for EST development were established to explore expressed genes in cotton under diverse biotic and abiotic stress conditions. ESTs were generated by using two approaches: suppression subtractive hybridization (SSH) and next-generation sequencing (NGS) techniques. The process begins with RNA isolation, followed by mRNA purification, cDNA synthesi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tissue culture-based propagation in sugarcane provides large-scale production of planting material; however, maintaining genetic stability and virus-free status is critical. Genetic fidelity assessment and virus indexing serve as key tools for quality control in micropropagated plants. This chapter discusses available molecular and diagnostic strategies for ensuring clonal uniformity and phytosanitary safety.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Averrhoa includes economically and nutritionally important fruit crops like Averrhoa carambola (star fruit) and Averrhoa bilimbi (bilimbi). However, it has not been studied enough genetically, even though it is important for horticulture. For germplasm conservation, cultivar identification, and crop improvement programs, it is important to be able to accurately measure genetic diversity. This chapter elucidates the optimization and utilization of random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers for the analysis of genetic diversity in Averrhoa species. We used a modified CTAB method t
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chapter reports an inexpensive, non-sequencing-based technique to develop microsatellite markers in pomegranate (Punica granatum). Microsatellites are also known as the polymorphic genetic markers that are usually used in genetic diversity, breeding, and population genetics. Even though next-generation sequencing (NGS) has quickly demonstrated speedy advancement in the development of markers, the given protocol provides a viable option in species with limited genomic information or in cases when sequencing is not a viable option. The strategy uses the enrichment strategy as a way of select
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Simple Sequence Repeat (SSR) marker-assisted selection has proven to be the most powerful tool for genetic monitoring and selection in in vitro culture systems. It is widely used in detecting somaclonal variation and producing true-to-type in vitro plantlets with superior quality. Genetic fidelity is the critical point in plant tissue culture, and SSR markers act as a supporter to pass this critical point through locus specificity, codominancy and high polymorphism. SSR markers allow the precise detection of genetic changes during callus formation, organogenesis, somatic embryogenesis, and lon
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipids are a fundamental group of biomolecules that play diverse roles in biological systems, including energy storage, membrane architecture, and intra- and extracellular signaling. They are classified into eight major categories, and more than 50 000 distinct lipid structures are currently reported in the Lipid Maps Structure Database (LMSD). Given their importance in cellular metabolism and physiology, accurate identification and quantification of lipids are essential. In ticks, lipid metabolism is closely associated with physiological processes related to survival, pathogen transmission, a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sesame (Sesamum indicum L.) is an important oilseed crop with considerable agronomic potential, widely cultivated across tropical and subtropical regions. Despite its substantial economic value, genomic research in sesame has progressed more slowly than in major staple crops. The advent of high-throughput single-nucleotide polymorphism (SNP) markers has markedly advanced sesame breeding by enabling the development of dense genetic linkage maps, genome-wide association studies (GWAS), and marker-assisted selection (MAS). This chapter presents detailed protocols for SNP discovery and validation
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter details a comprehensive, step-by-step RAPD protocol for assessing genetic diversity in 16 Iranian Echium amoenum ecotypes, a medicinal plant. The method uses STE (Sucrose-Tris-EDTA) buffer to extract DNA from leaf tissue, followed by spectrophotometric and electrophoretic quality control. PCR amplification with 20 decamer primers yields 248 polymorphic bands (80% polymorphism), separated by agarose gel electrophoresis. NTSYS-pc analysis, using the Dice coefficient, UPGMA clustering, and principal component analysis, reveals geographic-climatic groupings. This approach is applicabl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular characterization of genetically modified plants is commonly based on the detection of foreign DNA sequences introduced during transformation. While this strategy is effective for conventional transgenic plants, it becomes inadequate for cisgenic and intragenic plants in which the introduced gene originates from the host genome and is regulated by native promoter and terminator elements. Following segregation-based elimination of selectable marker cassettes, such cisgenic plants may become indistinguishable from wild-type plants using standard sequence-dependent PCR assays. This c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers have played a significant role in accelerating cotton (Gossypium spp.) improvement by enabling rapid genome-wide assessment of genetic variation without the requirement for prior sequence information. RAPD has been widely applied in cotton germplasm characterization, cultivar identification, hybrid confirmation, and the early development of molecular linkage maps. Its simplicity, low cost, and the ability to amplify multiple polymorphic loci in a single reaction made RAPD particularly valuable during the early phases of cotton molecular breeding.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular marker-based diversity assessment is essential for crop improvement strategies in faba bean (Vicia faba L.), a diploid grain legume with limited genomic resources relative to model species such as Medicago truncatula or major crops like soybean (Glycine max). ISSR markers provide a PCR-based, multilocus fingerprinting approach requiring no prior sequence information, making them particularly suitable for orphan crops. This protocol provides comprehensive, step-by-step procedures covering the complete analytical pipeline from genomic DNA isolation to statistical interpretation. This c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes a standardized experimental protocol to induce and analyze galactose-α-1,3-galactose (α-Gal)-specific IgE responses in α-Gal-deficient (α1,3-galactosyltransferase knockout) mice. The absence of endogenous α-Gal in this model enables controlled sensitization to exogenous α-Gal-containing antigens from microbial, arthropod, and mammalian sources. The protocol integrates sequential oral exposure to α-Gal-expressing Escherichia coli O86:B7, capsule-based infestation with Ixodes ricinus nymphs, oral administration of porcine tissue homogenate, and subcutaneous injection of ti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Animal experimentation is a fundamental tool in biomedical research for the study of diseases and the development of interventions such as drugs, vaccines, and probiotics for the treatment of human pathologies. Animal models enable analysis of pathophysiological processes in complex organisms with genetic and functional similarities to humans, which is essential for evaluating the safety and efficacy of new therapeutic interventions and surgical techniques before their clinical application. Among the most commonly used models are mice, rats, and fish, employed in the study of various diseases,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the development and design of cell-targeted nanoparticle-based systems, the density of targeting moieties plays a fundamental role in allowing maximal cell-specific interaction. Here, we describe the use of molecular recognition force spectroscopy as a valuable tool for the screening, characterization, and optimization of targeted nanoparticles toward attaining cell-specific interaction. By tailoring the density of targeting moieties at the nanoparticle surface, one can correlate the unbinding event probability between nanoparticles tethered to an atomic force microscopy tip and cells to th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atomic force microscopy (AFM) is a non-optical microscopy that enables the acquisition at the nanoscale level of a 3D topographical image of the sample. For 30 years, AFM has been a valuable tool in life sciences to study biological samples in the field of tissue, cellular and molecular imaging, mechanical properties, and force spectroscopy. Since the early beginnings of the technique, AFM has been extensively exploited as an imaging tool for structural studies of nucleic acids and nucleoprotein complexes. The morphometric analysis performed on the images can unveil specific structural and fun
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medical implants are frequently used to treat musculoskeletal and dental conditions, with titanium materials standing out for their high biocompatibility. Atomic force microscopy (AFM), as an imaging and force spectroscopy tool, has emerged as a valuable technique to investigate cell-implant interactions at the nanoscale level. Here, we describe different AFM-based methodologies for the structural and nanomechanical characterization of titanium-based materials to be used as implant scaffolds in tissue engineering. These new applied methodologies may help on validating the osteointegrative pote
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella motility plays an essential role in environmental survival and virulence, enabling cells to access nutrients, colonize host tissues, evade host immune responses, and persist in diverse environments. These movements, driven by peritrichous flagella, allow bacteria to swim through liquids and swarm across surfaces, making motility a valuable phenotypic indicator in microbiological characterization. This chapter describes quantitative protocols for assessing swimming and swarming motility on semisolid agar media. Procedures include media preparation, culture standardization, bacterial
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atomic force microscopy (AFM) is not only a high-resolution imaging technique but also a sensitive tool able to study biomechanical properties of biosamples (biomolecules, cells) in native conditions-i.e., in buffered solutions (culturing media) and stable temperature (mostly 37°C). Micromechanical transducers (cantilevers) are often used to map surface stiffness geometry, elastic, and contact parameters of living cells; however, they can also be used to monitor time course of dynamic forces (beating), their rate, and other biomechanical properties of cardiomyocyte contractility. Here we descr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study presents a structured narrative review of lower urinary tract (LUT) complications following prostate cancer (PCa) radiotherapy and proposes an organ-based clinical framework for their evaluation and management.
MATERIALS AND METHODS: A structured narrative review was conducted using PubMed/MEDLINE, Scopus, and Web of Science, including studies published between January 2000 and December 2025 and supplemented by seminal studies in radiation biology and reconstructive urology. Search terms included prostate cancer, radiotherapy, radiation cystitis, bladder dysfunction, ureth
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 3'→5' RNA helicase YTHDC2 is a posttranscriptional regulator of gene expression in reproductive cells, where it is essential for the progression of meiosis. But a detailed understanding of its molecular mechanism is currently lacking. Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing is a well-established method for transcriptome-wide identification of the positions of protein-RNA interactions and has played a critical role in studies of RNA-binding proteins. In this chapter, we present an optimized protocol for performing YTHDC2 CLIP in mouse testes to id
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.